中棉所70 RIL群体高密度遗传图谱构建及纤维品质QTL定位
发布时间：2020-12-04 14:49
棉花是我国的重要经济作物之一,棉花的纤维品质直接影响棉纺织品质量。随着工业技术的发展和人们生活水平的逐步提高,培育高纤维品质的棉花受到了极大的关注。本研究利用SSR分子标记技术和棉花80K SNP芯片技术,以连续自交的抗虫品种sGK156和优质系非抗虫材料901-001为亲本构建的RIL群体为试验材料,构建高密度遗传连锁图谱,并用WinQTLCart2.5的复合区间作图法定位出与纤维品质相关的QTL,这为分子标记辅助育种奠定了基础。利用RIL群体在2015年和2016年的两年9个环境的纤维品质数据,分析发现各纤维品质性状均呈正态分布,符合品质性状受微效多基因遗传控制的特点。分析各性状间相关性,得出纤维长度与纤维伸长率、纤维强度和整齐度极显著正相关,纤维长度与马克隆值极显著负相关;纤维伸长率与纤维强度和整齐度极显著正相关,纤维伸长率与马克隆值不相关;纤维强度与马克隆值极显著负相关,纤维强度与整齐度极显著正相关;马克隆值与整齐度不相关。本试验选取了从14,280对SSR引物中筛选到的在F2群体中具有多态性的267对SSR引物,进一步筛选131对多态性引物。用这些引物通...
【文章来源】：河南大学河南省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
遗传连所图
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遗传图谱中物理距离与遗传距离共线性分析对 SSR 标记利用 Blast 进行序列比对得出的物理距离，对 SNP 标记利用 Bowtie 进行序列比对并结合南京农业大学陆地棉参考基因组序列信息得到物理距离，然后采用CIRCOS0.66 作图软件分别对棉花 A 亚组和棉花 D 亚组每个标记的遗传距离与物理距离进行共线性分析，发现遗传图谱上的绝大多数位点与它们相应的物理位置一致，这表明遗传图谱的高质量，分析结果见如图 3-3。（b）（a）
【参考文献】：
期刊论文
[1]杂交棉中棉所70后代分离群体产量品质的表型变异分析[J]. 叶祯维,邓晓英,石玉真,李俊文,刘爱英,龚举武,巩万奎,商海红,陈婷婷,葛群,王艳玲,吴玉香,刘志,袁有禄. 棉花学报. 2016(01)
[2]普通小麦农大3338×京冬6号DH系群体株高及节间长度的QTL分析[J]. 逯腊虎,魏强,王飞,刘刚,秦丹丹,关攀锋,倪中福,姚颖垠,孙其信,彭惠茹. 中国农业大学学报. 2014(01)
[3]中棉所70生育特性及适宜种植方式分析[J]. 杨长琴,张培通,袁有禄,刘瑞显,龚举武,商海红,李俊文,石玉真. 江苏农业科学. 2012(07)
[4]棉花分子育种进展与展望[J]. 李付广,袁有禄. 中国农业科技导报. 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陆地棉高品质品系纤维品质性状QTL的分子标记及定位[J]. 王义青,李俊文,石玉真,刘爱英,商海红,龚举武,王涛,巩万奎,袁有禄. 棉花学报. 2010(06)
[7]转基因抗虫优质杂交棉——中棉所70[J]. 袁有禄,石玉真,李俊文,刘爱英,翟学军,李悦有,桑文东. 中国棉花. 2009(02)
[8]陆地棉遗传图谱构建及产量和纤维品质性状QTL定位[J]. 陈利,张正圣,胡美纯,王威,张建,刘大军,郑靓,郑风敏,马靖. 作物学报. 2008(07)
[9]陆地棉优质纤维QTL的分子标记筛选及优质来源分析[J]. 胡文静,张晓阳,张天真,郭旺珍. 作物学报. 2008(04)
[10]与棉花纤维强度连锁的主效QTL应用于棉花分子标记辅助育种[J]. 石玉真,刘爱英,李俊文,邵艳华,袁有禄. 分子植物育种. 2007(04)
硕士论文
[1]陆地棉SSR标记遗传图谱构建与纤维品质性状QTL定位[D]. 贾秀凌.西南大学 2014
本文编号：2897789
