甘蓝型油菜开花时间的遗传及株高和开花时间的QTL定位
发布时间：2021-06-20 16:02
甘蓝型油菜是我国重要的油料作物,是我国食用植物油的主要来源。株高和开花时间是当前油菜育种的两个重要性状,适当的降低株高和缩短开花时间,对于提高油菜抗倒伏性和早熟性,推动油菜机械化收获,促进油菜产业发展具有战略意义。本课题组从2015年开始对甘蓝型油菜株高和开花时间进行深入研究,选用两个甘蓝型油菜的高代自交系YG-1（高杆晚熟）和72-27-1-2（矮杆早熟）为亲本,利用其六世代群体研究了株高性状的遗传;并利用SSR标记初步构建了甘蓝型油菜株高和开花时间的遗传图谱,对株高与开花时间QTL进行初步定位（刘霞2018）。本研究在前期研究基础上,一方面继续开展了开花时间及相关性状的数量遗传分析,另一方面,采用SLAF-seq技术对F2群体进行测序,构建株高和开花时间高密度遗传图谱,进一步对株高与开花时间QTL进行定位、预测候选基因,以期为油菜矮化和早熟育种提供理论和技术基础。本研究取得的主要结果如下:1.开花时间的“主基因+多基因”遗传分析构建的六世代遗传群体种植于杨凌和三原两点,调查其现蕾时间（ST）、抽薹时间（BT）和开花时间（FT）,应用植物数量性状“主基因+多基因...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 研究背景
1.2 株高和开花的遗传研究
1.2.1 影响植物株高的主要因素
1.2.2 开花的遗传研究
1.3 植物数量性状主基因+多基因遗传分析研究
1.3.1 主基因+多基因遗传分析研究思路
1.3.2 开花时间的主基因+多基因遗传分析研究进展
1.4 芸薹属遗传图谱的研究进展
1.4.1 油菜遗传图谱的研究
1.4.2 SLAF-seq技术构建遗传图谱的研究
1.5 油菜株高及相关性状和开花时间的QTL研究进展
1.5.1 油菜株高及相关性状QTL研究进展
1.5.2 油菜开花时间的QTL研究进展
1.6 本研究的目的意义
第二章 甘蓝型油菜开花时间的主基因+多基因遗传分析
2.1 试验材料
2.2 试验方法
2.2.1 材料种植与田间管理
2.2.2 性状调查及方法
2.2.3 数据分析
2.3 结果与分析
2.3.1 六世代群体各性状统计性状及次数分布
2.3.2 开花时间及关联性状主基因+多基因遗传分析
2.4 讨论
2.4.1 甘蓝型油菜开花时间及关联性状的遗传分析
2.4.2 甘蓝型油菜开花时间遗传与QTL比较分析
2.5 结论
第三章 基于SLAF-seq技术的甘蓝型油菜高密度遗传图谱的构建
3.1 试验材料
3.2 试验方法
3.2.1 DNA的提取与检测
3.2.2 酶切方案设计
3.2.3 重测序建库测序
3.2.4 SLAF建库测序
3.2.5 测序数据统计与评估
3.2.6 SNP标记的开发与基因分型
3.2.7 遗传图谱构建
3.3 结果与分析
3.3.1 基因组DNA质量检测
3.3.2 生物信息学分析
3.3.3 遗传图谱构建
3.3.4 绘制连锁群
3.3.5 遗传图谱基本信息统计
3.3.6 遗传图谱评估
3.4 讨论
3.4.1 SLAF-seq技术在SNP标记开发的可行性
3.4.2 甘蓝型高密度遗传图谱的构建
3.4.3 偏分离标记分析
3.5 结论
第四章 甘蓝型油菜株高与开花时间的QTL定位及候选基因分析
4.1 试验材料
4.2 试验方法
4.2.1 性状调查与分析
4.2.2 QTL定位方法与软件
4.2.3 候选基因注释
4.2.4 候选基因分析
4.2.5 SCAR标记的开发
4.3 结果与分析
4.3.1 表型统计
4.3.2 相关性分析
4.3.3 QTL定位分析
4.3.4 QTL物理位置一致性比较
4.3.5 候选基因注释
4.3.6 候选基因分析
4.3.7 候选基因表达分析
4.3.8 SCAR标记的开发
4.4 讨论
4.4.1 株高及相关性状QTL定位结果比较
4.4.2 开花时间及相关性状QTL定位结果比较
4.4.3 本研究试验创新与不足
4.5 结论
第五章 全文结论
5.1 开花时间的“主基因+多基因”遗传分析
