黑麦染色体臂特异分子标记的开发
发布时间：2021-04-03 23:23
黑麦（Secale cereale L.）是小麦（Triticum aestivum L.）的近缘种属,其携带的优异基因在小麦育种中扮演了重要角色。快速并准确的鉴定小麦背景中的黑麦染色质可以加快黑麦优异基因在小麦育种中的应用。目前开发出很多黑麦分子标记,但基于PCR和琼脂糖凝胶电泳的黑麦染色体臂特异分子标记还较少。因此,开发更多基于PCR的黑麦染色体臂特异分子标记,尤其是适合于琼脂糖凝胶电泳的分子标记对鉴定小麦背景中的黑麦染色质很有必要。本实验利用SLAF-seq技术开发出新的基于PCR和琼脂糖凝胶电泳的黑麦特异分子标记。同时利用小麦-黑麦单体附加系和单端体附加系将特异分子标记定位到黑麦染色体臂上。再用另外两套小麦-黑麦二体附加系CS-Imperial和Holdfast-KingⅡ对以上黑麦染色体特异分子标记进行通用性验证。研究结果如下:1、从普通小麦绵阳11（MY11）×黑麦Kustro的后代材料中,鉴定出了全套单体附加系MA1RKu-7RKu以及13个单端体附加系MTA1RSKu、MTA1RLKu、MTA2RSKu、MTA2RLKu、MTA3RSKu、MTA4...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：108 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１黑麦Ｋｕｓｔｒｏ标准ＮＤ－ＦＩＳＨ？??注：以?０１ｉｇｏ－Ｓｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??
Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２００（ｒｅｄ）?，Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０（ｒｅｄ）?ａｎｄ?０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－１?（ｒｅｄ）?ａｓ?ｐｒｏｂｅｓ，?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ?ｗｅｒｅ??ｃｏｕｎｔｅｒｓｔａｉｎｅｄ?ｗｉｔｈ?ＤＡＰＩ（ｂｌｕｅ）．??图３中，同理可判断出黑麦染色质，结合图１中Ｋｕｓｔｒｏ染色体标准图中??０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ绿色信号分布，可以判断出该黑麦染色体为黑麦２Ｒ染色体。２Ｒ染色??体为近中着丝粒；短臂和长臂端部均有２个０１ｉｇｏ－ＰＳｃｌｌ９．２－ｌ信号，且短臂上的??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１信号明显强于长臂上的Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１信号。??图３普通小麦绵阳１１－黑麦Ｋｕｓｔｒｏ?２Ｒ单体附加系及２ＲＳ、２ＲＬ单端体附加系??图Ｄ：２Ｒ单体附加系；图Ｅ：２ＲＳ单端体附加系；图Ｆ：小麦－黑麦１ＲＬ单端体附加系。??注：以?０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）、Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??色）和０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－ｌ?（红色）为探针进行ＮＤ－ＦＩＳＨ分析，染色体用ＤＡＰＩ染色（蓝色）。??Ｆｉｇ．３?ＭＹ?１１－Ｋｕｓｔｒｏ?２Ｒ?ｍｏｎｏｓｏｍｉｃ?ａｄｄｉｔｉｏｎ?ｌｉｎｅ?ａｎｄ?２ＲＳ
因此使用（ＡＡＣ）６区分其长短臂。所以，本实验共以Ｏｌｉｇｏ－１１６２、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００、??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０、０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－丨和（ＡＡＣ）６为探针，从小麦－黒麦杂交后代中鉴定出了??普通小麦绵阳１１?－黑麦Ｋｕｓｔｒｏ单体附加系和单端体附加系（图２至图８?）。??０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－ｌ主要在小麦Ａ组和Ｄ组染色体产生杂交信号，不与黑麦染色体产生杂??交信号。??图１黑麦Ｋｕｓｔｒｏ标准ＮＤ－ＦＩＳＨ？??注：以?０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??色）为探针进行ＮＤ－ＦＩＳＨ分析，染色体用ＤＡＰＩ染色（蓝色）。??Ｆｉｇ．ｌ?Ｔｈｅ?ｓｔａｎｄａｒｄ?ＮＤ－ＦＩＳＨ?ｐａｔｔｅｒｎｓ?ｉｎ?Ｋｕｓｔｒｏ??Ｎｏｔｅ：ＮＤ－ＦＩＳＨ?ｕｓｅｄ?Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１?（ｇｒｅｅｎ），?０１ｉｇｏ－ｌ?１６２（ｒｅｄ），?０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００（ｒｅｄ）?