小麦Dof转录因子家族全基因组鉴定和表达分析

发布时间：2021-02-24 22:04

　　利用生物信息学方法对小麦Dof转录因子家族进行全基因组鉴定,并对其保守结构域、系统进化关系、共线性和表达模式进行分析,以期为小麦Dof转录因子的功能研究奠定基础。结果表明,在小麦基因组水平上共鉴定到86个Dof基因,它们在小麦染色体上不均等分布,A、B、D染色体组中分别含有30、29、27个Dof转录因子;小麦Dof转录因子可被分成A、B、C1、C2、C3、D1、D2七个亚组,其中亚组D1是最大的一个亚组,含有29个Dof转录因子;多序列比对结果显示,所有的Dof转录因子都包含有一个C-X₂-C-X₂₁-CX₂-C保守基序;共线性结果表明,有23个Dof基因组成了29对共线性基因对,暗示Dof基因在进化过程中发生了复制;表达模式分析表明,Dof基因在不同生长发育时期的组织和胁迫条件下均存在差异表达,说明Dof基因广泛参与小麦生长发育,且在响应生物和非生物胁迫中可能发挥重要作用。 

【文章来源】：河南农业科学. 2020,49(09)北大核心

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 小麦Dof转录因子家族的全基因组鉴定及理化性质分析
    1.2 多序列比对和系统进化分析
    1.3 染色体定位和共线性分析
    1.4 表达模式分析
2 结果与分析
    2.1 小麦Dof转录因子家族的全基因组鉴定和理化性质分析
    2.2 小麦Dof转录因子多序列比对分析
    2.3 小麦Dof转录因子进化分析
    2.4 小麦Dof基因染色体定位和共线性分析
    2.5 小麦Dof基因表达模式分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析[J]. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽.  河南农业科学. 2019(11)
[2]粗山羊草Dof转录因子家族基因的鉴定与分析[J]. 赵梦琪,周正富,齐豫川,晁岳恩,王美芳,何盛莲,李文旭,秦毛毛,吴政卿,雷振生.  分子植物育种. 2017(07)



本文编号：3050006