水稻GLW7基因功能标记的开发和基因效应分析
发布时间:2021-08-29 13:48
根据水稻粒长和粒质量调控基因GLW7已知功能位点的核苷酸差异设计分子标记,并对国内外搜集的315份籼、粳稻品种资源进行基因型检测,分析其不同基因型的分布。同时,通过粒型性状的测定,分析该基因的遗传效应,评估其育种利用价值。结果表明,设计的功能标记能准确、有效地区分出201 bp和190 bp 2种带型,即大粒(Large grain haplotype,LGH)和小粒(Small grain haplotype,SGH)2种等位变异。从籼、粳亚种间的基因型分布来看,籼亚种中LGH和SGH的比例分别为95.65%和4.35%,而粳亚种中LGH和SGH比例分别为25.50%和74.50%,2种等位变异的分布在籼粳亚种间存在明显差异。粒型的测定结果表明,含不同等位变异的品种在粒长、粒厚、长宽比和千粒质量上存在显著或极显著差异,而粒宽则没有明显差异。进一步通过籼、粳分类分析发现,亚种间2种等位变异对粒型的效应并不完全一致,但都具有提高籽粒质量的作用。
【文章来源】:江苏农业学报. 2020,36(02)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
GLW7基因在大、小粒水稻品种中的序列差异和引物位置
为验证功能标记GLW7-F/GLW7-R在水稻品种中是否能进行有效扩增并区分GLW7基因的不同等位变异,从315份水稻资源中随机选取籼、粳稻品种各40个进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测。结果显示每个品种都能扩增出单一、清晰的条带,没有非特异性扩增和拖尾现象,说明本研究设计的引物特异性较好,扩增效率高。从带型来看,所有籼、粳稻品种都能扩增出与大、小粒品种GP7和Dongjing(DJ)同样的190 bp或201 bp 2种类型的条型,分别代表GLW7基因功能变异区域6 bp短序列重复1次和2次的结果(图2、图3)。这表明,该功能标记能够准确、有效地区分籼、粳稻品种中GLW7基因2种等位变异。图3 功能标记对部分粳稻品种GLW7基因型的检测
功能标记对部分粳稻品种GLW7基因型的检测
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用分子标记辅助选择改良闽恢3301稻瘟病抗性[J]. 田大刚,杨小双,陈子强,陈在杰,林艳,王锋. 南方农业学报. 2019(08)
[2]M342抗除草剂基因CAPS标记的开发与应用[J]. 程丽,胡茂龙,浦惠明,龙卫华,高建芹,陈锋,周晓婴,张维,陈松,张洁夫. 江苏农业学报. 2019(02)
[3]基于棉花转录组测序的SSR分子标记的开发[J]. 刘冬梅,娄喜艳,吴狄,喻拥,裴冬丽. 江苏农业科学. 2019(07)
[4]利用分子标记辅助选择改良水稻稻瘟病抗性[J]. 陈红萍,刘开浪,杨宙,何展武,万鹏,曹丰生,邓伟. 湖北农业科学. 2019(02)
[5]多抗水稻分子标记辅助育种方法[J]. 任海,吕小红,杜萌. 江苏农业科学. 2017(19)
[6]广谱抗源H4中2个主效抗病基因的单基因系构建及评价[J]. 孙大元,周丹华,张景欣,王慧,朱小源,杨祁云,陈志强. 江苏农业学报. 2017(01)
[7]水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单体型鉴定[J]. 裔传灯,王德荣,蒋伟,李玮,成晓俊,王颖,周勇,梁国华,顾铭洪. 作物学报. 2016(09)
[8]利用GS3基因功能性分子标记改良水稻粒型的研究[J]. 李扬,徐小艳,严明,冯芳君,马孝松,梅捍卫. 上海农业学报. 2016(01)
[9]水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用[J]. 丁丹,张亚东,郑佳,赵春芳,陈涛,赵庆勇,朱镇,周丽慧,姚姝,赵凌,于新,王才林. 江苏农业学报. 2014(06)
[10]水稻千粒重基因TGW6功能标记的开发与利用[J]. 王军,杨杰,徐祥,朱金燕,范方军,李文奇,王芳权,仲维功. 中国水稻科学. 2014(05)
硕士论文
[1]水稻5个粒型相关基因的分子标记开发与效应分析[D]. 丁丹.南京农业大学 2014
本文编号:3370766
【文章来源】:江苏农业学报. 2020,36(02)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
GLW7基因在大、小粒水稻品种中的序列差异和引物位置
为验证功能标记GLW7-F/GLW7-R在水稻品种中是否能进行有效扩增并区分GLW7基因的不同等位变异,从315份水稻资源中随机选取籼、粳稻品种各40个进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测。结果显示每个品种都能扩增出单一、清晰的条带,没有非特异性扩增和拖尾现象,说明本研究设计的引物特异性较好,扩增效率高。从带型来看,所有籼、粳稻品种都能扩增出与大、小粒品种GP7和Dongjing(DJ)同样的190 bp或201 bp 2种类型的条型,分别代表GLW7基因功能变异区域6 bp短序列重复1次和2次的结果(图2、图3)。这表明,该功能标记能够准确、有效地区分籼、粳稻品种中GLW7基因2种等位变异。图3 功能标记对部分粳稻品种GLW7基因型的检测
功能标记对部分粳稻品种GLW7基因型的检测
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用分子标记辅助选择改良闽恢3301稻瘟病抗性[J]. 田大刚,杨小双,陈子强,陈在杰,林艳,王锋. 南方农业学报. 2019(08)
[2]M342抗除草剂基因CAPS标记的开发与应用[J]. 程丽,胡茂龙,浦惠明,龙卫华,高建芹,陈锋,周晓婴,张维,陈松,张洁夫. 江苏农业学报. 2019(02)
[3]基于棉花转录组测序的SSR分子标记的开发[J]. 刘冬梅,娄喜艳,吴狄,喻拥,裴冬丽. 江苏农业科学. 2019(07)
[4]利用分子标记辅助选择改良水稻稻瘟病抗性[J]. 陈红萍,刘开浪,杨宙,何展武,万鹏,曹丰生,邓伟. 湖北农业科学. 2019(02)
[5]多抗水稻分子标记辅助育种方法[J]. 任海,吕小红,杜萌. 江苏农业科学. 2017(19)
[6]广谱抗源H4中2个主效抗病基因的单基因系构建及评价[J]. 孙大元,周丹华,张景欣,王慧,朱小源,杨祁云,陈志强. 江苏农业学报. 2017(01)
[7]水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单体型鉴定[J]. 裔传灯,王德荣,蒋伟,李玮,成晓俊,王颖,周勇,梁国华,顾铭洪. 作物学报. 2016(09)
[8]利用GS3基因功能性分子标记改良水稻粒型的研究[J]. 李扬,徐小艳,严明,冯芳君,马孝松,梅捍卫. 上海农业学报. 2016(01)
[9]水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用[J]. 丁丹,张亚东,郑佳,赵春芳,陈涛,赵庆勇,朱镇,周丽慧,姚姝,赵凌,于新,王才林. 江苏农业学报. 2014(06)
[10]水稻千粒重基因TGW6功能标记的开发与利用[J]. 王军,杨杰,徐祥,朱金燕,范方军,李文奇,王芳权,仲维功. 中国水稻科学. 2014(05)
硕士论文
[1]水稻5个粒型相关基因的分子标记开发与效应分析[D]. 丁丹.南京农业大学 2014
本文编号:3370766
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3370766.html
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