棉花耐涝渍关键基因的鉴定及表达验证
发布时间：2021-08-08 17:47
本论文以耐涝渍棉花品种“中棉所12”和易涝渍品种“国抗棉1号”为材料,首先应用iTRAQ定量蛋白质组学技术,在GO分析、Pathway代谢通路分析的基础上,系统、全面地研究了棉花在涝渍胁迫下根系蛋白质的表达差异,初步鉴定棉花耐涝渍关键相关基因。然后通过实时荧光定量PCR技术,在mRNA水平上验证这些棉花耐涝渍候选基因的表达。本论文取得了以下主要研究结果:1.通过使用iTRAQ定量蛋白质组学技术,在“中棉所12”和“国抗棉1号”2个不同耐涝渍能力品种中共筛选到407个差异表达蛋白。2.GO分析结果显示,就差异蛋白所涉及的棉花生物过程而言,大约25%的差异蛋白与代谢过程（Metabolic processes）有关,与细胞过程（cellular process）相关的蛋白大约占24%,很重要的是,其中与细胞适应刺激反应（response to stimulus）有关的蛋白大约占12%;就差异蛋白所涉及的细胞组分而言,其中与细胞（cell）有关的蛋白大约占30%,与细胞组分（cell part）相关的蛋白大约占29%,涉及细胞器（organelle）的差异蛋白大约占22%,而与细胞器组分（o...
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：53 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
标准曲线
表 2-1 样品蛋白质浓度Table 2-1 Protein concentration of samples名 浓度（μg/ μL） 体积（μL） 总（漂浮） 3.50 200 （盆栽） 1.62 100 （漂浮） 1.76 200 （盆栽） 2.62 200 电泳结果是所测样品蛋白 SDS-PAGE 电泳结果。从图中可以看出，本实验白质条带较为清楚，说明干扰电泳的其他杂质较少，提取出来的满足后续 iTRAQ 定量蛋白质组学分析需要。
图 2-3 质谱仪所分析鉴定到的肽段数据统计Fig.2-3 Statistical analysis of peptide data identified by mass spectrometry-3是本实验样品的质谱和肽段数据统计图，从图中可以得知，本实验总谱数量是62323个，其中肽段个数3745个，肽段序列3154个，差异蛋白
【参考文献】：
期刊论文
[1]实时荧光定量PCR技术研究进展及其应用[J]. 王玉倩,薛秀花. 生物学通报. 2016(02)
[2]番茄、辣椒对苗期涝渍胁迫的生理响应研究[J]. 李伟光,陈汇林,吴翠玲,邹海平. 中国果菜. 2015(06)
[3]玉米NADP+-异柠檬酸脱氢酶基因克隆和特征分析[J]. 袁进成,宋晋辉,瓮巧云,马海莲,王凌云,刘颖慧. 植物生理学报. 2015(04)
[4]棉花对淹水胁迫的适应机制[J]. 张艳军,董合忠. 棉花学报. 2015(01)
[5]基于定量蛋白质组学的棉花耐涝渍基因初步鉴定[J]. 王丽,周仲华,郑顺利,陈金湘,王峰,李瑞莲,张昊. 棉花学报. 2014(04)
[6]ATP-柠檬酸裂解酶研究进展[J]. 刘家仪,李杨瑞,杨丽涛. 南方农业学报. 2014(02)
[7]溶藻弧菌二氢硫辛酰胺脱氢酶基因克隆及其生物信息学分析[J]. 庞欢瑛,陈立明,蔡佳,汤菊芬,王蓓,吴灶和,简纪常. 广东海洋大学学报. 2014(01)
[8]不同生育期水分胁迫对夏玉米叶片光合生理特性的影响[J]. 田琳,谢晓金,包云轩,胡继超,於俐,王金鑫. 中国农业气象. 2013(06)
[9]棉花渍害恢复的生理指示指标探讨[J]. 胡江龙,郭林涛,王友华,周治国. 中国农业科学. 2013(21)
