基于模块距离与多源随机游走的药物重定位研究

发布时间：2017-11-23 20:13

  本文关键词：基于模块距离与多源随机游走的药物重定位研究

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【摘要】：药物重定位是指发现已经上市药物的新适应症,它对于目前新药研发难、成本高、周期长来说,无疑是一个非常有效的手段。药物重定位最主要的目的就是利用计算方法,并综合基因等生物数据去寻找潜在的药物-疾病相关性,可以利用文献挖掘、生物通路富集性分析等一系列手段来验证预测结果。目前,大多数药物重定位方法都是考虑所有的疾病,缺乏针对性,因而预测结果不够准确。基于以上原因,本文提出了两个研究方案:(1)首先,将研究的疾病对象缩小到只有癌症类疾病的范围。然后,基于复杂网络模块距离计算方法,预测出这些癌症疾病潜在的相关药物。最后,通过对预测结果分析发现整体的预测结果较为可靠,但是其文献挖掘与功能路径富集性分析不够理想,这可能与数据的不完整性有很大关系。基于此,本文提出了第二个研究方案。(2)首先,将疾病的研究对象确定为肝癌。接着,基于多元随机游走,计算与肝癌相关的基因集与其它药物相关基因集之间的相似性。然后,基于该相似性建立药物-药物相似性网络,选择与已知治疗肝癌的药物直接相连的药物,并对它们进行打分,分值越高说明该药物越有可能是治疗肝癌的潜在药物。最后,对分值较高的药物进行分析,发现无论是基于文献挖掘、病毒基因组数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)数据库验证,还是进行功能路径富集分析,预测结果的准确性与可靠性都很理想。进一步说明通过聚焦于一种疾病,并且利用改进后的随机游走算法更好地实现了药物重定位的目的,反映出针对性的研究对象和高效的计算方法是实现药物重定位的关键。
【学位授予单位】：西安电子科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：O157.5;R96

【参考文献】

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本文编号：1219673