亚麻表型性状与SSR标记的关联分析

发布时间：2020-07-16 12:24

【摘要】：本研究对230份亚麻材料进行农艺和品质性状表型鉴定,通过表型数据的统计学分析,探索农艺和品质性状的相关性;同时利用SSR标记技术进行基因扫描,将亚麻表型性状与SSR标记进行关联分析,获得与目标性状显著关联SSR位点。获得以下研究结果:1.230份亚麻材料的8个农艺性状的变异系数为2.79-25.10,遗传多样性指数为2.48-2.81;6个品质性状的变异系数为7.39-22.67,遗传多样性指数为2.66-2.80。相关性分析显示8个农艺性状中工艺长度与株高的相关性最大,数值高达0.825;6个品质性状中粗脂肪与亚麻酸的相关性最大,数值为0.669。2.30对SSR引物对230分亚麻材料共扩增出365个SSR位点,平均每对引物扩增出12.17个SSR位点;有效等位基因数为1.2168-1.8320,引物PIC为0.2489-0.6257。3.230份亚麻材料的相似系数为0.655-0.912,在遗传相似系数为0.66处可以将230份亚麻材料分为5个种群。种群1包含54份亚麻材料,种群2只有3份材料,种群3中包含58份材料,种群4共67份材料,种群5包含48份材料。4.群体结构分析显示当K=4时可将230份亚麻材料可分为4个种群,种群1和种群3都包括57个材料,种群2包含60个材料,种群4包含56个材料,说明亚麻遗传背景丰富,群体构建合理,可以进行后续的关联分析。5.8个农艺性状与SSR标记的关联分析,得到了114个多态性位点,其中与千粒重和果粒数显著关联的SSR位点最多,都是30个,表型变异解释率为2.62%-7.78%;6个品质性状与SSR标记的关联分析,得到了83个多态性位点,其中与硬脂酸显著关联的SSR位点最多(18个),表型变异解释率为1.01%-8.62%。
【学位授予单位】：内蒙古大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S563.2
【图文】：

内蒙古大学学位论文3.2 SSR 分子标记的遗传多样性分析用 254 对 SSR 引物在“坝亚 15 号”、“NORTHDAK518”、“Hungary 150”、“”、“PAKISTAN177”、“AC MCDUFF”、“山丹白”、“15-512 莎车亚麻”麻材料之间进行初步引物筛选，需筛选出条带清晰、多态性好的引物（图 3.1）。 43 对多态性较好的引物，再将这 43 对引物在 30 份亚麻材料中进行二次筛选，总0 对多态性较好，扩增条带较稳定的引物。30 对 SSR 引物对 230 份亚麻材料一共扩条条带，平均每对引物扩增出 12.17 条条带（见表 3.5）。30 对引物有效等位基因68-1.8320,平均有效等位基因数为 1.4432，引物多态性含量为 0.2489-0.6257,平79，PIC 值最大的 SSR 引物是 Lua37，最小的是引物 Lua69。说明这 30 对引物有较性，能提供丰富的遗传多样性信息。

内蒙古大学学位论文3.3 230 份亚麻材料的相似性分析和聚类分析230 份亚麻材料的相似性分析30 份亚麻材料间的相似系数分布频率如图 3.2 所示，相似系数为 0.655-0.912，数 0.786，相似系数主要集中在 0.70-0.86 之间，频率为 96.52%。230 份材料中 Hu坝亚 15 号相似系数最小，是 0.655，Hungary 140 亚麻种子来自匈牙利，坝亚 15自中国河北，说明这两个材料的亲缘关系较远。相似系数最大的是来自荷SBR105 和 CFRESBR103，为 0.912，说明这两份亚麻种质资源亲缘关系较近。2料经过 NTSYS 软件聚类分析后可分为 5 个群体（见表 3.6）。

30份亚麻材料的进化树图

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本文编号：2757997