多群体定位水稻粒形数量性状位点
发布时间：2021-03-01 02:00
水稻作为世界第二大粮食作物,为世界半数以上的人口提供主粮,因此研究水稻产量问题对于解决全球食品安全问题具有十分重要的意义。水稻的粒形是水稻产量的重要构成要件。水稻的粒形由粒长,粒宽和粒厚等数量性状共同决定。某些水稻品系具有超大粒表型,这些遗传学材料因其籽粒表型易于鉴定并且存在稀有等位基因,常被用来作为定位群体的亲本材料。本实验以具有超大粒表型的水稻材料‘LG10’作为亲本之一,分别与其他三个粒形较小的材料杂交形成了三个群体用来进行粒形相关的数量性状位点（QTL）的定位,以期找到超大粒材料‘LG10’上所有的调控粒形的优异基因,并将其应用到其他品种中去,从而提高水稻产量,为解决全球食品安全问题提供理论基础。本实验得到以下结果:1.利用‘LG10’和‘Wasa8’杂交构建的F2代群体进行粒形相关QTL定位。共获得了16个粒形相关的QTLs,分布于2号、3号、5号、10号和11号染色体上。将粒长QTL-q GL2.1定位于标记LW02017和LW02019之间。2.利用‘LG10’和‘KD12’杂交构建的F2代群体进行粒形相关QTL定位。共获得6个粒形相关的QTLs,分布于2号、3号、6号和...
【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本籽粒形态学及粒形统计图
: E. 1,000-grain weight of "LG10" and" Wasa8", The unit is g, n=20. : Student’s t tests were used to generate P values. 因为超大粒表型的水稻材料通常存在稀有的等位变异[95]，因此我们选择以超大粒表型的‘LG10’和较小粒表型的‘Wasa8’作为亲本，挖掘调控粒形差异的 QTL 位点。以‘LG10’和‘Wasa8’作为亲本构建的 F2 分离群体共有 109 株，我们利用万深考种仪考取了这 109 个单株的表型并对这 109 株水稻单株进行了粒长，粒宽、粒厚和千粒重这四个性状在不同范围内的频率分布情况进行了统计，得到的结果如图 3-2 所示。我们可以看出在粒长、粒宽、粒厚和千粒重这四个性状中，群体都呈现正态分布，并且在群体的粒厚表型还出现了超亲分离，证明可以通过育种得到优于亲本的水稻材料。
本的基因型进行分析与比对，找到存在于两个亲本之间的SNP差异。SNP标记分为很多种，因为本研究中所选用的遗传作图群体为F2代分离群体，所以选择了适用于F2分离群体进行遗传作图的aa×bb型分子标记。所谓aa×bb标记，就是指父母本都为纯合且亲本间具有多态性的位点，就比如在某个SNP位点亲本1的基因型为“aa”，亲本2基因型为“bb”，亲本基因型都为纯合，亲本间基因型却不相同。在两个亲本间共找到3,511,731多态性标记，其中aa×bb型分子标记为2,082,692个。两个亲本间的所有SNP标记和aa×bb型分子标记在染色体上的分布情况如图3-3所示。图3-3亲本差异SNP以及aa×bb型标记在全基因组上分布注：最外层的数字为12条染色体。次外层为标尺。次内层为亲本差异SNP在全基因组上的分布。最内层为aa×bb型分子标记在全基因组上的分布。Fig.3-3DistributionofparentaldifferentialSNPandaa×bbtypemarkersinthewholegenome.Note:Theoutermostlayermeans12chromosomesindividually.:Thesecondouterlayeristheruler.:ThesecondinnerlayeristhedistributionofparentaldifferentialSNPinthewholegenome.:Theinnermostlayeristhedistributionofaa×bbmolecularmarkersonthewholegenome.在分子标记开发完之后，将106个单株在这些分子标记的位置上的基因型进行统计，将其分为与亲本1的基因型相同的基因型、与亲本2的基因型相同的基因型、与参考基
【参考文献】：
期刊论文
[1]全基因组SNP分型策略及基因组预测方法的研究进展[J]. 王琦,朱迪,王宇哲,吴杰,胡晓湘,赵毅强. 畜牧兽医学报. 2020(02)
[2]基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析[J]. 加依娜·吾永巴衣,胡文明,阿迪里·托乎尼亚孜,徐翠莲. 江苏农业科学. 2019(02)
[3]新一代DNA测序技术的应用与研究进展[J]. 徐疏梅. 徐州工程学院学报(自然科学版). 2018(04)
[4]DNA测序技术的发展进程[J]. 毛亚文,陈江华. 亚热带植物科学. 2018(01)
[5]大粒型水稻材料粒型性状的QTL定位[J]. 汪欲鹏,王根发,武志峰,王智权,石庆华,潘晓华,吴自明. 核农学报. 2016(12)
[6]水稻数量性状（QTL）定位主要作图群体及统计方法概述[J]. 孙佳丽,彭锐,彭既明. 湖南农业科学. 2016(07)
[7]Genetic Analysis and QTL Mapping of Large Flag Leaf Angle Trait in Japonica Rice[J]. HU Wen-de,ZHANG Hong,JIANG Jian-hua,WANG Ying-ying,SUN Da-yun,WANG Xiao-shuai,LIANG Kui,HONG De-lin. Rice Science. 2012(04)
[8]作物QTL定位常用作图群体[J]. 蒋洪蔚,刘春燕,高运来,李灿东,张闻博,胡国华,陈庆山. 生物技术通报. 2008(S1)
