水稻染色体片段代换系的构建与种子耐储藏QTL定位

发布时间：2020-06-16 17:43

【摘要】：水稻是我国主要的粮食作物。水稻种子储藏是农业生产的战略需要。种子的长时间储藏往往引起活力的下降。种子的耐储藏特性受遗传控制,是一个复杂的遗传性状。染色体代换系是研究复杂性状遗传的理想群体。本研究以秀水134和扬稻6号为亲本,构建互为轮回亲本的染色体片段代换系;并以染色体代换系(以秀水134为轮回亲本)为材料,在未老化和老化处理下,以种子电导率和发芽率、发芽势、发芽指数、平均发芽天数为指标,进行QTL检测。得到结果如下:以秀水134为轮回亲本的染色体片段代换系包含53个株系,其供体片段长度在7.4-182.15cM,占全基因组0.49%-12.15%,供体片段导入率平均值为5.0%;这套代换系的供体片段总长度为1995cM,覆盖水稻基因组的1.33倍。以扬稻6号为轮回亲本的染色体片段代换系包含46个株系,其供体片段长度在11.3-243.6cM,占全基因组0.78%-16.8%,供体片段导入率平均值为5.5%;这套代换系的供体片段总长度为1956.8M,覆盖水稻基因组的1.3倍。以秀水134为轮回亲本的染色体片段代换系共选取233个株系进行种子老化处理,老化后,电导率、发芽率、发芽势、发芽指数都表现为降低,平均发芽天数表现为增加。未老化和老化处理下,都表现为电导率与平均发芽天数呈正相关,与发芽率、发芽指数、发芽势呈负相关;发芽率、发芽势、发芽指数三者呈正相关性。未老化处理条件下,共检测出30个与电导率、发芽率、发芽势、发芽指数、平均发芽天数有关的QTL,其中qTDS1-1-3是控制电导率的主效QTL,相对效应为22.7%,贡献率为8.9%;qGP1-9-1是控制发芽率的主效QTL,相对效应为5.2%,贡献率为6.6%;qGM1-9-1是控制发芽势的主效QTL,相对效应为7.8%,贡献率为7.6%;qMGT1-2-3是控制平均发芽天数的主效QTL,相对效应为11.2%,贡献率为13.6%;qGI1-9-1是控制发芽指数的主效QTL,相对效应为10.1%,贡献率为5.8%。老化处理条件下,共检测出9个与电导率、平均发芽天数有关的QTL,其中qTDS2-1-2是控制电导率的主效QTL,相对效应为24.2%,贡献率为19.3%;qMGT2-5-1是控制平均发芽天数的主效QTL,相对效应为-23.1%,贡献率为6.4%。未老化和老化处理条件下,在1号染色体上的S1-505、RM8105、RM259,8号染色体上的RM5545,9号染色体上的RM5535、RM6797标记附近均检测出控制电导率的QTL。
【学位授予单位】：浙江农林大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S511
【图文】：

遗传连锁图谱,分子标记连锁图谱

3 结果与分析3 结果与分析3.1 SSR 分子标记连锁图谱的构建共检测了 629 对引物，筛选到秀水 134 和扬稻 6 号两个亲本间有多态的引物 263对，亲本间多态性比例为 41.8%。选择 PCR 扩增条带分辨清晰且均匀覆盖水稻 12 条染色体的 95 对多态性分子标记，构建遗传连锁图谱，见图 3.1。

载荷图,主成分分析,指数,老化指数

发芽率 -0.07 0.21 -0.256 芽指数 0.131 0.954 0.149 发芽势 0.164 0.939 0.141 发芽天数 -0.059 -0.894 -0.255 导率 -0.191 -0.261 0.921 芽率 0.97 0.057 0.001 芽指数 0.983 0.016 0.005 芽势 0.939 -0.006 0.005 发芽天数 -0.775 0.057 -0.192 化指数 -0.117 0.101 0.605 化指数 0.971 -0.016 0.004 老化指数 0.968 -0.104 -0.01 化指数 0.939 -0.103 -0.005 数老化指数 -0.745 0.289 -0.13

【参考文献】