用单分子磁镊研究大肠杆菌单链结合蛋白的结合性质

发布时间：2020-12-04 07:23

　　单链结合蛋白（Single-strand DNA binding protein,SSB）可以以很高的亲和力结合单链DNA（ssDNA）,并可以与许多DNA代谢相关蛋白发生相互作用,从而起到保护ssDNA产物不被降解,并介导代谢相关蛋白进入相应位置进行反应的功能。大肠杆菌单链结合蛋白（E-coli SSB）是单链结合蛋白中具有代表性的一种,它是一种同源四聚体,每个亚基都可以和ssDNA产生高度亲和力并结合。大肠杆菌SSB存在三种稳定的结合模式,分别结合65 nt ssDNA、56 nt ssDNA和35 nt ssDNA,分别在不同盐离子浓度下存在。许多研究者对大肠杆菌SSB这一现象进行了大量的研究,然而,其反应的具体过程以及相关反应系数仍然没有被全部揭示。因此,我们利用单分子动力学的方法,结合单分子磁镊进行拉力实验,观察SSB在拉力下的反应现象,发现在某个临界力下,SSB会发生跳变式结合/解离现象。我们对这个现象进行了长时间测量,得出其反应系数以及相应的自由能参数。我们通过对自由能的修正,还原了拉力为零时大肠杆菌SSB的结合过程,发现它是一个由快速地结合和缓慢地缠绕相组合的过程,表现... 

【文章来源】：中国科学院大学(中国科学院物理研究所)北京市

【文章页数】：98 页

【学位级别】：博士

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光镊装置示意图(2)

第1章 前言折射率介质的光，当入射角增大至某一阈值时，会发生全内反射。当射时，虽然光线全部反射，但在入射界面低折射率介质中会形成一个瞬逝场。瞬逝场从界面向低折射率介质内部传播距离极短，通常只有或更小，它的场强度存在以下关系(13)。( ) (0) exp( )zI z Id 2 2 21 24 sindn n I(z)为场强度，z 为垂直于入射表面的深度值，d 是穿透深度，由光

在使用中，一般会使用手柄分子一端连接顺磁性物质包裹的聚苯乙通过移动或旋转磁铁可以改变外磁实现对手柄分子的拉伸与扭转(25)。磁力的大小可以由下面公式描述xdBF mdx Bx/dx 为磁场梯度。在实验中，可以用 2BkTLF x 图 1.4 磁镊装置示意图(2)Fig 1.4 Diagram of magnetic tweeze


本文编号：2897219