不同耕作模式下三七人参皂苷生物合成的比较转录组学研究
发布时间:2021-09-23 15:34
三七(Panax notoginseng)是我国特有的名贵中药材,与人参(Panax ginseng)、西洋参(American ginseng)同属于五加科之人参属。三七在民间是一种伤科金疮药,用于止血、散瘀、定痛,也被当做顶级的滋补品长达2000多年,其入药部位是干燥的地下根及根茎。在临床上三七具有抗血栓、抗高血压、抗动脉粥样硬化、保肝等作用,因其在治疗心血管疾病和活淤止血方面具有较好疗效而闻名中外,用三七作为原料的云南白药和血塞通就是著名的治疗血液疾病的药品。三七的主要活性成分是人参皂苷,目前为止,人参皂苷主要来源于天然产物。次级代谢工程是通过生物技术手段大量快速地生产次级代谢产物的重要途径,可能解决人参皂苷的产业需求。但是目前对人参皂苷生物合成途径研究还不深入,遗传信息资源十分有限。本研究结合了单分子实时测序(SMRT)技术和Illumina测序技术,对三七的转录组进行测序,深入地分析了人参皂苷代谢途径的相关基因及其表达模式,对三七光周期调控开花基因、抗病基因、转录因子和叶绿体基因组等开展分析。本文结果主要结果如下:为了获得高质量的三七参考转录组序列,本研究采用三代单分子实时(...
【文章来源】:昆明理工大学云南省
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2.6转录本比对上Nr库的物种分布图??
图2.9基于代谢类别的分类??Figure?2.9?Classification?based?on?metabolism?categories??
基因家族发现170个拷贝,而GT家族发现189个拷贝,且在其他9个物种中的??拷贝数也很多,因此,我们只画了与三七同一个目(伞形目)的胡萝卜与三七构??建了系统进化树,如图2.13,图2.14所示。??52??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Cloning and Bioinformatic Analysis of HMGS and HMGR Genes from Panax notoginseng[J]. Wan-jing Liu,Hai-zhou Lv,Liu He,Jing-yuan Song,Chao Sun,Hong-mei Luo,Shi-lin Chen. Chinese Herbal Medicines. 2016(04)
[2]三七3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因的克隆和生物信息学分析[J]. 张萍,刘迪秋,葛锋,赵恒伟. 中草药. 2014(18)
[3]三七及屏边三七病程相关基因克隆的新策略[J]. 李瑞博,申业,文国松,冯光泉,曲媛,崔秀明,黄璐琦. 基因组学与应用生物学. 2014(03)
[4]4种人参属植物基因组大小的测定[J]. 潘跃芝,张亦弛,龚洵,李富生. 植物分类与资源学报. 2014(02)
[5]适用于转录组测序的棉花幼根总RNA提取方法筛选[J]. 王春晖,赵云雷,王红梅,陈伟,龚海燕,桑晓慧. 棉花学报. 2013(04)
[6]三七PnUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析[J]. 向丽,郭溆,牛云云,陈士林,罗红梅. 药学学报. 2012(08)
[7]三七甲羟戊酸激酶PnMVK1基因的克隆和生物信息学分析[J]. 郭溆,罗红梅,陈士林. 药学学报. 2012(08)
[8]叶绿体基因工程研究进展[J]. 崔柳青,李一帆,潘卫东. 生物技术通报. 2012(06)
[9]不同生长年限三七中总皂苷含量的变化特征[J]. 王振峰,高云涛,张文斌,张公信,林龙勇,王正玮,闫莉莉. 安徽农业科学. 2012(15)
[10]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
博士论文
[1]红豆杉中与异戊二烯代谢途径相关的AP2类转录调控因子的克隆与功能研究[D]. 戴怡龄.复旦大学 2008
本文编号:3405965
【文章来源】:昆明理工大学云南省
【文章页数】:143 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图2.6转录本比对上Nr库的物种分布图??
图2.9基于代谢类别的分类??Figure?2.9?Classification?based?on?metabolism?categories??
基因家族发现170个拷贝,而GT家族发现189个拷贝,且在其他9个物种中的??拷贝数也很多,因此,我们只画了与三七同一个目(伞形目)的胡萝卜与三七构??建了系统进化树,如图2.13,图2.14所示。??52??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Cloning and Bioinformatic Analysis of HMGS and HMGR Genes from Panax notoginseng[J]. Wan-jing Liu,Hai-zhou Lv,Liu He,Jing-yuan Song,Chao Sun,Hong-mei Luo,Shi-lin Chen. Chinese Herbal Medicines. 2016(04)
[2]三七3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因的克隆和生物信息学分析[J]. 张萍,刘迪秋,葛锋,赵恒伟. 中草药. 2014(18)
[3]三七及屏边三七病程相关基因克隆的新策略[J]. 李瑞博,申业,文国松,冯光泉,曲媛,崔秀明,黄璐琦. 基因组学与应用生物学. 2014(03)
[4]4种人参属植物基因组大小的测定[J]. 潘跃芝,张亦弛,龚洵,李富生. 植物分类与资源学报. 2014(02)
[5]适用于转录组测序的棉花幼根总RNA提取方法筛选[J]. 王春晖,赵云雷,王红梅,陈伟,龚海燕,桑晓慧. 棉花学报. 2013(04)
[6]三七PnUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析[J]. 向丽,郭溆,牛云云,陈士林,罗红梅. 药学学报. 2012(08)
[7]三七甲羟戊酸激酶PnMVK1基因的克隆和生物信息学分析[J]. 郭溆,罗红梅,陈士林. 药学学报. 2012(08)
[8]叶绿体基因工程研究进展[J]. 崔柳青,李一帆,潘卫东. 生物技术通报. 2012(06)
[9]不同生长年限三七中总皂苷含量的变化特征[J]. 王振峰,高云涛,张文斌,张公信,林龙勇,王正玮,闫莉莉. 安徽农业科学. 2012(15)
[10]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
博士论文
[1]红豆杉中与异戊二烯代谢途径相关的AP2类转录调控因子的克隆与功能研究[D]. 戴怡龄.复旦大学 2008
本文编号:3405965
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3405965.html