基于SNP标记的糯玉米种质资源遗传多样性分析

发布时间：2021-05-12 06:05

　　为了提高糯玉米种质资源的利用效率,挖掘优异糯玉米种质资源、改良糯玉米品种,利用（Single nucleotide polymorphism,SNP）芯片技术对44份不同来源的糯玉米自交系和5份分别代表中国玉米5大类群的普通玉米自交系进行全基因组扫描。结果表明,34 257个SNP标记在49份玉米自交系中的多态性信息含量（polymorphism information content,PIC）为0.02～0.56,平均含量为0.32;最小等位基因频率（minor allele frequency,MAF）≥0.03。49份玉米自交系间的状态一致性（identity-by-state,IBS）变幅为0.59～0.99,平均为0.68。基于IBS利用Neighbor-joining（NJ）聚类分析方法,将49份自交系划分为5个类群,分别包含19份、9份、4份、9份和3份材料,其中系谱来源不清晰的糯玉米自交系被划分至不同类群,明确了它们的亲缘关系。 

【文章来源】：玉米科学. 2020,28(03)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 基因组DNA提取
    1.3 基因型鉴定
    1.4 数据处理与分析
2 结果与分析
    2.1 SNP数据的质量控制
    2.2 SNP位点多态性分析
    2.3 聚类分析
3 结论与讨论
    3.1 玉米SNP标记多态性分析
    3.2 糯玉米自交系遗传多样性分析


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SNP芯片揭示中国玉米育种种质的遗传多样性与群体遗传结构[J]. 赵久然,李春辉,宋伟,王元东,张如养,王继东,王凤格,田红丽,王蕊.  中国农业科学. 2018(04)
[2]基于SNP标记技术的糯玉米种质遗传多样性分析[J]. 史亚兴,卢柏山,宋伟,徐丽,赵久然.  华北农学报. 2015(03)
[3]利用SNP标记划分甜玉米自交系的杂种优势类群[J]. 卢柏山,史亚兴,宋伟,徐丽,赵久然.  玉米科学. 2015(01)
[4]我国糯玉米种质资源的研究现状[J]. 聂术君,陈发波.  安徽农业科学. 2014(03)
[5]西双版纳糯玉米地方品种遗传多样性分析[J]. 吴斌,李建,柯洁,熊志文,胡美玲,胡坤,刘坚5.  玉米科学. 2013(02)
[6]基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构[J]. 刘志斋,吴迅,刘海利,李永祥,李清超,王凤格,石云素,宋燕春,宋伟彬,赵久然,赖锦盛,黎裕,王天宇.  中国农业科学. 2012(11)
[7]基于SSR标记的江苏沿江地区糯玉米种质资源遗传多样性研究[J]. 刘丽君,张丹,薛林,李建,徐辰武.  江苏农业学报. 2011(04)
[8]我国糯玉米种质研究进展[J]. 张胜恒,易红华,蔡治荣.  玉米科学. 2008(03)
[9]我国糯玉米育种现状及发展对策[J]. 丁照华,孟昭东,张发军,汪黎明,孙琪,张庆伟.  玉米科学. 2006(03)
[10]十年来中国玉米杂种优势群及其模式变化的分析[J]. 滕文涛,曹靖生,陈彦惠,刘向辉,景希强,张发军,李建生.  中国农业科学. 2004(12)

硕士论文
[1]利用SSR和SNP标记研究玉米自交系的遗传多样性[D]. 吴金凤.吉林农业大学 2014



本文编号：3182880