FGF家族生物信息学分析及FGF9/16/20亚家族在罗非鱼性腺发育中的可能作用

发布时间：2020-12-07 22:40

　　成纤维细胞生长因子（Fibroblast Growth Factors, FGFs）是一类小型分泌多肽生长因子,被证明参与到各种各样重要的生物学进程中,如生长、发育、性别决定与分化、细胞分化、增殖、迁移、凋亡等。迄今为止,哺乳动物中己分离到的FGF成员有22个（FGF1-23,人类FGF19是小鼠FGF15的直系同源基因）,斑马鱼中有27个,而在其他物种还没有详细完整的报道。目前对FGF的功能特别是在性别决定与分化过程中作用的研究主要集中于哺乳动物,而鱼类中只有少量报道,为了研究FGF家族成员在鱼类性别决定与分化以及性腺发育过程中的潜在作用,我们从基因组水平以及转录组水平对新近完成基因组测序的尼罗罗非鱼的FGF家族成员进行了系统分析,并对FGF9/16/20亚家族在性腺发育中的可能作用进行了探讨。本研究通过同源搜索比对,结合基因组与转录组数据在尼罗罗非鱼中分离到了33个成员。其中7个（1b、FGF4b、FGF11b、FGF12b、FGF13b、FGF14b、FGF23b）为首次发现。根据分离到的尼罗罗非鱼FGF序列,还在三棘刺鱼、青鳉、红鳍东方鲀、黑青斑河豚以及新近完成基因组测序的另外... 

【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：79 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第1章 文献综述
    1、FGF家族成员
    2、FGF家族成员的结构
    3、FGF家族进化
    4、FGF家族基因功能
        4.1 FGF1/2亚家族
        4.2 FGF3/7/10/22亚家族
        4.3 FGF4/5/6亚家族
        4.4 FGF8/17/18亚家族
        4.5 FGF9/16/20亚家族
        4.6 FGF11/12/13/14亚家族
        4.7 FGF19/21/23亚家族
    5、本研究的立项依据和目的意义
第2章 尼罗罗非鱼FGF家族成员的分离及生物信息学分析
    1、前言
    2、材料与方法
        2.1 五种丽鱼科鱼类基因组本地BLAST数据库的构建
        2.2 尼罗罗非鱼FGF家族成员基因序列的分离
        2.3 尼罗罗非鱼FGF家族成员系统进化分析
        2.4 尼罗罗非鱼与人类FGF基因共线性分析
    3、实验结果
        3.1 尼罗罗非鱼FGF家族序列分析
        3.2 尼罗罗非鱼FGF家族系统进化分析
        3.3 尼罗罗非鱼FGF基因家族共线性分析
        3.4 尼罗罗非鱼FGF家族基因性腺转录组分析
    4、讨论
第3章 尼罗罗非鱼FGF9/16/20亚家族成员的分子克隆及功能的初步研究
    1、前言
    2、材料与方法
        2.1 实验动物
        2.2 试剂、耗材和仪器
        2.3 有关试剂的配制
        2.4 药物处理
        2.5 尼罗罗非鱼FGF16以及两个FGF20同源基因的克隆
        2.6 系统发生和共线性分析
        2.7 尼罗罗非鱼FGF16、FGF20a、FGF20b表达模式分析
        2.8 性腺发育过程中FGF16和FGF20b的表达以及性逆转对其表达的影响#41
        2.9 原位杂交（In situ hybridization,ISH）
    3、实验结果
        3.1 序列及系统发生分析
        3.2 共线性分析
        3.3 组织表达模式分析
        3.4 尼罗罗非鱼性腺发育过程中FGF16和FGF20b mRNA的表达
        3.5 药物处理诱导性逆转对FGF16和FGF20表达的影响
        3.6 FGF16和FGF20b在性腺表达的细胞类型
    4、讨论
结论
参考文献
致谢
在读期间所发表的文章
专利申请情况
在读期间参加科研情况



本文编号：2904007