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大豆类固醇脱氢酶基因家族鉴定及GmDET2a和GmDET2b基因的功能研究

发布时间:2021-04-07 03:13
  油菜素内酯(BRs)是调节植物生长发育的重要激素,而类固醇脱氢酶是催化BR生物合成的关键酶,拟南芥DET2是功能研究比较清楚的类固醇脱氢酶,其基因失去功能突变会导致拟南芥(Arabidopsis thaliana)矮化和育性降低。大豆(Glycine max)是我国重要的粮油作物,已有研究表明,BR具有调节大豆生长发育及耐受逆境能力,但对大豆BR生物合成的分子机制还不清楚。本研究鉴定了大豆类固醇脱氢酶基因家族,并对DET2a与DET2b对养分胁迫以及外源BR的响应进行了分析;对植物类固醇脱氢酶家族进行了进化分析和选择压力分析;最后通过遗传互补实验,证明大豆DET2a和DET2b与拟南芥DET2基因具有相似的功能。主要研究结果如下:(1)大豆基因组共有8个类固醇脱氢酶基因,分别命名为Gm DET2a-2h,其中Gm DET2a和Gm DET2b与拟南芥DET2基因亲缘关系最近,Gm DET2a和Gm DET2b基因,分别位于7号和11号染色体,均编码长度为263个氨基酸残基的蛋白;系统进化树分析表明其与Ps DET2、At DET2有很高的同源性;对105种植物类固醇脱氢酶进行进化分析,... 

【文章来源】:华南农业大学广东省

【文章页数】:75 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

大豆类固醇脱氢酶基因家族鉴定及GmDET2a和GmDET2b基因的功能研究


油菜素内酯基本结构

内含子,基因结构,外显子,拟南芥


个内含子和 3 个外显子(表 3.1;图 3.1)。此外,我们也发现拟南芥基因组含有 7 个类固醇脱氢酶基因。从图 3.1 可以看出AT1G72590 基因含有 6 个外显子和 5 个内含子;AT1G73650 基因含有 9 个外显子和8 个内含子;AT2G16530 基因含有 7 个外显子和 6 个内含子;AT2G38050(AtDET2)基因含有2 个外显子和1 个内含子;AT3G43840基因含有3 个外显子和2 个内含子;AT3G55360 基因含有 4 个外显子和 3 个内含子;AT5G16010 基因含 2 个外显子和 1个内含子(图 3.1)。

进化树,字母,拟南芥,物种


23图 3.2 植物 DET2 蛋白进化树重建注:每个蛋白质符号的前两个字母是该物种名称的简写,Os:Oriza sativa(水稻);At:Arthaliana(拟南芥);Gm:Glycine max(大豆)。AtDET2(At2G38050);GmDET2a(Glyma.07G1GmDET2b(Glyma.11G010000);GmDET2c(Glyma.02G081200);GmDET2d(Glyma.02G0GmDET2e(Glyma.11G11030);GmDET2f(Glyma.14G043500);GmDET2g(Glyma.02g27GmDET2h(Glyma.19g261600)。进化树重建由 Mega6.0 软件完成,采用最大似然法进行定重复 100 次分析,图中所示数字为 bootstrap 值。3.3 植物类固醇脱氢酶基因家族的进化分析

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3122684

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