利用水稻MAGIC群体和种质资源关联分析定位抽穗期和株高QTL
发布时间：2021-08-06 13:30
抽穗期和株高是水稻重要的农艺性状,抽穗期的长短决定水稻在不同生态区域的地区适应性和季节适应性。在不降低抗倒伏能力的情况下,适当增加株高可以有效增加生物量,从而进一步提高水稻产量。本研究利用多亲本高代互交系（multi-parents advanced generation inter-cross,MAGIC）群体（2个4亲本群体DC1、DC2和1个8亲本群体8way）及其复合群体DC12（DC1+DC2）和RMPRIL（DC1+DC2+8way）作为遗传定位群体,结合55K高通量SNP基因型数据进行关联分析定位影响水稻抽穗期和株高的QTL。同时从源于全球89个国家和地区遗传变异丰富的3000份水稻种质资源中选取2412份种质材料（包括1386份籼稻和674份粳稻）,结合40万SNP标记进行关联分析,并对MAGIC群体的定位结果进行验证。主要研究结果如下:1.2015年和2016年分别在江西萍乡和广东深圳采集3个MAGIC群体的抽穗期和株高数据,结合Rice 55K SNP芯片进行基因分型,利用关联分析方法检测到3个影响抽穗期的主效QTL（qHD3、qHD6和qHD8）,分别位于第3、6...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本MAGIC群体设计路线
16 图 2.1 MAGIC 群体在不同环境下抽穗期和株高分布图Fig2.1 Frequency distribution of heading date (HD) and plant height (PH) in MAGIC populationsacross different environments
22 图 2.2 5 个 MAGIC 群体在不同环境下关联分析定位到影响抽穗期 QTL 的 Manhattan 图Fig.2.2 Manhattan plot of association mapping of heading date (HD) in the five populations across different environmentsA1-A4、B1-B4、C1-C4、D1-D4 和 E1-E4 分别表示 DC1、DC2、DC12、8way 和 RMPRIL 群体在 15JX、16JX、15SZ 和 16SZ 4 个环境下的定位结果；水平实线表示全基因组显著性阀值 P <10-5。DC1 (A1-A4), DC2 (B1-B4), 8way (C1-C4), DC12 (D1-D4) and RMPRIL (E1-E4) represent five populations in 15JX,16JX, 15SZ and 16SZ. Horizontal solid line indicates the genome-wide significance threshold P <.10-5.
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用高世代回交群体定位水稻抽穗期和株高QTL[J]. 冯玉涛,蒋海潮,高冠军,张庆路,何予卿. 分子植物育种. 2014(01)
[2]LHD1,an Allele of DTH8/Ghd8,Controls Late Heading Date in Common Wild Rice （Oryza rufipogon）[J]. Xiaodong Dai,Younian Ding,Lubin Tan,Yongcai Fu,Fengxia Liu,Zuofeng Zhu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Ping Gu,Hongwei Cai and Chuanqing Sun State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,National Evaluation Centre for Agricultural Wild Plants (Rice),Laboratory of Crop Heterosis and Utilization of the Ministry of Education,Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement,Department of Plant Genetics and Breeding,China Agricultural University,Beijing 100193,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[3]水稻抽穗期遗传与分子调控机理研究进展[J]. 胡时开,苏岩,叶卫军,郭龙彪. 中国水稻科学. 2012(03)
[4]水稻株高QTL定位及精确性分析[J]. 张志勇,黄育民,张凯,王侯聪,江良荣. 厦门大学学报(自然科学版). 2008(01)
[5]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用[J]. 王荣焕,王天宇,黎裕. 植物遗传资源学报. 2007(03)
[6]利用2个相关群体定位和比较水稻株高与抽穗期QTL[J]. 刘文俊,王令强,何予卿. 华中农业大学学报. 2007(02)
[7]不同环境条件下水稻株高的QTL定位分析[J]. 叶少平,李杰勤,张启军,赵兵,李平. 四川农业大学学报. 2006(01)