【文章来源】：河南大学河南省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
遗传连所图
Chr22 0 67 67 50.34 0.75 16.28 1Chr23 3 369 372 150.84 0.41 13.27 4Chr24 4 889 903 117.24 0.13 6.93 0Chr25 8 133 141 108.27 0.77 17.39 2Chr26 0 130 130 75.85 0.58 11.88 1Dt subgenome 78 4,066 4,154 1,503.16 0.36 - 27Total 107 8,306 8,413 2,772.79 0.33 - 483.3.2 遗传图谱中物理距离与遗传距离共线性分析对 SSR 标记利用 Blast 进行序列比对得出的物理距离，对 SNP 标记利用 Bowtie 进行序列比对并结合南京农业大学陆地棉参考基因组序列信息得到物理距离，然后采用CIRCOS0.66 作图软件分别对棉花 A 亚组和棉花 D 亚组每个标记的遗传距离与物理距离进行共线性分析，发现遗传图谱上的绝大多数位点与它们相应的物理位置一致，这表明遗传图谱的高质量，分析结果见如图 3-3。（b）（a）
【参考文献】：
期刊论文
[1]杂交棉中棉所70后代分离群体产量品质的表型变异分析[J]. 叶祯维,邓晓英,石玉真,李俊文,刘爱英,龚举武,巩万奎,商海红,陈婷婷,葛群,王艳玲,吴玉香,刘志,袁有禄. 棉花学报. 2016(01)
[2]普通小麦农大3338×京冬6号DH系群体株高及节间长度的QTL分析[J]. 逯腊虎,魏强,王飞,刘刚,秦丹丹,关攀锋,倪中福,姚颖垠,孙其信,彭惠茹. 中国农业大学学报. 2014(01)
[3]中棉所70生育特性及适宜种植方式分析[J]. 杨长琴,张培通,袁有禄,刘瑞显,龚举武,商海红,李俊文,石玉真. 江苏农业科学. 2012(07)
[4]棉花分子育种进展与展望[J]. 李付广,袁有禄. 中国农业科技导报. 2011(05)
[5]Population genetic structure and diversity of high value vulnerable medicinal plant Acorus calamus in India using RAPD and chloroplast microsatellite markers[J]. H. S. Ginwal,Neha Mittal,Arvind Tomar,V. K. Varshney. Journal of Forestry Research. 2011(03)
[6]陆地棉高品质品系纤维品质性状QTL的分子标记及定位[J]. 王义青,李俊文,石玉真,刘爱英,商海红,龚举武,王涛,巩万奎,袁有禄. 棉花学报. 2010(06)
[7]转基因抗虫优质杂交棉——中棉所70[J]. 袁有禄,石玉真,李俊文,刘爱英,翟学军,李悦有,桑文东. 中国棉花. 2009(02)
[8]陆地棉遗传图谱构建及产量和纤维品质性状QTL定位[J]. 陈利,张正圣,胡美纯,王威,张建,刘大军,郑靓,郑风敏,马靖. 作物学报. 2008(07)
[9]陆地棉优质纤维QTL的分子标记筛选及优质来源分析[J]. 胡文静,张晓阳,张天真,郭旺珍. 作物学报. 2008(04)
[10]与棉花纤维强度连锁的主效QTL应用于棉花分子标记辅助育种[J]. 石玉真,刘爱英,李俊文,邵艳华,袁有禄. 分子植物育种. 2007(04)
硕士论文
[1]陆地棉SSR标记遗传图谱构建与纤维品质性状QTL定位[D]. 贾秀凌.西南大学 2014
本文编号：2897789
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/2897789.html
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