滇重楼种子休眠及休眠解除的比较转录组分析

发布时间：2021-03-14 04:02

　　滇重楼是我国常用稀缺名贵中药材之一,具有清热解毒、消肿止痛等功效,市场需求量大,社会、经济效益高。原植物滇重楼Paris polyphyllavar.yunnanensis自然环境下主要依靠种子繁殖,但因其种子具有形态和生理双重休眠特性,在人工种植时,会出现种子萌发时间长、发芽率低、出苗不整齐等问题。本研究选取层积处理不同阶段的种子及种子成熟时的根和茎叶组织,采用比较转录组学分析的方法,对滇重楼种子休眠及休眠解除过程的分子机理进行探索,主要研究结果如下:1、利用新一代高通量测序技术Illumina HiseqTM2000平台,对5个组织样品（成熟未处理种子,Seed;温度20℃层积45天左右的种子,S-Str;温度层积后胚根突破种皮的种子,S-Ger;根,Root;茎和叶的混合样品,StL）进行转录组测序,分别得到6.67G、6.46G、7.55G、7.21G和9.41G的测序数据。对5组样品的测序数据进行混合拼接（应用Trinity软件）,得到311,401个转录本,平均长度610bp;得到234,331条Unigene,平均长度541bp。2、234,331 条 Unigene 中... 

【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

各时期各部位样品图

图２－２滇重楼种子ＲＮＡ－Ｓｅｑ实验流程??Ｆｉｇ．?２－２?ＲＮＡ－Ｓｅｑ?ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ?ｐｉｐｅｌｉｎｅ?ｏｆ?Ｐ．?ｐｏｌｙｐｈｙｌｌａ?ｖａｒ．?ｙｕｎｎａｎｅｎｓｉｓ?ｓｅｅｄ??１５??

一演重樱种子等组织的转录组生物信息分析流程

【参考文献】：
期刊论文
[1]重楼人工种植技术[J]. 荣吉青.  农村实用技术. 2016(09)
[2]重楼药理作用研究进展[J]. 肖女,盖丽,罗斌,李红英,杨增俊.  世界最新医学信息文摘. 2016(67)
[3]重楼资源分布与可持续利用研究进展[J]. 杨光义,胡培,叶方.  中国药师. 2016(01)
[4]玉米转录组学研究进展[J]. 王继玥,余庭跃,张采波.  华北农学报. 2014(S1)
[5]珍惜药用植物重楼研究进展[J]. 张翔宇,唐映军,周茂嫦,徐庆祝,罗志国,李恒谦.  现代中药研究与实践. 2014(01)
[6]重楼的鉴别与加工[J]. 高宾,孙利生,赵佳丽.  首都医药. 2013(17)
[7]高通量转录组测序的数据分析与基因发掘[J]. 周华,张新,刘腾云,余发新.  江西科学. 2012(05)
[8]滇重楼栽培技术及有效成分积累研究综述[J]. 太光聪,方其仙,李行,杨燕.  安徽农业科学. 2012(16)
[9]重楼的研究进展[J]. 何良艳,余美荣,陈建真.  现代中药研究与实践. 2011(06)
[10]药用植物种子休眠类型及休眠解除研究进展[J]. 徐文娟,祁建军.  生物技术进展. 2011(02)

博士论文
[1]滇重楼与七叶一枝花化学成分及生物活性的研究[D]. 李焘.陕西师范大学 2011

硕士论文
[1]滇重楼GAox基因克隆及其在种子萌发过程中表达规律研究[D]. 张梦幻.北京协和医学院 2017
[2]栽培滇重楼的分子鉴别及质量评价[D]. 刘晓萌.云南中医学院 2014
[3]拟南芥种子发育过程转录组深度测序数据的分析[D]. 张琳.福建农林大学 2011



本文编号：3081452