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一种冬虫夏草寄主昆虫线粒体基因组的测序及序列分析

发布时间:2021-07-27 20:40
  冬虫夏草是由冬虫夏草菌侵染青藏高原高寒草甸中的蝙蝠蛾幼虫而形成的菌虫复合体,是一种珍贵的中药材。蝙蝠蛾科昆虫幼虫是冬虫夏草菌的优势寄主。由于青藏高原不同地域间气候和地形的多样性,其寄主昆虫也具有丰富的物种多样性,是研究蝙蝠蛾昆虫甚至鳞翅目昆虫进化的理想材料。线粒体是存在于大多数真核细胞中的一种半自主性细胞器,是细胞的产能车间,记录着生物从简单到复杂、从低等到高等进化过程中丰富的生物进化信息,因此,是研究物种起源与进化的有力资源。线粒体基因具有基因组大小比较小、进化速率快、基因组成和结构都比较保守及母系遗传和有限重组等特征。近年来,对冬虫夏草菌寄主昆虫线粒体基因组的研究已成为一大热点。到目前为止,NCBI网站已公布了9个蝙蝠蛾昆虫的线粒体基因组,其中7个为冬虫夏草菌的寄主昆虫。本研究报道另外一种冬虫夏草菌寄主昆虫的线粒体基因组,并与已报道的蝙蝠蛾科昆虫的线粒体基因组进行比较分析。本研究选取了采集于四川省黑水县的蝙蝠蛾幼虫(Thitarodes sp.)作为实验材料,参考已发表的7个冬虫夏草菌寄主昆虫的线粒体基因组序列设计引物,并通过多次聚合酶链式反应和基因克隆,拼接该冬虫夏草寄主昆虫的线... 

【文章来源】:山西大学山西省

【文章页数】:58 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

一种冬虫夏草寄主昆虫线粒体基因组的测序及序列分析


主要的技术路线

结构图,线粒体基因组,结构图,基因


第二章 一种冬虫夏草寄主昆虫线粒体基因组测序及分析均为典型的 ATN;基因 nad2、cox1、cox2、nad3 和 nad5 以单独的碱基 T 作为终止密码子,其它的 PCGs 的终止密码子均为 TAA。此线粒体基因组的基因与真菌线粒体基因有所差异,不完全位于同一条 DNA 链上,其中有 8 个 tRNA 基因(tRNA-GlntRNA-Cys tRNA-Tyr tRNA-Phe tRNA-His tRNA-Pro tRNA-Leu1 tRNA-Val)、4 个蛋白编码基因(nad5 nad4 nad4L nad1)及两个 rRNA 基因(rnl rns)均位于轻链上,其余的基因位于重链上。

蛋白编码基因,系统发育树


一种冬虫夏草寄主昆虫线粒体基因组的测序及序列分析22图2-2 基于13个蛋白编码基因构建的系统发育树Figure 2-2 Phylogenetic tree based on 13 protein-coding genes.注:红色三角标注为外群(outgroup);绿色圆圈标注为本论文研究对象。

【参考文献】:
期刊论文
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[3]冬虫夏草菌和蛹虫草菌的研究现状、问题及展望[J]. 张姝,张永杰,SHRESTHA Bhushan,徐建平,王成树,刘杏忠.  菌物学报. 2013(04)
[4]高等植物线粒体基因组研究进展[J]. 张晓,张锐,侯思宇,史计,郭三堆.  中国农业科技导报. 2011(04)
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[7]中国蝠蛾属(鳞翅目,蝙蝠蛾科)现行分类系统的修订[J]. 邹志文,刘昕,张古忍.  湖南科技大学学报(自然科学版). 2010(01)
[8]中国牛亚科家畜GH基因编码区序列的遗传变异研究[J]. 耿荣庆,常洪,李永红,冀德君,常春芳,王兰萍,常国斌.  畜牧兽医学报. 2008(12)
[9]冬虫夏草寄主昆虫的种类和分布研究概况[J]. 刘飞,伍晓丽,尹定华,陈仕江,曾纬.  重庆中草药研究. 2006(01)
[10]线粒体基因组的遗传与进化研究进展[J]. 潘宝平,卜文俊.  生物学通报. 2005(08)

硕士论文
[1]冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究[D]. 侯俊秀.山西大学 2016
[2]低温真菌线粒体基因组测序及注释分析[D]. 霍丽琴.山西大学 2015
[3]北方花鳅线粒体基因组测序及鳅类系统发育分析[D]. 郭忠超.陕西师范大学 2011



本文编号:3306504

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