开花时间QTLs在油菜A基因组上的位置以及与之连锁标记的开发
发布时间：2021-04-19 06:40
开花时间是熟期指示性状,开花时间早的油菜早熟。目前,开花时间QTL的定位研究仍处于粗定位,定位出的开花时间QTL（Quantitative trait locus）与标记之间的距离较大,在进行标记辅助育种时存在偏差。本研究在前期研究的基础上,对A基因组上定位出的与开花时间QTL连锁的SSR标记进行分离、测序,确定了开花时间QTL所在的染色体;根据所在染色体的参考基因组,利用同源系列法开发了与开花时间QTL连锁的标记,并结合BSA法对QTL所在区段进行了加密,选出了与开花时间QTL紧密连锁的标记;在DNA水平和RNA水平上对QTL所在区段内的候选基因进行分析。该项研究为进一步进行标记辅助育种奠定基础。论文主要研究结果如下:（1）利用BSA法对已建图谱上与开花时间QTL连锁的85个SSR标记进行筛选后发现有6对引物在亲本和极端基因池中能扩增出9个特异性的条带,经标记分离、测序后初步确定开花时间QTL FQ10和FQ12在A3染色体上的4785 Kb-11400 Kb的区间内。（2）根据QTLs所在的A3染色体参考基因组NC027759.2上的2500 Kb-12500...
【文章来源】：青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
引物筛选结果
图 2.2 125 号引物的电泳结果Figure 2.2 Electrophoresis results for 125M：100bp DNALadder Marker 1-5：早熟亲本 6-10：晚熟11-15：早花基因池 16-20：晚花基因池 Note:M：100bp DNALadder Marker 1-5：Early flowering paren6-10: Late flowering parents15：Early flowering gene pool 16-20：Late flowering gene PCR 及差异片段的测序酰胺凝胶回收产物为模板进行 PCR 扩增，扩增产物行电泳，并将获得的片段与聚丙烯酰胺上的片段进片段从琼脂糖凝胶上切下来，进行胶回收。其中部2.3 所示。
图 2.3 125-1 二次 PCR 的电泳结果Electrophoresis results for the second：100bp Ladder Marker 1-2：二次 P100bp Ladder Marker 1-2： Secon琼脂糖凝胶回收试剂盒回收。回收分菌液验证的结果如图 2.4 所示
【参考文献】：
期刊论文
[1]油菜产业发展现状及面临的机遇[J]. 谢慧,谭太龙,罗晴,杨柳,陈光辉. 作物研究. 2018(05)
[2]拟南芥成花调控途径的研究进展[J]. 齐仙惠,巫东堂,李改珍,赵军良,李梅兰. 山西农业大学学报(自然科学版). 2018(09)
[3]葡萄无核性状的SSR新分子标记开发及应用[J]. 马亚茹,冯建灿,刘崇怀,樊秀彩,孙海生,姜建福,张颖. 中国农业科学. 2018(13)
[4]水稻抗稻瘟病基因Pi47的精细定位和候选基因分析[J]. 肖湘谊,史学涛,盛浩闻,刘金灵,肖应辉. 作物学报. 2018(07)
[5]中国小麦条锈病菌CYR32和CYR33的毒性及基因型多样性[J]. 姚强,王洁荣,孟岩,詹刚明,黄丽丽,康振生. 植物保护学报. 2018(01)
[6]利用SSR分子标记构建小麦遗传图谱[J]. 张帆,臧明丽. 南方农机. 2017(16)
[7]高丹草AFLP分子遗传连锁图谱的构建[J]. 石悦,于肖夏,于卓,杨东升,姜超,张明飞. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2017(10)
[8]花生遗传图谱构建与QTL定位研究进展（英文）[J]. Addisu Getahun,杨鑫雷,何美敬,崔顺立,穆国俊,刘立峰. 花生学报. 2017(02)
[9]采用AFLP和SSR标记对扁蓿豆遗传多样性进行比较分析（英文）[J]. 李鸿雁,卢新雄,辛霞,李志勇,李俊,黄帆,刘磊. 华北农学报. 2017(02)
[10]白芝麻籽粒油脂、蛋白质及芝麻素含量QTL定位分析[J]. 吴坤,吴文雄,杨敏敏,刘红艳,郝国存,赵应忠. 作物学报. 2017(07)
博士论文
[1]甘蓝型油菜导入系构建、重要农艺性状QTL分析和白花基因克隆[D]. 张豹.华中农业大学 2015
[2]大白菜BAC文库的构建及CO相关基因BAC克隆的筛选与分析[D]. 冯大领.河北农业大学 2011
[3]甘蓝型油菜含油量等重要品质性状的遗传分析与QTL定位[D]. 郭世星.四川农业大学 2011
[4]甘蓝型油菜基因组中开花期QTL的检测和分析[D]. 龙艳.华中农业大学 2008
硕士论文
[1]新型春性甘蓝型油菜开花相关基因的筛选及表达模式研究[D]. 张生萍.青海大学 2017
[2]甘蓝型油菜SNP遗传连锁图谱的构建及品质性状QTL定位[D]. 毛龙.华中农业大学 2013
