黑果枸杞遗传多样性及快繁体系的初步研究
发布时间：2021-03-04 19:45
黑果枸杞（Lycium ruthenicum Murr.）为茄科（Solanaceae）枸杞属多年生落叶灌木植物,主要分布在我国西北部地区。果实富含丰富的花青素、多糖、矿物质等营养物质,被称之为天然的抗氧化剂。黑果枸杞不仅具有药用价值和保健价值,作为西北地区荒漠化治理的先锋树种,还具有巨大的生态价值。近年来,由于黑果枸杞生长环境的恶化,加之种子在自然条件下萌芽率低、人们的破坏性采摘等原因,导致黑果枸杞的资源在很大程度上受到了破坏。目前,黑果枸杞已开始人工栽培,但在良种选育和繁殖、定向培育技术等方面的研究尚需进一步加强。本研究利用SSR分子标记技术研究了我国西北地区黑果枸杞种质资源的遗传多样性及居群间的遗传分化,并建立了黑果枸杞离体快繁体系,为我国黑果枸杞资源的保护、利用以及新品种的选育和繁殖提供了理论依据和技术支撑。主要研究结果如下:1.利用转录组数据开发并筛选出多态性好、条带清晰的20对SSR引物用于黑果枸杞种质资源的遗传多样性及亲缘关系分析,并对SSR-PCR扩增体系进行了优化。2.所有引物在黑果枸杞的样品中均能有效扩增,可以用于黑果枸杞的遗传多样性研究。其中,基于SSR标记黑果枸...
【文章来源】：南京林业大学江苏省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黑果枸杞采集点的地理位置分布图
203结果与分析3.1黑果枸杞SSR引物筛选及遗传多样性3.1.1黑果枸杞DNA提取DNA模板是PCR扩增实验的关键基础，提取高纯度和高浓度DNA能够保证实验顺利进行。因此本研究采用两种方法对DNA质量进行检测，只有两种方法都符合标准才能用于后续使用。用纳米滴ND2000c分光光度计（ThermoScientific,USA）对提取的DNA浓度和纯度进行检测，根据OD值（260/280）的比值判断DNA的质量，当OD比值＜1.60时，说明DNA溶液中含有蛋白质、多糖等杂志，当OD比值＞1.90时，说明DNA溶液中有RNA或者裂解的核酸片段等杂质，只有OD比值在1.70~1.90范围之间的DNA溶液符合标准[136]。用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量，通过条带清晰度来判断DNA质量的好坏，当条带清晰完整，无拖尾杂带现象，点样孔无残留亮带时，说明DNA的质量较高，反之较低。通过条带的明亮程度来判断DNA的浓度，条带越亮则DNA浓度越高。182份黑果枸杞材料DNA琼脂糖电泳条带条带清晰、无弥散拖尾等现象，OD比值均在1.70~1.90之间，纯度较高，可满足后续实验需求，其中用于筛选引物的6份黑果枸杞样品DNA琼脂糖凝胶电泳图见图2。图26份黑果枸杞植株基因组DNA琼脂糖电泳图Fig.2GenomicDNAsamplesdetectedonagarosegelof6LyciumruyheniumMurr.3.1.2黑果枸杞转录组序列拼接和功能注释以NCBI数据库下载的黑果枸杞转录组数据为基础，在去除低品质的原始序列后，共获得121499条高品质干净序列，长度从201bp到23514bp不等，平均约为2053.64bp。其中GC含量约为33.95%（表4）。在对黑果枸杞转录组序列进行拼接组装后，通过与6个功能数据库（Nr；Swiss-Prot；
22图3黑果枸杞功能基因在基因本体（GO）中的功能分类Fig.3FunctionalclassificationofGeneOntology(GO)forassembleunigenesofLyciumruyheniumMurr.注：共有41484个unigenes被分配到48个三类功能组中。Note:atotalof41,484Unigeneswereassignedto48functionalgroupsofthreetypes
【参考文献】：
期刊论文
[1]我国经济林发展现状、存在问题及对策分析[J]. 朱熠晟. 中国林业经济. 2020(03)
[2]基于微卫星群体遗传学的栽培枸杞遗传多样性和遗传结构评价[J]. 余意,王凌,孙嘉惠,钟文浩,张藤,郭兰萍,袁庆军. 中国中药杂志. 2020(04)
[3]蝴蝶兰组培苗瓶外生根研究[J]. 陆耀,梁明骅,张敏. 现代园艺. 2020(02)
[4]海南岛油茶种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 陈宣,云勇,吴宇佳,戚华沙,杨立荣,陈加利,郑道君. 热带亚热带植物学报. 2019(06)
[5]基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析[J]. 林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯,晋玲. 中国中医药信息杂志. 2019(11)
[6]植物生长调节剂和基质种类对杉木无性系瓶外生根组培苗质量的影响[J]. 韦如萍,胡德活,晏姝,郑会全,王润辉,曾宏. 西南林业大学学报(自然科学). 2019(06)
[7]黑果枸杞产业现状及快速繁殖技术研究[J]. 马占蕾. 甘肃农业. 2019(08)
[8]基于转录组的黑果枸杞SSR分布特征分析及引物设计[J]. 郝广婧,祁银燕,张得芳,朱春云. 分子植物育种. 2019(13)
[9]黑果枸杞转录组SSR信息分析及分子标记开发[J]. 尹跃,安巍,赵建华,王亚军,樊云芳,曹有龙. 浙江农林大学学报. 2019(02)
[10]黑果枸杞组织培养研究[J]. 汪清锐,吕林芳. 山西林业科技. 2019(01)
