水稻m 6 A结合蛋白的筛选和功能研究

发布时间：2021-07-12 19:05

　　在已发现的mRNA修饰中,N6-甲基腺嘌呤（N⁶-methyladnosine,m⁶A）是一种最广泛的转录后修饰形式。m⁶A修饰具有位点特异性,主要发生于基序RRACH（R=G or A,H=A,C or U）内的腺嘌呤碱基上。研究表明,m⁶A修饰可能影响mRNA的运输、翻译、剪接和降解,并参与调节生物体的生长发育进程,其研究已成为生命学科热点之一。但目前关于m⁶A的研究大部分集中在哺乳动物和真菌,植物中m⁶A修饰的研究相对较少。m⁶A对于mRNA功能的调控主要通过其结合蛋白来完成。目前发现的m⁶A结合蛋白主要为包含YTH结构域的家族蛋白。为了明确mRNA中m⁶A修饰对水稻生长发育的影响,本文从该修饰位点的结合蛋白入手,探索这类修饰在水稻发育及胁迫应答中的可能作用。采用同源序列比对的方法,我们在水稻基因组中找到了12个可能的m⁶A结合蛋白基因,它们分别分布于7条染色体上... 

【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

真核生物mRNA上的甲基化修饰ξ引自[15]

图 2 真核生物 mRNA 中甲基化修饰ξ引自[18] 饰嘌呤ξm6A 是指在腺嘌呤碱基第 6 位 N 原子上发生的是以 SAM 作为甲基供体ˋ在甲基转移酶的催化下完成手段ˋ发现 m6A 修饰的腺嘌呤占 mRNA 中腺嘌呤总量饰趋向于发生在保守区段 RRACHξR=GorA,H=A,Corm6A 甲基化倾向于分布在 mRNA 的编码区 3 非编码区区域[21,22]ˋ且不同区域富集的基序ξmotif 均与m6A保守研究表明真核生物 mRNA 的 m6A 甲基化是一个动态可转移酶ξ编码器ˋwriter 实现甲基化[23-27]ˋ并通过 m6A完成去甲基化[28-30] 在体内ˋ被 m6A 修饰的 RNA 区段可reader 特异性识别ˋ进而介导 m6A 发挥其生物调控功

图 3 mRNA 中可逆性 m6A 甲基化修饰ξ改自[45] m6A 甲基转移酶（编码器）mRNA 通过 m6A 甲基转移酶ξ编码器ˋwriter MT-A2(Methyltransferase-A2) ilms’tumor 1-associating protein 和 KIAA1429 实现甲基化 METTL3ξMethyltransferase like 3 是 MT-A2 组分中的 70 kDa 的催化亚基序列中包含了 SAM 结合位点和有催化功能的 DPPWξAsp-Pro-Pro-Trp 结构METTL 在包括人在内的多个物种中保守存在并广泛表达ˋ研究表明ˋMETT陷会导致细胞中 m6A 水平显著降低ˋ进而影响减数分裂ˋ导致生物体发育异METTL14 为 m6A 甲基转移酶 MT-A2 的另一催化亚基 METTL14 和 METT结构相似ˋ也含有 SAM 结合位点和有 EPPLξGlu–Pro–Pro–Leu 活性位点[26, m6A 形成时ˋMETTL3 和 METTL14 以 1:1 的比例形成二聚体ˋ增强甲基化

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3280485