5.2 株高与开花时间的表型统计与相关性分析
5.3 基于SLAF-seq技术的甘蓝型油菜遗传图谱构建
5.4 株高与开花时间性状的QTL定位
5.5 候选基因预测与分析
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝型油菜株高及其相关性状的主基因+多基因遗传分析[J]. 刘霞,张冰冰,马兵,赵娜,田正书,秦梦凡,王阳,郎丽娜,刘亚萍,黄镇,徐爱遐. 西北农业学报. 2018(04)
[2]基于SSR标记的四倍体鸭茅遗传图谱加密[J]. 唐露,金梦雅,黄琳凯,张旭,赵欣欣,张新全. 中国农业科学. 2018(05)
[3]高粱株型性状数量遗传分析[J]. 李延玲,白晓倩,于澎湃,高建明,裴忠有,罗峰,孙守钧. 华北农学报. 2018(01)
[4]甘蓝型油菜茎秆强度性状的主基因+多基因遗传分析[J]. 李洪戈,张丽萍,伍晓明. 中国油料作物学报. 2018(01)
[5]切花小菊主要分枝性状的混合遗传分析[J]. 杨信程,苏江硕,吴洋洋,张飞,管志勇,陈发棣,房伟民. 南京农业大学学报. 2018(03)
[6]基于SLAF-seq技术构建亚麻高密度遗传图谱[J]. 高凤云,斯钦巴特尔,张辉,贾霄云,伊六喜,周宇,李强,叶应福,侯建华. 中国油料作物学报. 2017(03)
[7]Rapeseed research and production in China[J]. Qiong Hu,Wei Hua,Yan Yin,Xuekun Zhang,Lijiang Liu,Jiaqin Shi,Yongguo Zhao,Lu Qin,Chang Chen,Hanzhong Wang. The Crop Journal. 2017(02)
[8]甘蓝型油菜抗寒相关基因的QTL初步定位[J]. 赵娜,郎丽娜,卢虹,刘璐,刘亚萍,刘霞,田正书,王阳,黄镇,徐爱遐. 华北农学报. 2016(05)
[9]胡麻粗脂肪含量的主基因+多基因遗传分析[J]. 化青春,赵利,王利民,赵玮,党照,张建平,党占海. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2016(11)
[10]大粒型水稻材料粒型性状的QTL定位[J]. 汪欲鹏,王根发,武志峰,王智权,石庆华,潘晓华,吴自明. 核农学报. 2016(12)
博士论文
[1]辣椒高密度遗传图谱构建与小孢子胚胎发生QTL定位[D]. 张晓芬.中国农业大学 2018
[2]利用高密度SNP图谱定位甘蓝型油菜含油量及角粒相关性状QTL[D]. 陈军.华中农业大学 2017
[3]金花菜的遗传多样性及连锁图谱构建[D]. 任海龙.扬州大学 2017
[4]梅花高密度遗传图谱构建及部分观赏性状QTL分析[D]. 张杰.北京林业大学 2016
[5]春性甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建及开花时间的QTL定位分析[D]. 柳海东.青海大学 2015
[6]甘蓝型油菜导入系构建、重要农艺性状QTL分析和白花基因克隆[D]. 张豹.华中农业大学 2015
[7]牡丹高密度遗传图谱构建及重要性状QTL分析[D]. 蔡长福.北京林业大学 2015
[8]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[9]甘蓝型油菜硼高效基因的定位[D]. 赵尊康.华中农业大学 2013
[10]甘蓝型油菜遗传图谱构建及农艺、品质性状的QTL定位[D]. 王峰.湖南农业大学 2009
硕士论文
[1]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[2]甘蓝型油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细定位[D]. 蔡静.华中农业大学 2016
[3]利用SLAF-seq技术构建高密度丹参连锁图谱[D]. 刘甜.山东农业大学 2016
[4]油菜开花期QTL分析以及三个主效QTL的精细定位[D]. 熊化鑫.浙江师范大学 2016