ａｎｄ??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０（ｒｅｄ）?ａｓ?ｐｒｏｂｅｓ，?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ?ｗｅｒｅ?ｃｏｕｎｔｅｒｓｔａｉｎｅｄ?ｗｉｔｈ?ＤＡＰＩ（ｂｌｕｅ）．??图２中，通过Ｏｌｉｇｏ－１１６２、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０红色信号可以区分出黑麦??染色质，结合图１中Ｋｕｓｔｒｏ染色体标准图里Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１的绿色信号分布，可以判??断出该黑麦染色体为黑麦１Ｒ染色体。１Ｒ染色体为近中着丝粒
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花单核苷酸多态性标记研究进展[J]. 王振玉,李威,周晓箭,裴小雨,刘艳改,周克海,张文生,孟清芹,王海风,葛勇,李莹,刘俊芳,马雄风,杨代刚. 棉花学报. 2016(04)
[2]Identification and Physical Mapping of New PCR-Based Markers Specific for the Long Arm of Rye（Secale cereale L.） Chromosome 6[J]. Meng Li,Zongxiang Tang,Ling Qiu,Yangyang Wang,Shuyao Tang,Shulan Fu. Journal of Genetics and Genomics. 2016(04)
[3]小麦-黑麦小片段易位的快中子辐照诱导[J]. 杨漫宇,符书兰,陈晓明,张怀琼,唐宗祥,任正隆. 麦类作物学报. 2014(05)
[4]黑麦属植物的遗传学研究与利用[J]. 王林生,宋鹏. 生物学通报. 2010(08)
[5]利用小麦微卫星引物建立黑麦特异标记及其局限性[J]. 田茂洁,唐宗祥. 西华师范大学学报(自然科学版). 2009(01)
[6]小麦SSR引物扩增黑麦及附加系6R染色体特异DNA片段的克隆[J]. 唐宗祥,符书兰,张怀琼,晏本菊,任正隆. 麦类作物学报. 2008(05)
[7]小麦EST-SSR标记的开发和染色体定位及其在追踪黑麦染色体中的应用[J]. 庄丽芳,宋立晓,冯祎高,钱保俐,徐海滨,裴自友,亓增军. 作物学报. 2008(06)
[8]普通小麦近缘物种黑麦1R、簇毛麦1V及鹅观草1Rk#1染色体特异分子标记的筛选[J]. 王春梅,冯祎高,庄丽芳,曹亚萍,亓增军,别同德,曹爱忠,陈佩度. 作物学报. 2007(11)
[9]黑麦基因组特异DNA片段的分离与SCAR标记的建立[J]. 刘成,李光蓉,杨足君,冯娟,周建平,任正隆. 西北植物学报. 2006(12)
[10]黑麦在小麦改良中的应用研究进展[J]. 吴金华,吉万全,李凤珍. 麦类作物学报. 2005(01)
硕士论文
[1]含抗白粉病基因的黑麦染色体小片段向小麦的转移[D]. 符书兰.四川农业大学 2006
本文编号：3117277
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：108 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１黑麦Ｋｕｓｔｒｏ标准ＮＤ－ＦＩＳＨ？??注：以?０１ｉｇｏ－Ｓｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??
Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２００（ｒｅｄ）?，Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０（ｒｅｄ）?ａｎｄ?０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－１?（ｒｅｄ）?ａｓ?ｐｒｏｂｅｓ，?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ?ｗｅｒｅ??ｃｏｕｎｔｅｒｓｔａｉｎｅｄ?ｗｉｔｈ?ＤＡＰＩ（ｂｌｕｅ）．??图３中，同理可判断出黑麦染色质，结合图１中Ｋｕｓｔｒｏ染色体标准图中??０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ绿色信号分布，可以判断出该黑麦染色体为黑麦２Ｒ染色体。２Ｒ染色??体为近中着丝粒；短臂和长臂端部均有２个０１ｉｇｏ－ＰＳｃｌｌ９．２－ｌ信号，且短臂上的??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１信号明显强于长臂上的Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１信号。??图３普通小麦绵阳１１－黑麦Ｋｕｓｔｒｏ?２Ｒ单体附加系及２ＲＳ、２ＲＬ单端体附加系??图Ｄ：２Ｒ单体附加系；图Ｅ：２ＲＳ单端体附加系；图Ｆ：小麦－黑麦１ＲＬ单端体附加系。??注：以?０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）、Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??色）和０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－ｌ?（红色）为探针进行ＮＤ－ＦＩＳＨ分析，染色体用ＤＡＰＩ染色（蓝色）。??Ｆｉｇ．３?ＭＹ?１１－Ｋｕｓｔｒｏ?２Ｒ?ｍｏｎｏｓｏｍｉｃ?ａｄｄｉｔｉｏｎ?ｌｉｎｅ?ａｎｄ?２ＲＳ