[10]iTRAQ标记技术及其在微生物比较蛋白质组学中的研究进展[J]. 袁建丰,李林林,孙敏华,董嘉文,胡奇林. 中国预防兽医学报. 2013(10)
博士论文
[1]盐胁迫下陆地棉根蛋白差异表达分析及耐盐相关基因的功能鉴定[D]. 李武.河南大学 2016
[2]棉花新型光敏不育系的育性特征及其花药蛋白质组学分析[D]. 刘记.西北农林科技大学 2015
[3]棉花响应黄萎病菌分子机制的蛋白质组学研究及HDTF1基因的功能鉴定[D]. 高巍.华中农业大学 2014
[4]三种植物通气组织的形成与细胞程序性死亡的关系[D]. 倪细炉.西北大学 2014
[5]棉花亚棉A细胞质雄性不育系的不育机理研究[D]. 赵海燕.山西农业大学 2013
[6]彩色棉纤维比较蛋白质组学研究及花色素还原酶GhANR基因的鉴定[D]. 李艳军.石河子大学 2013
[7]西藏野生大麦耐盐种质的发掘及其耐盐机制研究[D]. 吴德志.浙江大学 2012
[8]棉花、烟草响应低温胁迫的差异蛋白质组学研究[D]. 盖英萍.山东农业大学 2008
[9]棉花纤维发育的蛋白质组学研究[D]. 刘康.南京农业大学 2006
硕士论文
[1]苹果细胞质苹果酸脱氢酶基因的抗逆功能鉴定及机制研究[D]. 王庆杰.山东农业大学 2016
[2]长叶红砂抗坏血酸过氧化物酶基因的表达特性及功能分析[D]. 姚靖波.内蒙古大学 2015
[3]棉花纤维起始及伸长过程中的比较蛋白质组学研究[D]. 王红岩.华中农业大学 2014
[4]黄萎病菌侵染对感病棉花品种叶片蛋白质组的影响[D]. 沈凡瑞.中国农业科学院 2014
[5]中国棉花进口贸易研究[D]. 梁云.石河子大学 2013
[6]淹水胁迫对大豆生长和生理特性的影响[D]. 韩亮亮.南京农业大学 2011
[7]蕾花期涝渍胁迫后棉花（Gossypium hirsutum L.）恢复生长的生理机制研究[D]. 杨云.南京农业大学 2011
[8]棉花纤维不同发育阶段蛋白质组的比较分析[D]. 王娟.新疆农业大学 2010
[9]陆地棉双隐性核雄性不育系及可育系花药差异蛋白质组研究[D]. 任燕.南京农业大学 2009
[10]DHAR基因植物表达载体的构建及转化仙客来研究[D]. 张栋.西北农林科技大学 2008
本文编号：3330400
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：53 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
标准曲线
表 2-1 样品蛋白质浓度Table 2-1 Protein concentration of samples名 浓度（μg/ μL） 体积（μL） 总（漂浮） 3.50 200 （盆栽） 1.62 100 （漂浮） 1.76 200 （盆栽） 2.62 200 电泳结果是所测样品蛋白 SDS-PAGE 电泳结果。从图中可以看出，本实验白质条带较为清楚，说明干扰电泳的其他杂质较少，提取出来的满足后续 iTRAQ 定量蛋白质组学分析需要。
图 2-3 质谱仪所分析鉴定到的肽段数据统计Fig.2-3 Statistical analysis of peptide data identified by mass spectrometry-3是本实验样品的质谱和肽段数据统计图，从图中可以得知，本实验总谱数量是62323个，其中肽段个数3745个，肽段序列3154个，差异蛋白
【参考文献】：
期刊论文
[1]实时荧光定量PCR技术研究进展及其应用[J]. 王玉倩,薛秀花. 生物学通报. 2016(02)