[5]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[6]甘蓝型油菜花期调控基因标记开发与开花时间QTL定位[D]. 谭勇俊.湖南农业大学 2013
[7]甘蓝型油菜主要株型性状的遗传分析和QTL初步定位[D]. 张倩.西南大学 2013
[8]结球甘蓝抽薹性状的遗传分析及分子标记研究[D]. 郭辉.西南大学 2012
[9]油菜早熟品种生理生化特性研究[D]. 王必庆.湖南农业大学 2011
[10]不结球白菜抽薹性状生化特性和分子标记及遗传模型分析[D]. 杜正香.南京农业大学 2011
本文编号：3239506
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 研究背景
1.2 株高和开花的遗传研究
1.2.1 影响植物株高的主要因素
1.2.2 开花的遗传研究
1.3 植物数量性状主基因+多基因遗传分析研究
1.3.1 主基因+多基因遗传分析研究思路
1.3.2 开花时间的主基因+多基因遗传分析研究进展
1.4 芸薹属遗传图谱的研究进展
1.4.1 油菜遗传图谱的研究
1.4.2 SLAF-seq技术构建遗传图谱的研究
1.5 油菜株高及相关性状和开花时间的QTL研究进展
1.5.1 油菜株高及相关性状QTL研究进展
1.5.2 油菜开花时间的QTL研究进展
1.6 本研究的目的意义
第二章 甘蓝型油菜开花时间的主基因+多基因遗传分析
2.1 试验材料
2.2 试验方法
2.2.1 材料种植与田间管理
2.2.2 性状调查及方法
2.2.3 数据分析
2.3 结果与分析
2.3.1 六世代群体各性状统计性状及次数分布
2.3.2 开花时间及关联性状主基因+多基因遗传分析
2.4 讨论
2.4.1 甘蓝型油菜开花时间及关联性状的遗传分析
2.4.2 甘蓝型油菜开花时间遗传与QTL比较分析
2.5 结论
第三章 基于SLAF-seq技术的甘蓝型油菜高密度遗传图谱的构建
3.1 试验材料
3.2 试验方法
3.2.1 DNA的提取与检测
3.2.2 酶切方案设计
3.2.3 重测序建库测序
3.2.4 SLAF建库测序
3.2.5 测序数据统计与评估
3.2.6 SNP标记的开发与基因分型
3.2.7 遗传图谱构建
3.3 结果与分析
3.3.1 基因组DNA质量检测
3.3.2 生物信息学分析
3.3.3 遗传图谱构建
3.3.4 绘制连锁群
3.3.5 遗传图谱基本信息统计
3.3.6 遗传图谱评估
3.4 讨论
3.4.1 SLAF-seq技术在SNP标记开发的可行性
3.4.2 甘蓝型高密度遗传图谱的构建
3.4.3 偏分离标记分析
3.5 结论
第四章 甘蓝型油菜株高与开花时间的QTL定位及候选基因分析
4.1 试验材料
4.2 试验方法
4.2.1 性状调查与分析
4.2.2 QTL定位方法与软件
4.2.3 候选基因注释
4.2.4 候选基因分析
4.2.5 SCAR标记的开发
4.3 结果与分析
4.3.1 表型统计
4.3.2 相关性分析
4.3.3 QTL定位分析
4.3.4 QTL物理位置一致性比较
4.3.5 候选基因注释
4.3.6 候选基因分析
4.3.7 候选基因表达分析
4.3.8 SCAR标记的开发
4.4 讨论
4.4.1 株高及相关性状QTL定位结果比较
4.4.2 开花时间及相关性状QTL定位结果比较
4.4.3 本研究试验创新与不足
4.5 结论
第五章 全文结论
5.1 开花时间的“主基因+多基因”遗传分析
5.2 株高与开花时间的表型统计与相关性分析
5.3 基于SLAF-seq技术的甘蓝型油菜遗传图谱构建
5.4 株高与开花时间性状的QTL定位
5.5 候选基因预测与分析
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蓝型油菜株高及其相关性状的主基因+多基因遗传分析[J]. 刘霞,张冰冰,马兵,赵娜,田正书,秦梦凡,王阳,郎丽娜,刘亚萍,黄镇,徐爱遐. 西北农业学报. 2018(04)