[8]作物分子设计育种[J]. 万建民. 作物学报. 2006(03)
[9]水稻品种生育期的遗传和基因定位[J]. 邓晓建,周开达,李仁端,王文明,朱立煌. 四川农业大学学报. 2001(02)
[10]水稻长穗颈高秆隐性基因eui2的遗传及其微卫星分析[J]. 杨蜀岚,杨仁崔,曲雪萍,章清杞,黄荣华,王斌. 植物学报. 2001(01)
硕士论文
[1]籼稻矮秆多蘖突变体的遗传分析与基因定位研究[D]. 徐斌.厦门大学 2007
本文编号：3325864
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
亲本MAGIC群体设计路线
16 图 2.1 MAGIC 群体在不同环境下抽穗期和株高分布图Fig2.1 Frequency distribution of heading date (HD) and plant height (PH) in MAGIC populationsacross different environments
22 图 2.2 5 个 MAGIC 群体在不同环境下关联分析定位到影响抽穗期 QTL 的 Manhattan 图Fig.2.2 Manhattan plot of association mapping of heading date (HD) in the five populations across different environmentsA1-A4、B1-B4、C1-C4、D1-D4 和 E1-E4 分别表示 DC1、DC2、DC12、8way 和 RMPRIL 群体在 15JX、16JX、15SZ 和 16SZ 4 个环境下的定位结果；水平实线表示全基因组显著性阀值 P <10-5。DC1 (A1-A4), DC2 (B1-B4), 8way (C1-C4), DC12 (D1-D4) and RMPRIL (E1-E4) represent five populations in 15JX,16JX, 15SZ and 16SZ. Horizontal solid line indicates the genome-wide significance threshold P <.10-5.
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用高世代回交群体定位水稻抽穗期和株高QTL[J]. 冯玉涛,蒋海潮,高冠军,张庆路,何予卿. 分子植物育种. 2014(01)
[2]LHD1,an Allele of DTH8/Ghd8,Controls Late Heading Date in Common Wild Rice （Oryza rufipogon）[J]. Xiaodong Dai,Younian Ding,Lubin Tan,Yongcai Fu,Fengxia Liu,Zuofeng Zhu,Xianyou Sun,Xuewen Sun,Ping Gu,Hongwei Cai and Chuanqing Sun State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,National Evaluation Centre for Agricultural Wild Plants (Rice),Laboratory of Crop Heterosis and Utilization of the Ministry of Education,Beijing Key Laboratory of Crop Genetic Improvement,Department of Plant Genetics and Breeding,China Agricultural University,Beijing 100193,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2012(10)
[3]水稻抽穗期遗传与分子调控机理研究进展[J]. 胡时开,苏岩,叶卫军,郭龙彪. 中国水稻科学. 2012(03)
[4]水稻株高QTL定位及精确性分析[J]. 张志勇,黄育民,张凯,王侯聪,江良荣. 厦门大学学报(自然科学版). 2008(01)
[5]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用[J]. 王荣焕,王天宇,黎裕. 植物遗传资源学报. 2007(03)
[6]利用2个相关群体定位和比较水稻株高与抽穗期QTL[J]. 刘文俊,王令强,何予卿. 华中农业大学学报. 2007(02)
[7]不同环境条件下水稻株高的QTL定位分析[J]. 叶少平,李杰勤,张启军,赵兵,李平. 四川农业大学学报. 2006(01)
[8]作物分子设计育种[J]. 万建民. 作物学报. 2006(03)
[9]水稻品种生育期的遗传和基因定位[J]. 邓晓建,周开达,李仁端,王文明,朱立煌. 四川农业大学学报. 2001(02)
[10]水稻长穗颈高秆隐性基因eui2的遗传及其微卫星分析[J]. 杨蜀岚,杨仁崔,曲雪萍,章清杞,黄荣华,王斌. 植物学报. 2001(01)
硕士论文
[1]籼稻矮秆多蘖突变体的遗传分析与基因定位研究[D]. 徐斌.厦门大学 2007
本文编号：3325864
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3325864.html
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