博士论文
[1]毛白杨遗传多样性及起源研究[D]. 何承忠.北京林业大学 2005
硕士论文
[1]树莓新品系离体快繁技术研究[D]. 侯睿宁.东北农业大学 2019
[2]基于SSR、SRAP标记的榛属种质资源遗传多样性及亲缘关系分析[D]. 陈豫静.沈阳农业大学 2019
[3]黑果枸杞种子萌发特性及组织培养研究[D]. 张沛.西北农林科技大学 2017
本文编号：3063803
【文章来源】：南京林业大学江苏省
【文章页数】：63 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黑果枸杞采集点的地理位置分布图
203结果与分析3.1黑果枸杞SSR引物筛选及遗传多样性3.1.1黑果枸杞DNA提取DNA模板是PCR扩增实验的关键基础，提取高纯度和高浓度DNA能够保证实验顺利进行。因此本研究采用两种方法对DNA质量进行检测，只有两种方法都符合标准才能用于后续使用。用纳米滴ND2000c分光光度计（ThermoScientific,USA）对提取的DNA浓度和纯度进行检测，根据OD值（260/280）的比值判断DNA的质量，当OD比值＜1.60时，说明DNA溶液中含有蛋白质、多糖等杂志，当OD比值＞1.90时，说明DNA溶液中有RNA或者裂解的核酸片段等杂质，只有OD比值在1.70~1.90范围之间的DNA溶液符合标准[136]。用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量，通过条带清晰度来判断DNA质量的好坏，当条带清晰完整，无拖尾杂带现象，点样孔无残留亮带时，说明DNA的质量较高，反之较低。通过条带的明亮程度来判断DNA的浓度，条带越亮则DNA浓度越高。182份黑果枸杞材料DNA琼脂糖电泳条带条带清晰、无弥散拖尾等现象，OD比值均在1.70~1.90之间，纯度较高，可满足后续实验需求，其中用于筛选引物的6份黑果枸杞样品DNA琼脂糖凝胶电泳图见图2。图26份黑果枸杞植株基因组DNA琼脂糖电泳图Fig.2GenomicDNAsamplesdetectedonagarosegelof6LyciumruyheniumMurr.3.1.2黑果枸杞转录组序列拼接和功能注释以NCBI数据库下载的黑果枸杞转录组数据为基础，在去除低品质的原始序列后，共获得121499条高品质干净序列，长度从201bp到23514bp不等，平均约为2053.64bp。其中GC含量约为33.95%（表4）。在对黑果枸杞转录组序列进行拼接组装后，通过与6个功能数据库（Nr；Swiss-Prot；
22图3黑果枸杞功能基因在基因本体（GO）中的功能分类Fig.3FunctionalclassificationofGeneOntology(GO)forassembleunigenesofLyciumruyheniumMurr.注：共有41484个unigenes被分配到48个三类功能组中。Note:atotalof41,484Unigeneswereassignedto48functionalgroupsofthreetypes
【参考文献】：
期刊论文
[1]我国经济林发展现状、存在问题及对策分析[J]. 朱熠晟. 中国林业经济. 2020(03)
[2]基于微卫星群体遗传学的栽培枸杞遗传多样性和遗传结构评价[J]. 余意,王凌,孙嘉惠,钟文浩,张藤,郭兰萍,袁庆军. 中国中药杂志. 2020(04)
[3]蝴蝶兰组培苗瓶外生根研究[J]. 陆耀,梁明骅,张敏. 现代园艺. 2020(02)
[4]海南岛油茶种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 陈宣,云勇,吴宇佳,戚华沙,杨立荣,陈加利,郑道君. 热带亚热带植物学报. 2019(06)
[5]基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析[J]. 林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯,晋玲. 中国中医药信息杂志. 2019(11)
[6]植物生长调节剂和基质种类对杉木无性系瓶外生根组培苗质量的影响[J]. 韦如萍,胡德活,晏姝,郑会全,王润辉,曾宏. 西南林业大学学报(自然科学). 2019(06)
[7]黑果枸杞产业现状及快速繁殖技术研究[J]. 马占蕾. 甘肃农业. 2019(08)
[8]基于转录组的黑果枸杞SSR分布特征分析及引物设计[J]. 郝广婧,祁银燕,张得芳,朱春云. 分子植物育种. 2019(13)
[9]黑果枸杞转录组SSR信息分析及分子标记开发[J]. 尹跃,安巍,赵建华,王亚军,樊云芳,曹有龙. 浙江农林大学学报. 2019(02)
[10]黑果枸杞组织培养研究[J]. 汪清锐,吕林芳. 山西林业科技. 2019(01)
博士论文
[1]毛白杨遗传多样性及起源研究[D]. 何承忠.北京林业大学 2005
硕士论文
[1]树莓新品系离体快繁技术研究[D]. 侯睿宁.东北农业大学 2019
[2]基于SSR、SRAP标记的榛属种质资源遗传多样性及亲缘关系分析[D]. 陈豫静.沈阳农业大学 2019
[3]黑果枸杞种子萌发特性及组织培养研究[D]. 张沛.西北农林科技大学 2017
本文编号：3063803
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3063803.html
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