甜菜SSR分子标记的开发应用及差异代谢产物分析
发布时间：2021-06-17 00:40
甜菜属于苋科（Amaranthaceae）甜菜属（Beta L.）,一、二年及多年生草本植物。根据用途可将生产中的栽培型甜菜分糖甜菜、根甜菜、叶甜菜及饲料甜菜。甜菜具有较高的经济价值,如糖甜菜是工业制糖的原材料,世界上食糖的30%是由糖甜菜生产出来的。根甜菜和叶甜菜食用价值及观赏价值高,是非常好的园林结合生产的资源植物。为了能够很好的开发利用甜菜资源,本研究通过利用新开发的高多态性SSR标记,对搜集到的甜菜种质资源进行了遗传多样性分析,同时对甜菜的代谢产物进行研究,旨在为我国甜菜种质资源深度开发利用及育种研究奠定研究基础。主要研究结果如下:（1）利用三种栽培型甜菜的5个甜菜品种,通过全基因重测序开发甜菜基因组InDel标记。获得InDel标记的分布特征结果为:5个甜菜品种中分别发现了 343138、317057、281435、312444和316595个InDel位点。主要分布在基因间区,约占全部位点的55%,其次是基因区。在基因区内,大部分的InDel位点分布在内含子中,蛋白质编码区中分布的InDel位点最少。InDel位点的数量随着InDel长度的增加而减少（基因间区除外）,在基因...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：139 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２叶甜菜盆栽??Ｆｉｇ?１?－２?Ｐｏｔ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｏｆ?ｌｅａｆ?ｂｅｅｔ??（１－３）
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【参考文献】：
期刊论文
[1]红甜菜葡萄红枣复合果蔬汁饮料的研制[J]. 郭庆晖,张琨霖,李王强,张静,郭庆彬,李贞景. 农产品加工. 2020(02)
[2]基于气相色谱-质谱的拟靶向代谢组学方法分析大米中脂肪酸[J]. 王希越,明明,连丽丽,张浩,娄大伟. 色谱. 2020(02)
[3]甜菜综合利用研究进展[J]. 董宇飞,吴玉梅,刘乃新. 轻工科技. 2019(11)
[4]分子标记在园林植物育种中的应用[J]. 李冰敏. 现代园艺. 2019(15)
[5]基于SSR、InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析[J]. 刘蕊,刘乃新,吴玉梅,吴则东,兴旺,王秋红. 中国农学通报. 2019(22)
[6]Betatrophin基因多态性与2型糖尿病的相关性[J]. 丁艺,李昊翔,徐梦娇,袁婧,赵丽,王东,杨玲,袁国跃. 江苏大学学报(医学版). 2019(01)
[7]简化基因组测序技术研究进展[J]. 胡亚亚,刘兰服,冀红柳,韩美坤,焦伟静,高志远,马志民. 江苏师范大学学报(自然科学版). 2018(04)
[8]木荷基因组SSR位点开发及初步分析[J]. 林艳,何紫迪,毛积鹏,蒋开彬,王金榜,黄少伟. 热带作物学报. 2018(09)
[9]基于全基因组序列的马铃薯SSR标记开发与连锁图谱加密[J]. 肖桂林,徐竹清,曹红菊,李竟才,夏军辉,宋波涛. 园艺学报. 2018(08)
[10]红甜菜果醋生产工艺的研究[J]. 张忠平,杨旭. 中国调味品. 2018(08)
博士论文
[1]玉米—大刍草分离群体代谢组遗传结构解析[D]. 李坤.华中农业大学 2019
[2]甜菜素植物—红苋菜中过氧化氢酶—酚氧化酶的鉴定[D]. 滕晓鹿.中国农业大学 2016
[3]小麦BSR-Seq基因定位技术体系的建立和应用与粗山羊草3DS染色体臂序列分析[D]. 谢菁忠.中国农业大学 2016
[4]基于SSR、SNP和形态学标记的甘薯种质资源遗传多样性研究[D]. 杨新笋.中国农业大学 2016
[5]油菜溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶基因分离及酶活性分析[D]. 郑倩.华中农业大学 2011
[6]若干皂苷衍生物的合成和生物活性研究及天然产物Betavulgaroside Ⅲ的全合成[D]. 朱石磊.中国海洋大学 2008
