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江华苦茶亲缘关系与遗传多样性研究

发布时间:2021-01-09 13:16
  江华苦茶是湖南省1987年认定的优良地方群体品种。主要分布在湖南省南部江华地区的南岭山脉,是宝贵的茶树资源。本研究在对江华苦茶进行资源深入调查的基础上,采用荧光SSR分子标记技术与cpDNA序列分析技术相结合的方法,对江华苦茶4个自然居群的32份资源进行了亲缘关系、遗传多样性和遗传分化的研究。研究结果如下:1.在江华县不同地域收集样品,先后获得27个代表性较高的样品,结合湖南省茶叶研究所茶园的江华苦茶五个样品,总共32个样品,用于本次实验。2、提取样品的DNA后进行了适用引物的筛选,最后选定四对引物进行cpDNA测序研究,测序结果表明变异率约为0.78%,采用MP法进行构建分子系统树,将参试的32个样品分成4个大类。而用Dnasp进行单倍型分析之后,被分为五个单倍型,构筑这五个单倍型的网状进化图,可以发现江华苦茶32个资源样品之间的cpDNA演化关系。进行中性检测和失配分析之后,认为江华苦茶没有发生扩张事件。在进行综合计算之后发现江华苦茶的cpDNA变异主要出现在地域内,居群内,比率为89.29%。3、采用荧光SSR分子标记技术对提取获得的江华苦茶DNA进行研究,获得数据采用popge... 

【文章来源】:湖南农业大学湖南省

【文章页数】:55 页

【学位级别】:硕士

【文章目录】:
摘要
Abstract
英文缩略表
第一章 综述
    1 江华苦茶研究进展
        1.1 江华苦茶的形态学特征
        1.2 江华苦茶生化成分研究
        1.3 江华苦茶的进化地位研究
    2 SSR分子标记研究
        2.1 SSR分子标记的原理
        2.2 SSR标记的优缺点
        2.3 SSR标记在茶树上的研究进展
    3 叶绿体基因组学研究
        3.1 叶绿体基因组编码的基因
        3.2 叶绿体基因组测序技术的发展
        3.3 叶绿体基因组的应用
    4 本研究的目的意义与主要研究内容
        4.1 本研究的目的意义
        4.2 主要研究内容
第二章 江华苦茶种质资源调查与收集
    1 材料与方法
    2 结果与分析
    3 讨论
第三章 江华苦茶的cpDNA序列分析
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验仪器与试剂
        1.3 实验方法
        1.4 数据处理
    2 结果与分析
        2.1 引物筛选结果
        2.2 不同序列的特征与差异
        2.3 MP法分子系统树分析
        2.4 单倍型分析
        2.5 多样性和中性检测分析
        2.6 居群遗传结构分析
    3 讨论
第四章 江华苦茶种质资源亲缘关系的SSR分析
    1 材料与方法
        1.1 实验材料
        1.2 实验仪器
        1.3 实验试剂
        1.4 实验方法
    2 结果与分析
        2.1 遗传多样性分析
        2.2 居群遗传结构分析
        2.3 资源聚类分析
    3 讨论
        3.1 江华苦茶基于nSSR表现的遗传多样性
        3.2 群体遗传结构
        3.3 资源亲缘关系
第五章 总结与展望
参考文献
致谢
作者简历


【参考文献】:
期刊论文
[1]茶组植物种间关系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析[J]. 刘振,赵洋,杨培迪,成杨,刘本英,李游勇,杨阳.  西南农业学报. 2018(01)
[2]基于SSR标记的黔南茶树种质资源DNA指纹图谱构建[J]. 陈世军,张明泽,姚玉仙,谢维斌.  植物遗传资源学报. 2017(01)
[3]茶树良种场不同品种的SSR鉴定研究[J]. 姜燕华,张成才,成浩.  茶叶学报. 2016(03)
[4]黔南60份茶树种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 张明泽,姚玉仙,陈世军.  西北植物学报. 2016(06)
[5]基于荧光标记SSR的CID法快速鉴定福建茶树品种[J]. 王让剑,杨军,孔祥瑞,高香凤.  茶叶科学. 2016(02)
[6]茶树PVP申请品种的SSR分子标记鉴定和系谱关系分析[J]. 黄丹娟,马建强,陈亮.  茶叶科学. 2016(01)
[7]利用SSR标记分析福建省选育福云半同胞系茶树品种遗传多样性[J]. 陈志辉,单睿阳,林郑和,游小妹,钟秋生,陈常颂.  茶叶学报. 2015(04)
[8]福建15个茶树品种SSR遗传差异分析与指纹图谱建立[J]. 王让剑,杨军,孔祥瑞,郭吉春.  福建农业学报. 2014(10)
[9]SSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用[J]. 李珊珊,孙春玉,蒋世翠,王康宇,王义,张美萍.  吉林蔬菜. 2014(05)
[10]基于ITS和matK序列探讨新疆野苹果与中国苹果的系统演化关系[J]. 朱元娣,曹敏格,许正,王昆,张文.  园艺学报. 2014(02)

博士论文
[1]孑遗植物珙桐的群体遗传学和谱系地理学研究[D]. 杜玉娟.浙江大学 2012

硕士论文
[1]基于cpDNA序列的茶树及其近缘植物的亲缘关系研究[D]. 陈春梅.中国农业科学院 2014
[2]香蕉种质资源种间线粒体DNA位点变异的遗传分类[D]. 邓长娟.海南大学 2011



本文编号:2966722

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