[2]番茄、辣椒对苗期涝渍胁迫的生理响应研究[J]. 李伟光,陈汇林,吴翠玲,邹海平. 中国果菜. 2015(06)
[3]玉米NADP+-异柠檬酸脱氢酶基因克隆和特征分析[J]. 袁进成,宋晋辉,瓮巧云,马海莲,王凌云,刘颖慧. 植物生理学报. 2015(04)
[4]棉花对淹水胁迫的适应机制[J]. 张艳军,董合忠. 棉花学报. 2015(01)
[5]基于定量蛋白质组学的棉花耐涝渍基因初步鉴定[J]. 王丽,周仲华,郑顺利,陈金湘,王峰,李瑞莲,张昊. 棉花学报. 2014(04)
[6]ATP-柠檬酸裂解酶研究进展[J]. 刘家仪,李杨瑞,杨丽涛. 南方农业学报. 2014(02)
[7]溶藻弧菌二氢硫辛酰胺脱氢酶基因克隆及其生物信息学分析[J]. 庞欢瑛,陈立明,蔡佳,汤菊芬,王蓓,吴灶和,简纪常. 广东海洋大学学报. 2014(01)
[8]不同生育期水分胁迫对夏玉米叶片光合生理特性的影响[J]. 田琳,谢晓金,包云轩,胡继超,於俐,王金鑫. 中国农业气象. 2013(06)
[9]棉花渍害恢复的生理指示指标探讨[J]. 胡江龙,郭林涛,王友华,周治国. 中国农业科学. 2013(21)
[10]iTRAQ标记技术及其在微生物比较蛋白质组学中的研究进展[J]. 袁建丰,李林林,孙敏华,董嘉文,胡奇林. 中国预防兽医学报. 2013(10)
博士论文
[1]盐胁迫下陆地棉根蛋白差异表达分析及耐盐相关基因的功能鉴定[D]. 李武.河南大学 2016
[2]棉花新型光敏不育系的育性特征及其花药蛋白质组学分析[D]. 刘记.西北农林科技大学 2015
[3]棉花响应黄萎病菌分子机制的蛋白质组学研究及HDTF1基因的功能鉴定[D]. 高巍.华中农业大学 2014
[4]三种植物通气组织的形成与细胞程序性死亡的关系[D]. 倪细炉.西北大学 2014
[5]棉花亚棉A细胞质雄性不育系的不育机理研究[D]. 赵海燕.山西农业大学 2013
[6]彩色棉纤维比较蛋白质组学研究及花色素还原酶GhANR基因的鉴定[D]. 李艳军.石河子大学 2013
[7]西藏野生大麦耐盐种质的发掘及其耐盐机制研究[D]. 吴德志.浙江大学 2012
[8]棉花、烟草响应低温胁迫的差异蛋白质组学研究[D]. 盖英萍.山东农业大学 2008
[9]棉花纤维发育的蛋白质组学研究[D]. 刘康.南京农业大学 2006
硕士论文
[1]苹果细胞质苹果酸脱氢酶基因的抗逆功能鉴定及机制研究[D]. 王庆杰.山东农业大学 2016
[2]长叶红砂抗坏血酸过氧化物酶基因的表达特性及功能分析[D]. 姚靖波.内蒙古大学 2015
[3]棉花纤维起始及伸长过程中的比较蛋白质组学研究[D]. 王红岩.华中农业大学 2014
[4]黄萎病菌侵染对感病棉花品种叶片蛋白质组的影响[D]. 沈凡瑞.中国农业科学院 2014
[5]中国棉花进口贸易研究[D]. 梁云.石河子大学 2013
[6]淹水胁迫对大豆生长和生理特性的影响[D]. 韩亮亮.南京农业大学 2011
[7]蕾花期涝渍胁迫后棉花（Gossypium hirsutum L.）恢复生长的生理机制研究[D]. 杨云.南京农业大学 2011
[8]棉花纤维不同发育阶段蛋白质组的比较分析[D]. 王娟.新疆农业大学 2010
[9]陆地棉双隐性核雄性不育系及可育系花药差异蛋白质组研究[D]. 任燕.南京农业大学 2009
[10]DHAR基因植物表达载体的构建及转化仙客来研究[D]. 张栋.西北农林科技大学 2008
本文编号：3330400
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3330400.html
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