[3]甘蓝型油菜C6染色体上2个FT基因功能的初步解析[D]. 徐灵芝.华中农业大学 2011
[4]基于粒重差异品系的甘蓝型油菜遗传图谱的初步构建[D]. 郑云峰.郑州大学 2011
[5]甘蓝型油菜白花基因的分子标记及辅助育种研究[D]. 董育红.西北农林科技大学 2005
[6]大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析[D]. 王美.山东农业大学 2003
本文编号：3147042
【文章来源】：青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
引物筛选结果
图 2.2 125 号引物的电泳结果Figure 2.2 Electrophoresis results for 125M：100bp DNALadder Marker 1-5：早熟亲本 6-10：晚熟11-15：早花基因池 16-20：晚花基因池 Note:M：100bp DNALadder Marker 1-5：Early flowering paren6-10: Late flowering parents15：Early flowering gene pool 16-20：Late flowering gene PCR 及差异片段的测序酰胺凝胶回收产物为模板进行 PCR 扩增，扩增产物行电泳，并将获得的片段与聚丙烯酰胺上的片段进片段从琼脂糖凝胶上切下来，进行胶回收。其中部2.3 所示。
图 2.3 125-1 二次 PCR 的电泳结果Electrophoresis results for the second：100bp Ladder Marker 1-2：二次 P100bp Ladder Marker 1-2： Secon琼脂糖凝胶回收试剂盒回收。回收分菌液验证的结果如图 2.4 所示
【参考文献】：
期刊论文
[1]油菜产业发展现状及面临的机遇[J]. 谢慧,谭太龙,罗晴,杨柳,陈光辉. 作物研究. 2018(05)
[2]拟南芥成花调控途径的研究进展[J]. 齐仙惠,巫东堂,李改珍,赵军良,李梅兰. 山西农业大学学报(自然科学版). 2018(09)
[3]葡萄无核性状的SSR新分子标记开发及应用[J]. 马亚茹,冯建灿,刘崇怀,樊秀彩,孙海生,姜建福,张颖. 中国农业科学. 2018(13)
[4]水稻抗稻瘟病基因Pi47的精细定位和候选基因分析[J]. 肖湘谊,史学涛,盛浩闻,刘金灵,肖应辉. 作物学报. 2018(07)
[5]中国小麦条锈病菌CYR32和CYR33的毒性及基因型多样性[J]. 姚强,王洁荣,孟岩,詹刚明,黄丽丽,康振生. 植物保护学报. 2018(01)
[6]利用SSR分子标记构建小麦遗传图谱[J]. 张帆,臧明丽. 南方农机. 2017(16)
[7]高丹草AFLP分子遗传连锁图谱的构建[J]. 石悦,于肖夏,于卓,杨东升,姜超,张明飞. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2017(10)
[8]花生遗传图谱构建与QTL定位研究进展（英文）[J]. Addisu Getahun,杨鑫雷,何美敬,崔顺立,穆国俊,刘立峰. 花生学报. 2017(02)
[9]采用AFLP和SSR标记对扁蓿豆遗传多样性进行比较分析（英文）[J]. 李鸿雁,卢新雄,辛霞,李志勇,李俊,黄帆,刘磊. 华北农学报. 2017(02)
[10]白芝麻籽粒油脂、蛋白质及芝麻素含量QTL定位分析[J]. 吴坤,吴文雄,杨敏敏,刘红艳,郝国存,赵应忠. 作物学报. 2017(07)
博士论文
[1]甘蓝型油菜导入系构建、重要农艺性状QTL分析和白花基因克隆[D]. 张豹.华中农业大学 2015
[2]大白菜BAC文库的构建及CO相关基因BAC克隆的筛选与分析[D]. 冯大领.河北农业大学 2011
[3]甘蓝型油菜含油量等重要品质性状的遗传分析与QTL定位[D]. 郭世星.四川农业大学 2011
[4]甘蓝型油菜基因组中开花期QTL的检测和分析[D]. 龙艳.华中农业大学 2008
硕士论文
[1]新型春性甘蓝型油菜开花相关基因的筛选及表达模式研究[D]. 张生萍.青海大学 2017
[2]甘蓝型油菜SNP遗传连锁图谱的构建及品质性状QTL定位[D]. 毛龙.华中农业大学 2013
[3]甘蓝型油菜C6染色体上2个FT基因功能的初步解析[D]. 徐灵芝.华中农业大学 2011
[4]基于粒重差异品系的甘蓝型油菜遗传图谱的初步构建[D]. 郑云峰.郑州大学 2011
[5]甘蓝型油菜白花基因的分子标记及辅助育种研究[D]. 董育红.西北农林科技大学 2005
[6]大白菜遗传图谱构建及抗TuMV的QTL分析[D]. 王美.山东农业大学 2003
本文编号：3147042
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3147042.html
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