菜心不同抗性品种响应炭疽病菌侵染的转录组研究

发布时间：2021-10-27 13:42

　　菜心是我国重要的叶菜类蔬菜,其栽培面积广,经济效益好,在华南地区蔬菜的周年均衡供应与出口创汇方面起着重要的作用。炭疽病是菜心生产过程重要的病害,其致病病原菌为希金斯炭疽菌,华南地区高温高湿的气候环境有利于该病原菌的繁殖和传播,严重时导致产量损失30%⁴0%。因此,深入研究菜心与炭疽病菌的互作过程,探讨可能的抗病机制,发掘潜在的抗病基因,对菜心炭疽病的科学防治以及抗病相关分子育种有着重要的意义。本研究在对41个菜心品种进行抗病性鉴定的基础上,筛选出抗病和感病的菜心品种,并通过RNA-seq技术分析比较抗病与感病品种受希金斯炭疽菌侵染前后的转录组数据。主要研究结论如下:1、对3⁴叶期的菜心叶片进行人工喷雾接种希金斯炭疽菌,根据不同温度采用不同的接种浓度和接种后保湿时间能够显著区分不同菜心的抗病性。供试的41个菜心品种接种希金斯炭疽菌后的病情指数在35.045⁶4.643之间,没有发现高抗病的品种,也没有发现高感病品种,只有中抗病品种和感病品种,其中中抗病品种33个,感病品种8个。根据对41个品种的病原菌接种以及病情指数调查和... 

【文章来源】：华南农业大学广东省

【文章页数】：98 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 菜心炭疽病及其研究进展
    1.2 植物抗病机制
        1.2.1 植物基础防御反应
        1.2.2 植物诱导防御反应
    1.3 植物抗病基因
    1.4 植物防御相关基因
    1.5 植物抗病相关转录因子
    1.6 植物炭疽病研究进展
    1.7 转录组测序（RNA-seq）技术在植物病原互作机制研究中的应用
    1.8 本课题的研究内容、目的和意义
2 材料与方法
    2.1 供试品种
    2.2 病原菌培养
    2.3 病原菌接种
    2.4 菜心品种抗性鉴定
        2.4.1 病情分级
        2.4.2 病情指数
        2.4.3 抗性评价标准
    2.5 菜心不同抗性品种应答炭疽病菌侵染的转录组分析
        2.5.1 总RNA的提取及质检
        2.5.2 文库构建、检测及上机
        2.5.3 原始数据处理
        2.5.4 测序数据质量评估
        2.5.5 参考序列的比对
        2.5.6 基因表达水平统计
        2.5.7 基因差异表达分析
        2.5.8 差异表达基因GO富集性分析
        2.5.9 差异表达基因KEGG pathway富集性分析
    2.6 实时荧光定量PCR（qRT-PCR）验证分析
3 结果与分析
    3.1 不同菜心品种的抗病性鉴定
    3.2 RNA测序质量的评估
        3.2.1 测序reads的评估
        3.2.2 RNA-seq相关性检验
        3.2.3 参考基因组比对统计
        3.2.4 基因表达结果统计
    3.3 差异表达基因的筛选
    3.4 差异表达基因的GO功能显著性分析
    3.5 差异表达基因的KEGG pathway富集分析
    3.6 抗病相关差异表达基因表达情况分析
        3.6.1 抗病基因
        3.6.2 病程相关蛋白
        3.6.3 抗病相关转录因子
        3.6.4 细胞壁相关蛋白
        3.6.5 植物激素信号转导相关蛋白
        3.6.6 其他抗病相关蛋白
    3.7 实时荧光定量（qRT-PCR）验证
4 讨论
    4.1 菜心品种资源的炭疽病抗性鉴定分析
    4.2 转录因子对菜心炭疽病抗性的影响
    4.3 植物激素对菜心炭疽病抗性的影响
    4.4 ROS对菜心炭疽病抗性的影响
    4.5 其它因子对菜心炭疽病抗性的影响
5 全文结论
致谢
参考文献
附录


【参考文献】：
期刊论文
[1]pHBA对菜心炭疽病的诱导抗性及植株生理特性的影响[J]. 康云艳,周小萌,杨暹,林洁.  植物病理学报. 2014(04)
[2]钾营养对接种炭疽病菜薹(菜心)细胞保护酶系统的影响[J]. 郭巨先,刘玉涛,杨暹.  中国农学通报. 2014(22)
[3]菜心主要病虫害防治技术[J]. 王迪轩.  农药市场信息. 2013(24)
[4]钾营养对菜薹(菜心)炭疽病发生和植株防御酶活性的影响[J]. 郭巨先,刘玉涛,杨暹.  中国蔬菜. 2012(14)
[5]菜心炭疽病研究进展[J]. 卢博彬,杨暹.  长江蔬菜. 2009(24)
[6]菜心炭疽病菌拮抗细菌的筛选及鉴定[J]. 况福元,吴小丽,吕风青,曾大兴,涂国全.  微生物学通报. 2009(09)
[7]硅对菜薹炭疽病防御反应中信号物质的影响[J]. 杨暹,杨跃生,冯红贤.  园艺学报. 2008(06)
[8]硅对菜心炭疽病发生、菜薹形成及硅吸收沉积的影响[J]. 杨暹,冯红贤,杨跃生.  应用生态学报. 2008(05)
[9]菜心内生细菌CX-PA的鉴定及生防作用[J]. 李静,陈维信,刘爱媛,冯淑杰,肖晶.  中国生物防治. 2007(04)
[10]氮营养对菜心炭疽病抗性生理的影响 Ⅱ.氮营养对菜心炭疽病及膜脂过氧化作用的影响[J]. 陈晓燕,杨暹,张璐璐.  华南农业大学学报. 2004(03)

博士论文
[1]柑橘褐斑病菌比较基因组和转录组分析及柑橘绿霉病菌产孢中心调控途径和高渗甘油途径的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大学 2016
[2]哈密瓜响应青霉菌侵染的转录组和蛋白组研究及相关抗性酶变化分析[D]. 单春会.江南大学 2015
[3]柑橘溃疡病防御相关基因的鉴定及功能分析[D]. 严佳文.湖南农业大学 2014
[4]玉米抗细菌性褐斑病候选基因的克隆与鉴定及NIL的转录组分析[D]. 吴晓军.中国农业大学 2014
[5]JAZ2和JAZ7调控茉莉酸介导的转录与代谢重编程的机理研究[D]. 闫会转.浙江大学 2014
[6]基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜抗、感菌核病分子机理分析[D]. 张秋平.湖南农业大学 2014
[7]黄瓜霜霉病抗病基因鉴定及其表达分析[D]. 刘大军.东北农业大学 2013

硕士论文
[1]日本结缕草响应立枯丝核菌侵染及其转录组学研究[D]. 殷萍萍.北京林业大学 2015



本文编号：3461720