硕士论文
[1]基于UPLC-QTOF/MS方法的小麦发芽过程的代谢产物分析[D]. 王丽娜.中国农业科学院 2019
[2]三种黄酮类化合物抑制a-葡萄糖苷酶活性和晚期糖基化终末产物生成作用研究[D]. 何勇林.辽宁大学 2019
[3]瓜蒌皮总皂苷的提取及生物学功能的研究[D]. 刘明.阜阳师范学院 2018
[4]菠菜高密度遗传图谱构建及性别决定基因X/Y的精细定位[D]. 范桂彦.中国农业科学院 2017
[5]茄科植物资源调查与园林应用评价[D]. 林华.福建农林大学 2015
[6]柚类果实柠檬苦素类化合物组分鉴别、分离纯化及生物活性研究[D]. 向羽.浙江大学 2014
[7]磁珠富集法开发菜豆SSR引物[D]. 丁立红.华中农业大学 2013
[8]菊花栽培品种遗传多样性的AFLP分析及SSR分子标记的开发[D]. 刘路贤.河南大学 2013
[9]散沫花素-HPMA共聚抗癌药物和支化聚乙烯载体合成[D]. 贾宗.西北师范大学 2013
[10]甜菜单体附加系传递和遗传变异特性分析[D]. 唐国强.黑龙江大学 2007
本文编号：3234106
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：139 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２叶甜菜盆栽??Ｆｉｇ?１?－２?Ｐｏｔ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｏｆ?ｌｅａｆ?ｂｅｅｔ??（１－３）
?东北林业大学博士学位论文???＿伽＾＇＇?滅ｋ＃遽??图１－３作为地被植物用于园林景观??Ｆｉｇ?１－３?Ｕｓｅｄ?ａｓ?ｇｒｏｕｎｄ?ｃｏｖｅｒ?ｉｎ?ｌａｎｄｓｃａｐｅ??图丨－４特色叶甜菜与其他植物搭配造景??Ｆｉｇ?１－４?Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ?ｌｅａｆ?ｂｅｅｔ?ｗｉｔｈ?ｏｔｈｅｒ?ｐｌａｎｔｓ?ｔｏ?ｃｒｅａｔｅ?ｔｈｅ?ｓｃｅｎｅ??ｍ??图１－５利用地形组合盆栽围合形成小环境??Ｆｉｇｌ－５?Ｔｈｅ?ｓｍａｌｌ?ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ?ｉｓ?ｆｏｒｍｅｄ?ｂｙ?ｕｓｉｎｇ?ｔｈｅ?ｔｅｒｒａｉｎ?ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ?ｐｏｔｔｅｄ?ｅｎｃｌｏｓｕｒｅ??－６?－??
ｎＤｅｌ位点，这些ＩｎＤｅｌ位点几乎都??会引起编码蛋白质的显著变化。它们中约有１?５００个ＩｎＤｅｌ位点导致了删除或插入，??这将插入或删除编码蛋白质的一个或几个氨基酸。大约有６００？８００个ＩｎＤｅｌ位点??导致了碱基移位，低于１００个ＩｎＤｅｌ位点导致了终止密码子的产生和失去。导致移??码突变或终止密码子的产生和失去的ＩｎＤｅｌ位点将大大改变编码蛋白质的序列。??用ＩｎＤｅｌ位点的长度对不同长度ＩｎＤｅｌ位点占位点总数的百分比作图，得到??ＩｎＤｅｌ位点在全基因组中的长度分布（图２－２），随着ＩｎＤｅｌ位点长度的增加，ＩｎＤｅｌ??位点的数量将会减少。在基因编码区内，当ＩｎＤｅｌ片段的长度３?ｂｐ时，数量将远??远超过其他长度的ＩｎＤｅｌ位点（图２－１）。??１８００?ｔ??ＯＺＴ０００５８９??１６００?＇?■ＺＴ０００５４９??１４００?－?Ｓ／Ｔ０００２８６??１２００－?麵細??｜?ＯＫＷＳＩ２３！??｜?１０００?＇??５?８００?－ｆｙ｜??６００?＇?Ｉ??４００?－?Ｉ??０．１，１．?，ＭＷ．?－ｆｌｌ．ｎＢｉ．?Ｉ?ｍ?＿?Ｍｌ．?‘一滅?．［ｔｆｌ．??Ｉ?２?３?４?５?６?７?８?９?１０?１１?１２?１３?１４?１５?１６?１７?１８?１９?２０?＞２０??ＩｎＤｅｌ?ｌｅｎｇｔｈ?（ｂｐ）??图２－１基因编码区ＩｎＤｅｌ长度分布??Ｆｉｇ．?２－１?ＩｎＤｅｌ?ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｇｅｎｅ?ｃｏｄｉｎｇ?ｒｅｇｉｏｎ??－６?－??
