小麦TaCO9基因的克隆及功能分析

发布时间：2021-02-28 09:33

　　为了明确TaCO9-1A基因在小麦生长发育中的具体调控机理,该研究以同源克隆的方法成功获得了大麦（Hordeum vulgare）光周期基因HvCO9在小麦（Triticum aestivum）中的直系同源基因TaCO9,并对其进行生物信息学分析、亚细胞定位、转录激活以及表达模式分析;利用农杆菌侵染法转化拟南芥,并对过表达株系进行表型分析。结果表明:（1）TaCO9包含2个外显子和1个内含子,CDS区全长876 bp,编码291个氨基酸,蛋白序列含有特有的CCT结构域,且在不同物种间高度保守。（2）生物信息学分析表明,TaCO9基因编码的蛋白质分子量约为30.7 kD,等电点为6.24;TaCO9的启动子区含有光响应、激素应答和胁迫应答等多种顺式作用元件。（3）亚细胞定位和转录活性分析表明,TaCO9主要定位于细胞核中,且具有转录激活活性。（4）qRT-PCR结果表明,TaCO9基因在各个组织中均有表达,叶片中的表达量最高;在光照14 h条件下TaCO9的表达量显著高于光照10 h和12 h条件下的表达量,且TaCO9在大粒小麦‘西农817’子房与籽粒中的表达量显著高于‘中国春’。（5... 

【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(03)北大核心

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

TaCO9基因cDNA序列的克隆(A)及其基因结构(B)

表2 TaCO9基因上游调控区顺式作用元件Table 2 cis-elements in the upstream regulation region of TaCO9 gene 相关功能预测Associated putative function 启动子顺式作用元件cis-elements in the promoter region 光响应元件 Light responsiveness element G-Box, G-box, C-box, GT1-motif, Sp1, box4, ATCT-motif, TCCC-motif, GATA-motif, I-box, TCT-motif 生长素反应元件 Auxin responsiveness element AuxRR-core 参与茉莉酸反应的顺式作用元件 MeJA-responsiveness CGTCA-motif, TGACG-motif 参与脱落酸反应的顺势作用 Abscisic acid responsiveness ABRE, TGA-element 参与水杨酸反应的顺式作用元件 Salicylic acid responsiveness TCA-element 启动子和增强子区基本顺式作用元件 Promoter and enhancer regions CAAT-box 厌氧诱导所需的顺式作用元件 Anoxic specific inducibility GC-motif 低温响应元件 Low-temperature responsiveness CAAT-box, LTR 玉米醇溶蛋白代谢调节元件 Zein metabolism regulation O2-site MYBHv1结合位点 MYBHv1 binding site CCAAT-box MYB结合位点参与干旱诱导的顺式作用元件 MYB binding site involved in drought-inducibility MBS 与分生组织表达有关的顺式作用元件 Meristem expression CAT-box 转录起始位点-30区核心启动子 Core promoter element around -30 of transcription start TATA-box图3 TaCO9在不同组织中(A)以及不同光照处理下(B)的表达模式

TaCO9在不同组织中(A)以及不同光照处理下(B)的表达模式

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3055661