陆地棉机采株型主要性状解析及QTL定位
发布时间：2021-08-16 17:05
本研究以中571（Z571）和中棉所49（CCRI 49）两个株型有明显差异的陆地棉品种为材料配制F1、F2及F2:3组合,对株型性状与激素之间的生理生化机理进行研究,同时分析株型性状与产量和品质间的相关性,初步明确差异品种间激素的时空变化和株型性状对产量和品质之间的影响,并通过简化基因组测序技术（GBS）和F2及F2:3两年田间表型数据相关联,采用复合区间作图法对控制株型性状的数量性状位点（QTL）定位,为选育适合机械化采收的陆地棉品种提供理论参考,为棉花分子标记辅助育种提供技术支持。取得的结果如下:1)株型性状的植物激素调控机制研究。在现蕾期到打顶后时期,中部叶片吲哚乙酸（IAA）含量急剧下降,玉米素（ZA）含量增加,ZA/IAA含量比值低,诱导腋芽分化,促进CCRI 49营养枝数增多;下部叶片中赤霉素（GA3）含量各时期均低,抑制CCRI 49果枝始节高和株高伸长生长;中部和下部叶片中脱落酸（ABA）含量、GA3/ABA含量比值在初花期到打顶前高,抑制CCRI 49主茎和果枝始节高度伸长生长。2)株型性状与产量和品质相关性分析。F2:3群体株系材料间农艺性状发生了显著分离,且后代...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
GBS实验流程
的位点的基因型，子代分型结果见附件 2。表 4. 3 标记开发类型Table 4.3 Marker typesaMarkerTypebMarker totalef×eg 21nn×np 3,830ab×cc 3aa×bb 12,853ab×cd 0lm×ll 3,800hk×hk 8,755cc×ab 1Total markers 29,263a 亲本基因型（如 ab × cc，ab 和 cc 代表父本和母本基因型）b 所有开发标记类型及数量。aParental genotypes (i.e., ab × cc, where ab and cc genotypes represent the male and female parents);bTotal number of markers of each type.
图 4. 3 aa×bb 型标记在整个基因组上的分布Figure 4.3 Distribution of aa×bb markers in the whole genome表棉花 26 条染色体，刻度单位用厘摩表示，在内圈的红色直方图表示多态性 SNP 的密度，峰越高ost ring, with a scale shown in cM, represents each of the 26 cotton chromosomes. The red histogram in thity of polymorphic SNPs; higher peaks represent greater SNP density.图谱的构建及验证整性覆盖情况差的标记进行过滤，最终获得 7296 个候选标记。使用候选标记进行偏分离过滤，偏分离设定的阈值 p 为 0.001。经过偏分离5886 个。使用 Perl 脚本，对完全相同的标记划分成 Bin 标记，去掉严得 SNP 标记 5571 个，Bin 标记 3178 个。本实验基因图谱长度为 382间的平均距离为 0.678 cM（表 4.4、图 4.4）。在 3187 个 Bin 标记中，6 个位于 D 基因组。其中，14 号连锁群上，前 12 个标记中含有 3 个较36.115 cM，36.115-61.545 cM 以及 70.723-101.883 cM，这些较大的 g距离。此外，第 14 号染色体所包含的 Bin 标记所占比例最高，14 号，占 14 号染色体总标记数 55.54%。12 号染色体所含标记最少，只有 1连锁图谱 gap 大于 20 cM 的只有 11 个，其中位于 A 基因组上的有 1
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花纤维品质改良相关基因研究进展[J]. 杨君,马峙英,王省芬. 中国农业科学. 2016(22)
[2]陆地棉品种(系)资源株型性状与皮棉产量的关系[J]. 付远志,李鹏云,王浩丽,王清连,李成奇. 西南农业学报. 2016(09)
[3]中国与中亚五国棉花合作潜力分析及模式探究[J]. 王力,苗海民,温雅. 新疆大学学报（哲学·人文社会科学版）. 2016(05)
[4]棉花中赤霉素和脱落酸的时空变化[J]. 齐海坤,严根土,王宁,杨杰,黄群. 中国棉花. 2016(07)
[5]黄河流域北部棉区棉花缩节胺化学封顶技术[J]. 黎芳,王希,王香茹,杜明伟,周春江,尹晓芳,徐东永,卢怀玉,田晓莉,李召虎. 中国农业科学. 2016(13)
[6]棉花玉米素（Zeatin）和吲哚乙酸（Indoleacetic acid）的时空变化[J]. 齐海坤,严根土,王宁,杨杰,黄群. 中国棉花. 2016(06)
[7]中日水稻品种杂交后代的株型性状与产量和品质的关系[J]. 徐海,宫彦龙,夏原野,杜志敏,闫志强,王华杰,陈温福,徐正进. 中国水稻科学. 2016(03)
[8]黄河三角洲地区棉花机械化采收配套农艺技术要点[J]. 王智华,苗兴武. 中国棉花. 2016(04)
[9]密度对不同株型海岛棉产量和品质的影响[J]. 白玉林,杜斌,刘霞,王承强,李小童,杨勇,王绎衡. 棉花科学. 2016(02)
[10]黄河流域机采棉植株性状的筛选[J]. 齐海坤,严根土,王宁,苏桂兰,杨杰,许庆华,周红,黄群. 中国棉花. 2016(03)
本文编号：3346062
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：66 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
GBS实验流程
的位点的基因型，子代分型结果见附件 2。表 4. 3 标记开发类型Table 4.3 Marker typesaMarkerTypebMarker totalef×eg 21nn×np 3,830ab×cc 3aa×bb 12,853ab×cd 0lm×ll 3,800hk×hk 8,755cc×ab 1Total markers 29,263a 亲本基因型（如 ab × cc，ab 和 cc 代表父本和母本基因型）b 所有开发标记类型及数量。aParental genotypes (i.e., ab × cc, where ab and cc genotypes represent the male and female parents);bTotal number of markers of each type.
