烟蚜茧蜂滞育关联基因表达及肌钙蛋白C基因的克隆
发布时间：2021-10-13 07:05
烟蚜茧蜂Aphidius gifuensis Ashmead是一种优良的内寄生性天敌昆虫,可有效控制桃蚜等多种蚜虫危害。但在实际生产应用中,存在生产周期长、贮存时间短、供求脱节等问题,使得天敌产品难以在害虫爆发时发挥最大作用。滞育能通过特定基因表达模式为昆虫提供可选择性的发育途径,使滞育个体产生营养物质积累、新陈代谢抑制、生长发育减缓或停滞等表型,还可提高其对低温、干旱等逆境抗性。这一特性在烟蚜茧蜂扩繁应用中具有重要作用,不仅能提升子代烟蚜茧蜂的适应能力和寄生能力,而且能显著延长天敌产品的货架期,促进烟蚜茧蜂的大规模扩繁和应用。近年来,烟蚜茧蜂滞育的环境调控、生理生化机制等已有深入研究,但其滞育的分子调控机制尚不明确。基于此,本研究以烟蚜茧蜂为研究对象,测定了正常发育、滞育和滞育解除个体的转录组全序列,改进了以往仅对正常组和处理组进行分析的常规做法;分析比较了三组测序结果,获得大量差异表达基因,筛选出了仅在滞育期间特异表达的滞育关联基因;测定了9个候选基因的相对表达量,进一步验证了测序结果的可靠性;克隆了滞育关联基因肌钙蛋白C基因全长cDNA序列,并对其序列进行了全面的生物信息学分析,...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：87 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
文库构建流程图
图 2.2 unigene 长度分布Figure 2.2 The length distribution of unigenes2.2.4 基因功能注释及分析2.2.4.1 unigene E-value 分布将 unigene 序列与 UniProt 和 Nr 数据库进行比对，共获取 unigene 47,077 个，其中 61.4%得到注（表 2.4）。经过 E-value＜1e-5 的筛选，获得 24,431 个可读序列，获得同源序列在 1e-50以下的占 65.52% (图 2.3)。表 2.4 unigene 注释情况Table 2.4 Annotation of unigene数目类型 数值数据库比对注释注释总数 24,839 个Nr 注释数目 24,475 个
图 2.3 E 值分布Figure 2.3 The distribution of E-value2.2.4.2 unigene 物种归类由于烟蚜茧蜂基因组未知，unigene 序列校准只能通过比对其他已测基因组的物种。结果显示，unigene 序列比对结果与意大利蜜蜂同源性最高，共有 4486 个序列，占比约 19.03%，其次是蝇蛹金小蜂 4486 个序列（占比约 18.36%），行军蚁 2589 个序列（占比约 10.6%），印度跳蚁 2314 个序列（占比约 9.47%）；弓背蚁 2044 个序列（占比约 8.37%）等（表 2.5）。表 2.5 unigene 物种归类Table 2 .5 Classification species of unigene拉丁学名Latin name种名Specific nameunigene 数量Number of unigeneApis mellifera 意大利蜜蜂 4649Nasonia vitripennis 蝇蛹金小蜂 4486Cerapachys biroi 行军蚁 2589Harpegnathos saltator 印度跳蚁 2314
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于iTRAQ技术筛选肝癌转移相关差异蛋白[J]. 宋琳岚,杨敏,蒋小燕,陈瑜,汤慧,颜亮,廖勇. 重庆医科大学学报. 2016(10)
[2]滞育昆虫营养物质的积累、转化与调控[J]. 任小云,齐晓阳,安涛,韩艳华,陈红印,张礼生. 应用昆虫学报. 2016(04)
[3]人心肌肌钙蛋白在临床应用中的研究进展[J]. 李磊,刘路路,惠岗,齐超,王珺楠. 中国实验诊断学. 2016(05)
[4]葱蝇热激蛋白DaHSP23基因的克隆及在冬滞育和夏滞育蛹中的表达分析（英文）[J]. 司风玲,何正波,陈斌. 昆虫学报. 2016(04)
[5]七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析[J]. 齐晓阳,任小云,安涛,陈红印,黄建,张礼生. 环境昆虫学报. 2016(02)
[6]基于转录组的葱蝇表皮蛋白基因家族的鉴定及在非滞育和冬滞育条件下的表达分析[J]. 付丹影,司风玲,陈斌,徐燕玲,郝友进. 昆虫学报. 2016(02)
[7]烟蚜茧蜂脂代谢相关的滞育相关蛋白差异表达分析[J]. 黄凤霞,蒋莎,任小云,安涛,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2015(06)
[8]我国寄生蜂调控寄主生理的研究进展[J]. 时敏,陈学新. 中国生物防治学报. 2015(05)
[9]心肌肌钙蛋白在临床应用中的应用[J]. 傅明晖. 生物技术世界. 2015(03)
