基于Perfect SSR和叶绿体InDel标记对玉米真实性和纯度鉴定

发布时间：2021-01-18 21:22

　　我国是玉米种植大国,玉米质量问题至关重要,为保证其质量,除了良好的品种之外,品种的真实性、纯度等问题也是不可忽略的。近年来,随着分子标记的广泛应用,玉米的真实性和纯度鉴定变得更为简单和准确。本研究以玉米全基因组重测序数据开发出的新的核基因组SSR标记以及叶绿体的InDel标记为基础,利用新的SSR标记建立多重PCR和电泳体系、构建DNA指纹数据库,便于高通量玉米的真实性和纯度鉴定,采用叶绿体InDel标记对玉米核基因组上无法鉴定的信息,比如玉米正反交的快速鉴定进行进一步补充。第一部分:Perfect SSR多重PCR体系建立及数据库的构建。本研究以玉米的重测序数据为基础开发并设计了一批SSR标记,根据染色体位置、扩增片段大下、荧光颜色等信息从111对新的SSR引物中挑选出适合组成多重PCR的40对新SSR引物。通过荧光定量PCR和琼脂糖凝胶电泳确定了多重PCR的最适DNA浓度及最适扩增条件,以24个代表性玉米品种为研究材料,其中包括目前推广面积较广的4套三联体材料和12个玉米骨干自交系,对40对新引物进行筛选和优化并从中最终挑选出32对引物,组建了4组8重PCR扩增,2组16重电泳,以... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图124个DNA（200ng/μL）琼脂糖凝胶电泳图

图 2 不同 DNA 浓度对引物的影响Figure 2 Impact of different DNA concentration on primer(ng/μL)

图 3 不同 DNA 浓度下达到平台期的所需循环数及扩增产物量Figure 3 Cycles and amplification product amount of different DNA concentration以上四个浓度的基础上又进行了 DNA 浓度为 5 ng/μL 的扩增效果对比，并对 DNA 浓度进行了统计分析，比较它们和扩增达到平台期的所需循环数和产物趋势和关系（图 3）。可以看出随着 DNA 浓度的不断增加，所需循环数逐渐降A 浓度在 12.5 ng/μL 时，扩增产物量达到顶峰，高于或者是低于此值扩增产物所降低，因此后续的试验样品浓度均采用 12.5 ng/μL。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2985690