【参考文献】：
期刊论文
[1]红甜菜葡萄红枣复合果蔬汁饮料的研制[J]. 郭庆晖,张琨霖,李王强,张静,郭庆彬,李贞景. 农产品加工. 2020(02)
[2]基于气相色谱-质谱的拟靶向代谢组学方法分析大米中脂肪酸[J]. 王希越,明明,连丽丽,张浩,娄大伟. 色谱. 2020(02)
[3]甜菜综合利用研究进展[J]. 董宇飞,吴玉梅,刘乃新. 轻工科技. 2019(11)
[4]分子标记在园林植物育种中的应用[J]. 李冰敏. 现代园艺. 2019(15)
[5]基于SSR、InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析[J]. 刘蕊,刘乃新,吴玉梅,吴则东,兴旺,王秋红. 中国农学通报. 2019(22)
[6]Betatrophin基因多态性与2型糖尿病的相关性[J]. 丁艺,李昊翔,徐梦娇,袁婧,赵丽,王东,杨玲,袁国跃. 江苏大学学报(医学版). 2019(01)
[7]简化基因组测序技术研究进展[J]. 胡亚亚,刘兰服,冀红柳,韩美坤,焦伟静,高志远,马志民. 江苏师范大学学报(自然科学版). 2018(04)
[8]木荷基因组SSR位点开发及初步分析[J]. 林艳,何紫迪,毛积鹏,蒋开彬,王金榜,黄少伟. 热带作物学报. 2018(09)
[9]基于全基因组序列的马铃薯SSR标记开发与连锁图谱加密[J]. 肖桂林,徐竹清,曹红菊,李竟才,夏军辉,宋波涛. 园艺学报. 2018(08)
[10]红甜菜果醋生产工艺的研究[J]. 张忠平,杨旭. 中国调味品. 2018(08)
博士论文
[1]玉米—大刍草分离群体代谢组遗传结构解析[D]. 李坤.华中农业大学 2019
[2]甜菜素植物—红苋菜中过氧化氢酶—酚氧化酶的鉴定[D]. 滕晓鹿.中国农业大学 2016
[3]小麦BSR-Seq基因定位技术体系的建立和应用与粗山羊草3DS染色体臂序列分析[D]. 谢菁忠.中国农业大学 2016
[4]基于SSR、SNP和形态学标记的甘薯种质资源遗传多样性研究[D]. 杨新笋.中国农业大学 2016
[5]油菜溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶基因分离及酶活性分析[D]. 郑倩.华中农业大学 2011
[6]若干皂苷衍生物的合成和生物活性研究及天然产物Betavulgaroside Ⅲ的全合成[D]. 朱石磊.中国海洋大学 2008
硕士论文
[1]基于UPLC-QTOF/MS方法的小麦发芽过程的代谢产物分析[D]. 王丽娜.中国农业科学院 2019
[2]三种黄酮类化合物抑制a-葡萄糖苷酶活性和晚期糖基化终末产物生成作用研究[D]. 何勇林.辽宁大学 2019
[3]瓜蒌皮总皂苷的提取及生物学功能的研究[D]. 刘明.阜阳师范学院 2018
[4]菠菜高密度遗传图谱构建及性别决定基因X/Y的精细定位[D]. 范桂彦.中国农业科学院 2017
[5]茄科植物资源调查与园林应用评价[D]. 林华.福建农林大学 2015
[6]柚类果实柠檬苦素类化合物组分鉴别、分离纯化及生物活性研究[D]. 向羽.浙江大学 2014
[7]磁珠富集法开发菜豆SSR引物[D]. 丁立红.华中农业大学 2013
[8]菊花栽培品种遗传多样性的AFLP分析及SSR分子标记的开发[D]. 刘路贤.河南大学 2013
[9]散沫花素-HPMA共聚抗癌药物和支化聚乙烯载体合成[D]. 贾宗.西北师范大学 2013
[10]甜菜单体附加系传递和遗传变异特性分析[D]. 唐国强.黑龙江大学 2007
本文编号：3234106
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