马铃薯bHLH转录因子家族的生物信息学分析及在干旱胁迫下的表达分析

发布时间：2021-08-20 18:43

　　本研究利用植物转录因子数据库获取马铃薯和拟南芥bHLH基因家族蛋白及基因序列,对马铃薯bHLH TFs进行了生物信息学分析、研究了14个StbHLHs在马铃薯DM中响应干旱胁迫和盐胁迫的表达模式的,并进行了StbHLH1基因克隆及功能分析。主要结果如下:1、使用植物转录因子数据库获得了206个马铃薯bHLH转录因子。StbHLH蛋白平均氨基酸数为519.8。基因结构结果表明大多数的StbHLHs基因不含有内含子,其中StbHLH82含有2个内含子,StbHLH29、StbHLH45、StbHLH115、StbHLH129、StbHLH136、StbHLH157、StbHLH197含有1个内含子。所有StbHLHs基因不均匀的分布在12条染色体上,其中3号染色体基因分布数量最多为27个,11号染色体基因分布数量最少为4个。根据系统进化树结果选取了14个响应干旱胁迫的StbHLHs基因。2、通过qRT-PCR分析了14个StbHLHs基因在干旱胁迫和盐胁迫下马铃薯DM中的表达模式。干旱胁迫:12 h和24 h时StbHLH194在叶组织中的表达量上调。在根组织中,StbHLH11在处理12... 

【文章来源】：青海大学青海省 211工程院校

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

bHLH基序及其目标DNA复合体[63]

图 1.3 水稻和拟南芥 bHLH TFs bHLH 结构域 DNA 结合特性预测[78]Fig.1.3 Rice and Arabidopsis bHLH TFs bHLH domain Prediction of DNA bindingproperties[78].4.2 bHLH 转录因子的生物学功能

13图 2.1 马铃薯 StbHLH 蛋白的三个重复结构域Fig.2.1 Three repeat domains of Potato StbHLH proteins

【参考文献】：
期刊论文
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[3]生态文明背景下的林业文化资源保护措施与对策研究——以登封市古树名木保护为例[J]. 张少伟,杨海蛟,王少周,高素玲,于晓莹.  河南农业. 2017(21)
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[5]中国马铃薯产业现状与前景[J]. 罗其友,刘洋,高明杰,易晓峰.  农业展望. 2015(03)
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[7]干旱胁迫对马铃薯品种生理特性的影响[J]. 海梅荣,陈勇,周平,王丽,刘福翠,唐天向,达布希拉图.  中国马铃薯. 2014(04)
[8]小麦盐胁迫相关基因TabHLH13的克隆与分析[J]. 符思路,刘国祥,张立超,夏川,赵光耀,贾继增,孔秀英.  植物遗传资源学报. 2014(05)
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博士论文
[1]苹果bHLH基因MdCIbHLH1克隆及功能分析[D]. 冯晓明.山东农业大学 2011
[2]不同生态条件下小麦籽粒品质形成及其生理基础[D]. 赵春.山东农业大学 2006

硕士论文
[1]马铃薯StCDC20-1和StTSF基因的克隆及其功能分析[D]. 左铁牛.南京农业大学 2013
[2]马铃薯干旱危害及提高抗旱性的研究[D]. 焦志丽.东北林业大学 2012
[3]香杨bHLH基因的功能分析[D]. 吴英杰.东北林业大学 2011



本文编号：3354032