[2]基于SSR标记的四倍体鸭茅遗传图谱加密[J]. 唐露,金梦雅,黄琳凯,张旭,赵欣欣,张新全. 中国农业科学. 2018(05)
[3]高粱株型性状数量遗传分析[J]. 李延玲,白晓倩,于澎湃,高建明,裴忠有,罗峰,孙守钧. 华北农学报. 2018(01)
[4]甘蓝型油菜茎秆强度性状的主基因+多基因遗传分析[J]. 李洪戈,张丽萍,伍晓明. 中国油料作物学报. 2018(01)
[5]切花小菊主要分枝性状的混合遗传分析[J]. 杨信程,苏江硕,吴洋洋,张飞,管志勇,陈发棣,房伟民. 南京农业大学学报. 2018(03)
[6]基于SLAF-seq技术构建亚麻高密度遗传图谱[J]. 高凤云,斯钦巴特尔,张辉,贾霄云,伊六喜,周宇,李强,叶应福,侯建华. 中国油料作物学报. 2017(03)
[7]Rapeseed research and production in China[J]. Qiong Hu,Wei Hua,Yan Yin,Xuekun Zhang,Lijiang Liu,Jiaqin Shi,Yongguo Zhao,Lu Qin,Chang Chen,Hanzhong Wang. The Crop Journal. 2017(02)
[8]甘蓝型油菜抗寒相关基因的QTL初步定位[J]. 赵娜,郎丽娜,卢虹,刘璐,刘亚萍,刘霞,田正书,王阳,黄镇,徐爱遐. 华北农学报. 2016(05)
[9]胡麻粗脂肪含量的主基因+多基因遗传分析[J]. 化青春,赵利,王利民,赵玮,党照,张建平,党占海. 西北农林科技大学学报(自然科学版). 2016(11)
[10]大粒型水稻材料粒型性状的QTL定位[J]. 汪欲鹏,王根发,武志峰,王智权,石庆华,潘晓华,吴自明. 核农学报. 2016(12)
博士论文
[1]辣椒高密度遗传图谱构建与小孢子胚胎发生QTL定位[D]. 张晓芬.中国农业大学 2018
[2]利用高密度SNP图谱定位甘蓝型油菜含油量及角粒相关性状QTL[D]. 陈军.华中农业大学 2017
[3]金花菜的遗传多样性及连锁图谱构建[D]. 任海龙.扬州大学 2017
[4]梅花高密度遗传图谱构建及部分观赏性状QTL分析[D]. 张杰.北京林业大学 2016
[5]春性甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建及开花时间的QTL定位分析[D]. 柳海东.青海大学 2015
[6]甘蓝型油菜导入系构建、重要农艺性状QTL分析和白花基因克隆[D]. 张豹.华中农业大学 2015
[7]牡丹高密度遗传图谱构建及重要性状QTL分析[D]. 蔡长福.北京林业大学 2015
[8]甘蓝型油菜株型与角果相关性状的QTL分析[D]. 漆丽萍.华中农业大学 2014
[9]甘蓝型油菜硼高效基因的定位[D]. 赵尊康.华中农业大学 2013
[10]甘蓝型油菜遗传图谱构建及农艺、品质性状的QTL定位[D]. 王峰.湖南农业大学 2009
硕士论文
[1]甘蓝型油菜株高遗传及株高和开花时间的QTL定位[D]. 刘霞.西北农林科技大学 2018
[2]甘蓝型油菜一个主效开花期QTLqFTc2-1的精细定位[D]. 蔡静.华中农业大学 2016
[3]利用SLAF-seq技术构建高密度丹参连锁图谱[D]. 刘甜.山东农业大学 2016
[4]油菜开花期QTL分析以及三个主效QTL的精细定位[D]. 熊化鑫.浙江师范大学 2016
[5]甘蓝型油菜株高和角果长及其相关性状QTL定位[D]. 阴涛.西南大学 2015
[6]甘蓝型油菜花期调控基因标记开发与开花时间QTL定位[D]. 谭勇俊.湖南农业大学 2013
[7]甘蓝型油菜主要株型性状的遗传分析和QTL初步定位[D]. 张倩.西南大学 2013
[8]结球甘蓝抽薹性状的遗传分析及分子标记研究[D]. 郭辉.西南大学 2012
[9]油菜早熟品种生理生化特性研究[D]. 王必庆.湖南农业大学 2011
[10]不结球白菜抽薹性状生化特性和分子标记及遗传模型分析[D]. 杜正香.南京农业大学 2011
本文编号：3239506
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