[9]谷类作物基因组的共线性[J]. 辛碧芬. 上饶师范学院学报(自然科学版). 2006(03)
[10]回交自交系群体数量性状遗传体系的分离分析方法[J]. 何小红,盖钧镒. 作物学报. 2006(02)
博士论文
[1]水稻粒型QTL的定位及粒长基因GL3.3的克隆与功能研究[D]. 夏朵.华中农业大学 2019
硕士论文
[1]长春花转录组与萜类吲哚生物碱代谢途径研究[D]. 朱孝轩.北京协和医学院 2015
本文编号：3056793
【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本籽粒形态学及粒形统计图
: E. 1,000-grain weight of "LG10" and" Wasa8", The unit is g, n=20. : Student’s t tests were used to generate P values. 因为超大粒表型的水稻材料通常存在稀有的等位变异[95]，因此我们选择以超大粒表型的‘LG10’和较小粒表型的‘Wasa8’作为亲本，挖掘调控粒形差异的 QTL 位点。以‘LG10’和‘Wasa8’作为亲本构建的 F2 分离群体共有 109 株，我们利用万深考种仪考取了这 109 个单株的表型并对这 109 株水稻单株进行了粒长，粒宽、粒厚和千粒重这四个性状在不同范围内的频率分布情况进行了统计，得到的结果如图 3-2 所示。我们可以看出在粒长、粒宽、粒厚和千粒重这四个性状中，群体都呈现正态分布，并且在群体的粒厚表型还出现了超亲分离，证明可以通过育种得到优于亲本的水稻材料。
本的基因型进行分析与比对，找到存在于两个亲本之间的SNP差异。SNP标记分为很多种，因为本研究中所选用的遗传作图群体为F2代分离群体，所以选择了适用于F2分离群体进行遗传作图的aa×bb型分子标记。所谓aa×bb标记，就是指父母本都为纯合且亲本间具有多态性的位点，就比如在某个SNP位点亲本1的基因型为“aa”，亲本2基因型为“bb”，亲本基因型都为纯合，亲本间基因型却不相同。在两个亲本间共找到3,511,731多态性标记，其中aa×bb型分子标记为2,082,692个。两个亲本间的所有SNP标记和aa×bb型分子标记在染色体上的分布情况如图3-3所示。图3-3亲本差异SNP以及aa×bb型标记在全基因组上分布注：最外层的数字为12条染色体。次外层为标尺。次内层为亲本差异SNP在全基因组上的分布。最内层为aa×bb型分子标记在全基因组上的分布。Fig.3-3DistributionofparentaldifferentialSNPandaa×bbtypemarkersinthewholegenome.Note:Theoutermostlayermeans12chromosomesindividually.:Thesecondouterlayeristheruler.:ThesecondinnerlayeristhedistributionofparentaldifferentialSNPinthewholegenome.:Theinnermostlayeristhedistributionofaa×bbmolecularmarkersonthewholegenome.在分子标记开发完之后，将106个单株在这些分子标记的位置上的基因型进行统计，将其分为与亲本1的基因型相同的基因型、与亲本2的基因型相同的基因型、与参考基
【参考文献】：
期刊论文
[1]全基因组SNP分型策略及基因组预测方法的研究进展[J]. 王琦,朱迪,王宇哲,吴杰,胡晓湘,赵毅强. 畜牧兽医学报. 2020(02)
[2]基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析[J]. 加依娜·吾永巴衣,胡文明,阿迪里·托乎尼亚孜,徐翠莲. 江苏农业科学. 2019(02)
[3]新一代DNA测序技术的应用与研究进展[J]. 徐疏梅. 徐州工程学院学报(自然科学版). 2018(04)
[4]DNA测序技术的发展进程[J]. 毛亚文,陈江华. 亚热带植物科学. 2018(01)
[5]大粒型水稻材料粒型性状的QTL定位[J]. 汪欲鹏,王根发,武志峰,王智权,石庆华,潘晓华,吴自明. 核农学报. 2016(12)
[6]水稻数量性状（QTL）定位主要作图群体及统计方法概述[J]. 孙佳丽,彭锐,彭既明. 湖南农业科学. 2016(07)
[7]Genetic Analysis and QTL Mapping of Large Flag Leaf Angle Trait in Japonica Rice[J]. HU Wen-de,ZHANG Hong,JIANG Jian-hua,WANG Ying-ying,SUN Da-yun,WANG Xiao-shuai,LIANG Kui,HONG De-lin. Rice Science. 2012(04)
[8]作物QTL定位常用作图群体[J]. 蒋洪蔚,刘春燕,高运来,李灿东,张闻博,胡国华,陈庆山. 生物技术通报. 2008(S1)
[9]谷类作物基因组的共线性[J]. 辛碧芬. 上饶师范学院学报(自然科学版). 2006(03)
[10]回交自交系群体数量性状遗传体系的分离分析方法[J]. 何小红,盖钧镒. 作物学报. 2006(02)
博士论文
[1]水稻粒型QTL的定位及粒长基因GL3.3的克隆与功能研究[D]. 夏朵.华中农业大学 2019
硕士论文
[1]长春花转录组与萜类吲哚生物碱代谢途径研究[D]. 朱孝轩.北京协和医学院 2015
本文编号：3056793
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