因此使用（ＡＡＣ）６区分其长短臂。所以，本实验共以Ｏｌｉｇｏ－１１６２、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００、??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０、０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－丨和（ＡＡＣ）６为探针，从小麦－黒麦杂交后代中鉴定出了??普通小麦绵阳１１?－黑麦Ｋｕｓｔｒｏ单体附加系和单端体附加系（图２至图８?）。??０１ｉｇｏ－ｐＴａ５３５－ｌ主要在小麦Ａ组和Ｄ组染色体产生杂交信号，不与黑麦染色体产生杂??交信号。??图１黑麦Ｋｕｓｔｒｏ标准ＮＤ－ＦＩＳＨ？??注：以?０１ｉｇｏ－ｐＳｃｌｌ９．２－ｌ?（绿色）、Ｏｌｉｇｏ－１１６２?（红色）、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００?（红色）和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０?（红??色）为探针进行ＮＤ－ＦＩＳＨ分析，染色体用ＤＡＰＩ染色（蓝色）。??Ｆｉｇ．ｌ?Ｔｈｅ?ｓｔａｎｄａｒｄ?ＮＤ－ＦＩＳＨ?ｐａｔｔｅｒｎｓ?ｉｎ?Ｋｕｓｔｒｏ??Ｎｏｔｅ：ＮＤ－ＦＩＳＨ?ｕｓｅｄ?Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１?（ｇｒｅｅｎ），?０１ｉｇｏ－ｌ?１６２（ｒｅｄ），?０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００（ｒｅｄ）?ａｎｄ??Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０（ｒｅｄ）?ａｓ?ｐｒｏｂｅｓ，?ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ?ｗｅｒｅ?ｃｏｕｎｔｅｒｓｔａｉｎｅｄ?ｗｉｔｈ?ＤＡＰＩ（ｂｌｕｅ）．??图２中，通过Ｏｌｉｇｏ－１１６２、０１ｉｇｏ－ｐＳｃ２００和Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃ２５０红色信号可以区分出黑麦??染色质，结合图１中Ｋｕｓｔｒｏ染色体标准图里Ｏｌｉｇｏ－ｐＳｃｌ?１９．２－１的绿色信号分布，可以判??断出该黑麦染色体为黑麦１Ｒ染色体。１Ｒ染色体为近中着丝粒
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花单核苷酸多态性标记研究进展[J]. 王振玉,李威,周晓箭,裴小雨,刘艳改,周克海,张文生,孟清芹,王海风,葛勇,李莹,刘俊芳,马雄风,杨代刚. 棉花学报. 2016(04)
[2]Identification and Physical Mapping of New PCR-Based Markers Specific for the Long Arm of Rye（Secale cereale L.） Chromosome 6[J]. Meng Li,Zongxiang Tang,Ling Qiu,Yangyang Wang,Shuyao Tang,Shulan Fu. Journal of Genetics and Genomics. 2016(04)
[3]小麦-黑麦小片段易位的快中子辐照诱导[J]. 杨漫宇,符书兰,陈晓明,张怀琼,唐宗祥,任正隆. 麦类作物学报. 2014(05)
[4]黑麦属植物的遗传学研究与利用[J]. 王林生,宋鹏. 生物学通报. 2010(08)
[5]利用小麦微卫星引物建立黑麦特异标记及其局限性[J]. 田茂洁,唐宗祥. 西华师范大学学报(自然科学版). 2009(01)
[6]小麦SSR引物扩增黑麦及附加系6R染色体特异DNA片段的克隆[J]. 唐宗祥,符书兰,张怀琼,晏本菊,任正隆. 麦类作物学报. 2008(05)
[7]小麦EST-SSR标记的开发和染色体定位及其在追踪黑麦染色体中的应用[J]. 庄丽芳,宋立晓,冯祎高,钱保俐,徐海滨,裴自友,亓增军. 作物学报. 2008(06)
[8]普通小麦近缘物种黑麦1R、簇毛麦1V及鹅观草1Rk#1染色体特异分子标记的筛选[J]. 王春梅,冯祎高,庄丽芳,曹亚萍,亓增军,别同德,曹爱忠,陈佩度. 作物学报. 2007(11)
[9]黑麦基因组特异DNA片段的分离与SCAR标记的建立[J]. 刘成,李光蓉,杨足君,冯娟,周建平,任正隆. 西北植物学报. 2006(12)
[10]黑麦在小麦改良中的应用研究进展[J]. 吴金华,吉万全,李凤珍. 麦类作物学报. 2005(01)
硕士论文
[1]含抗白粉病基因的黑麦染色体小片段向小麦的转移[D]. 符书兰.四川农业大学 2006
本文编号：3117277
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