基于高密度SNP遗传图谱的粳稻芽期耐低温QTL鉴定

发布时间：2021-06-05 22:29

　　水稻直播由于省时、省工和节约成本而备受农户关注。然而,芽期耐冷性不强致使现行推广的许多优良水稻品种不适于直播生产。因此,挖掘鉴定芽期耐冷位点,为后续的辅助育种提供基因资源就日益受到重视。本研究利用丽江新团黑谷和沈农265构建的重组自交系群体及其重测序构建的包含2818个bin标记的遗传图谱对水稻芽期的耐冷性进行QTL定位分析。共检测到5个芽期耐冷QTL,分布在水稻的1号、3号、9号和11号染色体上,增效等位基因均来自耐冷亲本丽江新团黑谷。这些QTL的LOD值的范围从3.05到24.01,表型贡献率为8.0%～53.5%。其中,表型贡献率最大的主效QTL是qCTB11b,位于11号染色体长臂端的21.24 Mb～22.03 Mb之间,物理图谱区间为790 kb。随后利用"选择作图"的策略进行了QTL验证和累加效应分析,明确了可以通过QTL的累加聚合实现芽期耐冷能力的遗传改良,聚合的增效QTL越多,耐冷能力提升越明显。上述研究结果不仅可以增强人们对芽期水稻耐冷能力遗传基础的认识和理解,也可以为后续直播品种的遗传改良提供理论依据和技术指导。 

【文章来源】：作物学报. 2020,46(08)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

丽江新团黑谷-沈农265重组自交系群体的物理图谱(A)和基因型(B)

水稻芽期冷害评价等级标准

课题组前期的研究表明,丽江新团黑谷与沈农265在多个不同时期的耐冷相关性状上存在显著差异,丽江新团黑谷具有更优秀的综合耐冷特性。本研究中,2个亲本在2°C低温处理2 d并恢复10 d后,沈农265的平均芽期耐冷等级仅为0.813,而丽江新团黑谷高达3.188(图3和图4),差异达到极显著水平。重组自交系群体的芽期耐冷性等级分布范围为0.313～3.688,平均值为1.699,标准差为0.767。整体上呈现近似正态分布,并表现出较强的超亲分离(图4)。图4 重组自交系群体的芽期耐冷性分布

【参考文献】：
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本文编号：3213038