全基因组关联分析解析水稻剑叶及单株产量的遗传基础

发布时间：2021-03-14 11:38

　　剑叶是水稻主要的源器官,剑叶大小与产量呈极显著的正相关,揭示剑叶大小和单株产量的遗传基础对于选育株型适宜的水稻高产品种具有重要意义。本研究以来源广泛、多样性丰富的1016份全球水稻核心种质资源为材料,在湖北荆州连续两年考察了种质资源的剑叶大小和单株产量。结果显示,剑叶长、宽、面积和单株产量在两年变异丰富,受环境影响大;剑叶长、宽和面积与单株产量相关性程度较低,说明这些性状的遗传基础不同。利用4.8M高密度SNP基因型数据进行全基因组关联分析,共定位到31个影响水稻剑叶相关性状和单株产量的QTL,其中1个QTL（qFLW4）在两年均定位到,3个位点同时影响多个性状（qFLW4和qFLA4、qFLL6和qFLA6、qFLL10.1和qFLA10）。结合候选区间单倍型分析和生物信息学分析,鉴定到7个候选基因和10个有利等位基因。研究结果为克隆水稻剑叶性状新基因和通过分子标记辅助选择配置不同剑叶相关基因塑造理想株型提供基因资源。 

【文章来源】：植物遗传资源学报. 2020,21(03)北大核心

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

1016份种质的主成分分析

群体的LD衰减图

定位到12个影响水稻剑叶长的QTL,2015年和2016年分别定位到9个和3个，它们位于除第1、3和7染色体外的其他9条染色体上，对表型的贡献率变幅为0.02%～6.84%。其中位于第8染色体的pFLL8.2对表型的贡献最大，能解释表型变异的6.84%。在2015年和2016年分别定位到4个和3个影响水稻剑叶宽的QTL，位于第1、4、5、7、8和11染色体，对表型的平均贡献率为1.76%。其中位于第4染色体的qFLW4在两年间均被定位到，分别解释表型变异的1.45%和1.27%。qFLW11对表型的贡献最大，为4.40%。

【参考文献】：
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本文编号：3082104