棉花染色体细胞学标记的开发及其着丝粒DNA序列的分析

发布时间：2021-03-12 04:29

　　棉花是世界上重要的纤维作物,同时也是研究植物多倍化演化的模式材料。由于四倍体陆地棉染色体数目多（2n=52）且染色体长度较短,缺乏明显的表型区别,因此,难以开展染色体的识别与深入的核型分析。本研究通过筛选人工染色体BAC克隆,获得了一套位于异源四倍体陆地棉26条染色体不同臂的特异BAC。在此基础上,结合着丝粒特异的BAC 97G20和拟南芥端粒特异的序列标记,对陆地棉进行了染色体的精细识别。结果发现:最长染色体是A亚组的10号染色体,长度是3.51 μm（131.0Mb）占比是5.40%。最短的染色体是D亚组的4号染色体,长度是1.59μm（59.4Mb）占比是2.45%。除了A亚组的四号染色体比它同源的D亚组的染色体短,A亚组的染色体都长于D亚组相对应的同源染色体。同时,在棉属的不同种间,使用陆地棉核型分析的BAC做探针,其结果显示,这一套标记适用于棉属不同种间的染色体核型分析。以上的这些实验结果对陆地棉在染色体水平和棉花基因结构方面进行了详细的分析,扩大了棉花基因组结构的认识,同时为植物细胞遗传学的研究提供有力的工具。在大多数的真核植物中着丝粒染色质是由高度重复的着丝粒反转录转座子... 

【文章来源】：福建农林大学福建省

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
缩略词表
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1 棉属的分类
    2 陆地棉的特征
    3 荧光原位杂交技术
        3.1 荧光原位杂交技术简介
        3.2 荧光原位杂交的基本原理
        3.3 原位杂交技术的发展
    4 荧光原位杂交技术的应用
        4.1 染色体作图
        4.2 比较染色体作图
        4.3 单拷贝基因比较染色体作图
        4.4 转基因植物鉴定中的应用
        4.5 植物重复序列的研究
    5 植物着丝粒的研究进展
        5.1 植物着丝粒的DNA序列
            5.1.1 卫星DNA序列
            5.1.2 反转录转座子
        5.2 植物着丝粒特异组蛋白
        5.3 植物着丝粒DNA序列的进化
    6 本研究的目的和内容
        6.1 目的和意义
        6.2 主要研究内容
第二章 陆地棉染色体的细胞学研究
    1 材料
    2 方法
        2.1 荧光原位杂交
            2.1.1 靶染色体制备
            2.1.2 探针的制备
            2.1.3 原位杂交
        2.2 信号检测与图像分析
        2.3 棉花特异BAC的提取
    3 结果与分析
        3.1 陆地棉染色体臂特异BAC克隆的筛选
        3.2 陆地棉的核型分析
            3.2.1 使用陆地棉着丝粒特异的BAC序列和端粒序列进行分析
            3.2.2 陆地棉染色体的测量
        3.3 陆地棉近缘种间染色体长度的分析
            3.3.1 陆地棉AD亚组染色体长度的比较
            3.3.2 陆地棉A亚组的6号和8号染色体与其祖先染色体比较的研究
        3.4 陆地棉45S rDNA和5S rDNA位点
        3.5 陆地棉特异BACs在棉属不同种适用性分析
    4 讨论
        4.1 染色体BAC在测序中的应用
        4.2 陆地棉AD亚组染色体测量长度不同的讨论
        4.3 陆地棉AD亚组染色体重复序列在非编码区域的扩增
第三章 棉花着丝粒DNA序列的进化分析
    1 材料
    2 方法
        2.1 棉花基因组DNA的提取
        2.2 胶回收
        2.3 染色质免疫共沉淀
    3 结果与分析
        3.1 雷蒙德氏棉着丝粒序列的挖掘与分析
            3.1.1 雷蒙德氏棉着丝粒特异序列的挖掘
            3.1.2 雷蒙德氏棉着丝粒特异序列的分析
        3.2 雷蒙德氏棉着丝粒特异序列的fiber-FISH分析
        3.3 雷蒙德氏棉着丝粒序列在棉属间的演化模式
    4 讨论
        4.1 陆地棉中呈扩大趋势的反转录转座子
        4.2 关于Gr298,Gr359和Gr334序列的进一步推论
第四章 小结与展望
    1 小结
    2 展望
参考文献
致谢



本文编号：3077681