计算机代数在生物化学中的应用

发布时间：2017-10-09 05:18

  本文关键词：计算机代数在生物化学中的应用

  更多相关文章： 计算机代数 Gr(o|¨ )bner基 吴消元法 生物化学 酶动力学

【摘要】：计算机代数理论是计算机技术和数学相结合的一门新兴学科。计算机代数理论涉及了所有的数学领域。由于计算机代数可以完成需要大量人力才能完成的运算,计算机代数理论已被应用于绝大多数科学研究和工程领域。基于计算机代数理论,本文对生物化学逆向工程中的离散模型和酶动力学模型进行了详细的研究,主要结果如下：1、基于计算机代数中的Grobner基理论,在生物信息学逆向工程中通过构建插值多项式来建立离散模型。该方法基于BM算法中加入中国剩余定理得到的BMM算法,使得模型可以应用于有理数域并且避免中间表达式膨胀。2、基于计算机代数中的吴消元法和动力系统定性理论对酶动力学系统进行了研究。本文先后研究了最简单的酶动力学系统,不稳定的酶动力学系统和另一类不稳定的酶动力学系统,均得到了系统的解析解,并且通过具体实验验证了本文所提出理论的正确性和算法的有效性。
【关键词】：计算机代数 Gr(o|¨ )bner基 吴消元法 生物化学 酶动力学
【学位授予单位】：北京化工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：O15
【目录】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-12
• 第一章 绪论12-22
• 1.1 符号计算12-14
• 1.1.1 Grobner基13-14
• 1.1.2 数学机械化和吴消元法14
• 1.2 生物化学14-15
• 1.3 酶动力学15-22
• 1.3.1 一般原理15-16
• 1.3.2 酶的测定16-17
• 1.3.3 单底物反应17-21
• 1.3.3.1 米氏动力学17-19
• 1.3.3.2 米氏方程的推导过程19-20
• 1.3.3.3 动力学常数的现实意义20-21
• 1.3.4 化学机制21-22
• 第二章 预备知识22-31
• 2.1 抽象代数基本知识22-25
• 2.2 多项式的约化25-26
• 2.3 Grobner基算法26-28
• 2.4 吴消元法28-31
• 第三章 基于计算机代数的逆向工程离散模型研究31-39
• 3.1 Buchberger-Moller算法的模算法31-33
• 3.2 算法的准确性验证33-34
• 3.3 时间序列的多项式模型34-39
• 第四章 最简单的酶促系统动力学研究39-47
• 4.1 最简单的酶动力学模型分析39-42
• 4.2 总结42-47
• 第五章 最简单的不稳定酶动力学分析47-55
• 5.1 方法47-52
• 5.2 结果和讨论52-55
• 第六章 一般的不稳定酶动力学分析55-63
• 6.1 方法55-60
• 6.2 结论60-63
• 第七章 结论63-65
• 参考文献65-69
• 附录69-80
• 致谢80-82
• 研究成果及发表的学术论文82-84
• 作者和导师简介84-85
• 硕士研究生学位论文答辩委员会决议书85-86

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 吴文俊;关于代数方程组的零点——Ritt原理的一个应用[J];科学通报;1985年12期

，

本文编号：998353