[10]松墨天牛肌钙蛋白T基因全长cDNA克隆及分析[J]. 吴华俊,许雯,林同. 福建农林大学学报(自然科学版). 2015(01)
博士论文
[1]滞育麦红吸浆虫的化学物质变化与分子机理研究[D]. 王洪亮.西北农林科技大学 2007
[2]麦红吸浆虫滞育与化学物质变化研究[D]. 仵均祥.西北农林科技大学 2002
硕士论文
[1]烟蚜茧蜂滞育诱导的温光周期反应及滞育生理研究[D]. 李玉艳.中国农业科学院 2011
[2]野桑蚕肌原纤维钙结合蛋白及相关蛋白的基因分析[D]. 许西奎.苏州大学 2009
本文编号：3434185
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：87 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
文库构建流程图
图 2.2 unigene 长度分布Figure 2.2 The length distribution of unigenes2.2.4 基因功能注释及分析2.2.4.1 unigene E-value 分布将 unigene 序列与 UniProt 和 Nr 数据库进行比对，共获取 unigene 47,077 个，其中 61.4%得到注（表 2.4）。经过 E-value＜1e-5 的筛选，获得 24,431 个可读序列，获得同源序列在 1e-50以下的占 65.52% (图 2.3)。表 2.4 unigene 注释情况Table 2.4 Annotation of unigene数目类型 数值数据库比对注释注释总数 24,839 个Nr 注释数目 24,475 个
图 2.3 E 值分布Figure 2.3 The distribution of E-value2.2.4.2 unigene 物种归类由于烟蚜茧蜂基因组未知，unigene 序列校准只能通过比对其他已测基因组的物种。结果显示，unigene 序列比对结果与意大利蜜蜂同源性最高，共有 4486 个序列，占比约 19.03%，其次是蝇蛹金小蜂 4486 个序列（占比约 18.36%），行军蚁 2589 个序列（占比约 10.6%），印度跳蚁 2314 个序列（占比约 9.47%）；弓背蚁 2044 个序列（占比约 8.37%）等（表 2.5）。表 2.5 unigene 物种归类Table 2 .5 Classification species of unigene拉丁学名Latin name种名Specific nameunigene 数量Number of unigeneApis mellifera 意大利蜜蜂 4649Nasonia vitripennis 蝇蛹金小蜂 4486Cerapachys biroi 行军蚁 2589Harpegnathos saltator 印度跳蚁 2314
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于iTRAQ技术筛选肝癌转移相关差异蛋白[J]. 宋琳岚,杨敏,蒋小燕,陈瑜,汤慧,颜亮,廖勇. 重庆医科大学学报. 2016(10)
[2]滞育昆虫营养物质的积累、转化与调控[J]. 任小云,齐晓阳,安涛,韩艳华,陈红印,张礼生. 应用昆虫学报. 2016(04)
[3]人心肌肌钙蛋白在临床应用中的研究进展[J]. 李磊,刘路路,惠岗,齐超,王珺楠. 中国实验诊断学. 2016(05)
[4]葱蝇热激蛋白DaHSP23基因的克隆及在冬滞育和夏滞育蛹中的表达分析（英文）[J]. 司风玲,何正波,陈斌. 昆虫学报. 2016(04)
[5]七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析[J]. 齐晓阳,任小云,安涛,陈红印,黄建,张礼生. 环境昆虫学报. 2016(02)
[6]基于转录组的葱蝇表皮蛋白基因家族的鉴定及在非滞育和冬滞育条件下的表达分析[J]. 付丹影,司风玲,陈斌,徐燕玲,郝友进. 昆虫学报. 2016(02)
[7]烟蚜茧蜂脂代谢相关的滞育相关蛋白差异表达分析[J]. 黄凤霞,蒋莎,任小云,安涛,陈红印,张礼生. 中国生物防治学报. 2015(06)
[8]我国寄生蜂调控寄主生理的研究进展[J]. 时敏,陈学新. 中国生物防治学报. 2015(05)
[9]心肌肌钙蛋白在临床应用中的应用[J]. 傅明晖. 生物技术世界. 2015(03)
[10]松墨天牛肌钙蛋白T基因全长cDNA克隆及分析[J]. 吴华俊,许雯,林同. 福建农林大学学报(自然科学版). 2015(01)
博士论文
[1]滞育麦红吸浆虫的化学物质变化与分子机理研究[D]. 王洪亮.西北农林科技大学 2007
[2]麦红吸浆虫滞育与化学物质变化研究[D]. 仵均祥.西北农林科技大学 2002
硕士论文
[1]烟蚜茧蜂滞育诱导的温光周期反应及滞育生理研究[D]. 李玉艳.中国农业科学院 2011
[2]野桑蚕肌原纤维钙结合蛋白及相关蛋白的基因分析[D]. 许西奎.苏州大学 2009
本文编号：3434185
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