亚麻高密度遗传连锁图谱的构建和纤维相关性状QTLs分析

发布时间：2020-06-27 11:18

【摘要】：亚麻(LinumusitatissimumL.)是我国重要的经济作物,播种面积居世界首位。亚麻育种的主要目标是培育高产优质和抗病性强的新品种,利用分子标记辅助选择育种可以更准确的选择目标性状,缩短选择周期,提高育种效率。分子标记技术在亚麻种质资源分类、系统演化、遗传图谱构建、抗病基因鉴定及分离克隆研究方面已经有较多应用。但可用于亚麻育种的特异性分子标记还较少,不能满足人们的需要。开发亚麻分子标记、构建高密度亚麻遗传连锁图谱、完善亚麻基因组序列组装、定位亚麻纤维相关性状可为亚麻目标性状的精细定位、优良基因克隆及分子标记育种奠定研究基础。本论文以亚麻分子标记辅助选择育种为目标开展研究,取得如下进展:1.用简化基因组测序技术开发出亚麻特异性SSR序列1576条,利用其中62个SSR标记可将48个亚麻供试材料分为油用型和纤维型亚麻2大类。2.优化了亚麻SSR、SRAP分子标记技术体系。利用优化体系分别从100对SSR引物和88对SRAP引物中筛选出24对SSR多态性引物和32对SRAP多态性引物,用于亚麻遗传连锁图谱的构建。3.以纤用亚麻栽培种“DIANE”和油用亚麻栽培种“宁亚17”为亲本配制杂交组合,构建F2代分离群体。利用SSR标记和SRAP标记构建了亚麻初级遗传连锁图谱,该图谱含有12个连锁群,图距总长度为546.5cM,总标记95个,其中24个为SSR标记,71个为SRAP标记。在构建初级遗传连锁图谱基础上,利用高通量测序技术检测SLAF多态性标记,构建高密度遗传连锁图谱。该图谱包含15个连锁群,图距总长度为1483.25 cM,总标记2339个,是目前密度最高的亚麻遗传连锁图谱。4.基于亚麻基因组信息,结合高密度遗传连锁图谱,构建全基因组scaffold辅助染色体组装图谱,1321条scaffold挂载于亚麻15条染色体,组装信息占亚麻全基因组的11.6%,准确地排序和确定方向的scaffold占组装信息的26.27%。5.基于亚麻高密度分子标记遗传连锁图谱,检测出10个控制亚麻株高、工艺长度、种子产量、原茎产量、纤维产量及纤维含量的QTLs。利用分子标记将上述10个QTLs定位于基因组scaffold物理片段。
【学位授予单位】：东北林业大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S563.2
【图文】：

亚麻,蒴果

用型、油用型和油纤兼用型亚麻。亚麻属有１００多个种，既有一年生亚麻，也有多年生逡逑亚麻。多年生亚麻多为野生种，主要分布在热带和温带地区。亚麻属中有１５个栽培种，逡逑栽培亚麻属于一年生作物。亚麻全植株由根、茎、叶、花、蒴果５部分组成（图１－１）。逡逑ｍ逦ｆ逦＾逡逑＊．逦§逡逑：逡逑＇ｖ邋擎ｒ邋—邋１逡逑％逡逑＊邋ｉ．逡逑图１－１亚麻（１．根２．茎３．叶４．花５．蒴果）逡逑Ｆｉｇｕｒｅ邋１－１邋Ｆｌａｘ邋ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ邋（Ｉ．Ｒｏｏｔ邋２．邋Ｓｔｅｍ邋３．邋Ｌｅａｆ邋４．邋Ｆｌｏｗｅｒ邋５．邋Ｃａｐｓｕｌｅ）逡逑中国有５０００多年的亚麻栽培历史［１］。全国每年亚麻的播种面积约１００万ｈｍ２，分布于逡逑全国１５个省和自治区（图１－２），居世界第一位。其中，纤用亚麻约１７万ｈｍ２，主要分布逡逑在中国东北地区，黑龙江省种植总面积和总产均占全国的８０％以上，其次是新疆和云南逡逑等地，小部分分布于湖南、内蒙古等地；油用亚麻的全国播种面积近８３万ｈｍ２，主要集逡逑中分布在甘肃、内蒙古、新疆及青海等省和自治区。随着生活水平提高，人们对亚麻纤逡逑维制品的质量和数量需求不断提高。目前，纤用亚麻种植面积有继续扩大的趋势，麻农逡逑种植亚麻的经济效益逐渐显现，部分粮食作物主产区逐渐出现经济作物多元化种植的趋逡逑势

亚麻,主要种,灰色区域,省份

【参考文献】