图 4. 3 aa×bb 型标记在整个基因组上的分布Figure 4.3 Distribution of aa×bb markers in the whole genome表棉花 26 条染色体，刻度单位用厘摩表示，在内圈的红色直方图表示多态性 SNP 的密度，峰越高ost ring, with a scale shown in cM, represents each of the 26 cotton chromosomes. The red histogram in thity of polymorphic SNPs; higher peaks represent greater SNP density.图谱的构建及验证整性覆盖情况差的标记进行过滤，最终获得 7296 个候选标记。使用候选标记进行偏分离过滤，偏分离设定的阈值 p 为 0.001。经过偏分离5886 个。使用 Perl 脚本，对完全相同的标记划分成 Bin 标记，去掉严得 SNP 标记 5571 个，Bin 标记 3178 个。本实验基因图谱长度为 382间的平均距离为 0.678 cM（表 4.4、图 4.4）。在 3187 个 Bin 标记中，6 个位于 D 基因组。其中，14 号连锁群上，前 12 个标记中含有 3 个较36.115 cM，36.115-61.545 cM 以及 70.723-101.883 cM，这些较大的 g距离。此外，第 14 号染色体所包含的 Bin 标记所占比例最高，14 号，占 14 号染色体总标记数 55.54%。12 号染色体所含标记最少，只有 1连锁图谱 gap 大于 20 cM 的只有 11 个，其中位于 A 基因组上的有 1
【参考文献】：
期刊论文
[1]棉花纤维品质改良相关基因研究进展[J]. 杨君,马峙英,王省芬. 中国农业科学. 2016(22)
[2]陆地棉品种(系)资源株型性状与皮棉产量的关系[J]. 付远志,李鹏云,王浩丽,王清连,李成奇. 西南农业学报. 2016(09)
[3]中国与中亚五国棉花合作潜力分析及模式探究[J]. 王力,苗海民,温雅. 新疆大学学报（哲学·人文社会科学版）. 2016(05)
[4]棉花中赤霉素和脱落酸的时空变化[J]. 齐海坤,严根土,王宁,杨杰,黄群. 中国棉花. 2016(07)
[5]黄河流域北部棉区棉花缩节胺化学封顶技术[J]. 黎芳,王希,王香茹,杜明伟,周春江,尹晓芳,徐东永,卢怀玉,田晓莉,李召虎. 中国农业科学. 2016(13)
[6]棉花玉米素（Zeatin）和吲哚乙酸（Indoleacetic acid）的时空变化[J]. 齐海坤,严根土,王宁,杨杰,黄群. 中国棉花. 2016(06)
[7]中日水稻品种杂交后代的株型性状与产量和品质的关系[J]. 徐海,宫彦龙,夏原野,杜志敏,闫志强,王华杰,陈温福,徐正进. 中国水稻科学. 2016(03)
[8]黄河三角洲地区棉花机械化采收配套农艺技术要点[J]. 王智华,苗兴武. 中国棉花. 2016(04)
[9]密度对不同株型海岛棉产量和品质的影响[J]. 白玉林,杜斌,刘霞,王承强,李小童,杨勇,王绎衡. 棉花科学. 2016(02)
[10]黄河流域机采棉植株性状的筛选[J]. 齐海坤,严根土,王宁,苏桂兰,杨杰,许庆华,周红,黄群. 中国棉花. 2016(03)
本文编号：3346062
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