南方型紫花苜蓿耐盐突变体响应盐胁迫蛋白质组和转录组关联分析

发布时间：2021-09-06 22:14

　　为了揭示南方型紫花苜蓿（Medicago sativa）在分子水平上对盐胁迫环境的适应机制,在正常培养和盐处理下,对南方型紫花苜蓿‘Millennium’耐盐突变体的2个样品根部分别进行蛋白质组和转录组关联分析,以期发现一些可能作为紫花苜蓿耐盐潜在的靶标蛋白。本研究结果如下:（1）利用RNA-seq技术,经过250 mmol/L NaCl胁迫72 h,南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部样品中有31 815个基因表达量发生改变,其中被检测到的差异基因有5282个（2 477个表达上调,2 805个表达下调）,包括隶属于43个转录家族的363个转录因子（上调表达125个,下调表达238个）。GO功能显著性分析显示,差异表达基因广泛涉及细胞过程、催化活性、代谢过程和细胞组分等方面。KEGG Pathway显著性富集分析显示,差异表达基因广泛涉及代谢途径和次生代谢产物生物合成。转录因子分析发现,应答基因数量最多的是MYB基因家族,其次是AP2–EREBP和MYB–related等转录因子家族。（2）利用iTRAQ技术,经过250 mmol/L NaCl胁迫72 h,南方型紫花苜蓿耐盐突变体根部样品中... 

【文章来源】：浙江农林大学浙江省

【文章页数】：105 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

a对照组中原始数据过滤结果组成成分Figure2.1aClassificationofRawReadsofCK

15图 2.1b 盐处理组中原始数据过滤结果组成成分Figure2.1b Classification of Raw Reads of salt treatment2 Clean 数据碱基组成和质量分布图滤后的 clean reads 需要进行质控。根据碱基互补配对原则，C 碱基与与 A 碱基的比例应分别相等。图 2.2a 和 2.2b 中，A、T 曲线基本重合

南方型紫花苜蓿耐盐突变体响应盐胁迫蛋白质组和转录组关联分析重合，表明 clean reads 中碱基组成平衡。对于碱基质量，如果低例越低，说明测序质量越好。从图 2.3a 和 2.3b 中可以看出，绝大 25，只有极少部分小于 20，表明测序碱基质量高。

【参考文献】：
期刊论文
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[3]基于iTRAQ质谱分析技术筛选南方型紫花苜蓿根部响应盐胁迫差异表达蛋白[J]. 马进,郑钢,裴翠明,张振亚.  农业生物技术学报. 2016(04)
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[9]不同改良方法对滨海盐碱地修复效果的影响[J]. 刘云,孙书洪.  灌溉排水学报. 2014(Z1)
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博士论文
[1]阿拉善荒漠区珍稀泌盐植物长叶红砂响应盐胁迫的转录组学研究[D]. 党振华.内蒙古大学 2013
[2]星星草（Puccinellia tenuiflora）叶绿体Na2CO3胁迫应答的生理学与定量蛋白质组学研究[D]. 张恒.东北林业大学 2012
[3]利用转基因技术创建紫花苜蓿耐盐新种质的研究[D]. 张立全.内蒙古大学 2011

硕士论文
[1]盐胁迫下小麦诱变系M3代幼苗生长及比较蛋白质组学研究[D]. 乔佩.北京林业大学 2013
[2]盐胁迫下紫花苜蓿蛋白质组分析及耐盐相关基因克隆[D]. 崔艳军.中国农业科学院 2013
[3]野生大豆盐胁迫相关microRNA的功能分析[D]. 许硕.中国农业科学院 2011



本文编号：3388272