超级稻春优84重组自交系遗传图谱构建及其籽粒和叶片性状QTL定位

发布时间：2021-12-30 20:29

　　水稻（Oryza sativa L.）是世界主要粮食作物之一,世界上一半以上的人口以此为主食。开展水稻农艺性状QTL（Quantitative trait loci）研究,对克隆调控水稻农艺性状关键基因、揭示产量构成、探索株型、粒型与稻米产量相关性具有重要的理论意义和应用价值。本研究利用超级杂交稻春优84的两个植株及籽粒形态差异较大的亲本,晚粳保持系春江16B（CJ16B）和中籼恢复系C84进行杂交,利用单粒传法连续自交7代构建了188个株系组成的重组自交系群体（Recombinant inbred lines,RILs）,利用158对在双亲中存在多态性差异的分子标记,构建了一套水稻遗传连锁图谱。对植株叶片形态和籽粒形态性状进行相关性分析及两地的表型值考察,用于水稻主要株型及粒型农艺性状的初定位分析。主要研究结果如下:1.利用CJ16B和C84为亲本构建的含188个单株的RILs,选择在染色体上分布均匀且多态性好的分子标记158个,构建了一张水稻分子连锁遗传图谱。该图谱总遗传距离为1428.40 cM,标记间距平均为9.04 cM,图距介于0.2 cM-43.3 cM之间;各标记位置及... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
英文缩略表
第一章 引言
    1.1 水稻遗传图谱构建
        1.1.1 DNA分子标记分类与选择
        1.1.2 常用QTL作图群体类型选择及群体大小
        1.1.3 作图群体的构建
        1.1.4 水稻分子遗传图谱研究进展
    1.2 QTL定位
        1.2.1 QTL定位原理及方法
        1.2.2 水稻QTL定位
        1.2.3 QTL精细定位与克隆
    1.3 水稻重要株型性状遗传研究
    1.4 水稻粒型性状遗传研究
    1.5 研究的目的及意义
第二章 水稻分子遗传连锁图谱构建
    2.1 实验材料
        2.1.1 RIL遗传群体构建
        2.1.2 实验涉及试剂与相关仪器设备
        2.1.3 实验材料田间种植与管理
    2.2 试验方法
        2.2.1 水稻叶片DNA提取
        2.2.2 PCR扩增反应及凝胶电泳检测
        2.2.3 SDS-PAGE(聚丙烯酰胺凝胶)电泳检测
        2.2.4 多态性筛选及基因分型
        2.2.5 遗传图谱构建与分析
        2.2.6 遗传连锁图谱作图
    2.3 结果及分析
        2.3.1 2016 年杭州、海南两地双亲及RIL群体重要株型性状分析
        2.3.2 2016 年杭州、海南两地双亲及RIL群体粒型相关性状比较
        2.3.3 双亲多态性分析
        2.3.4 基因型数据分析
        2.3.5 RIL分子遗传连锁图谱构建
    2.4 结论与讨论
        2.4.1 结论
        2.4.2 讨论
第三章 水稻粒型性状QTL定位
    3.1 实验材料
        3.1.1 供试材料
        3.1.2 实验涉及试剂与相关仪器设备
        3.1.3 材料种植及处理
    3.2 实验方法
        3.2.1 农艺性状调查
        3.2.2 QTL定位方法
        3.2.3 差异位点dCAPs分子标记引物设计
    3.3 结果与分析
        3.3.1 2016 年杭州、海南两地RIL群体粒型性状分布
        3.3.2 2016 年杭州、海南两地RIL群体粒型性状相关性分析
        3.3.3 粒型相关性状QTL检测
        3.3.4 双亲已克隆粒型主效QTL等位基因序列差异分析及分子标记验证
    3.4 结论与讨论
        3.4.1 结论
        3.4.2 讨论
第四章 水稻株型和叶片形态QTL定位及叶长调控基因qLL9的精细定位
    4.1 实验材料
        4.1.1 供试材料
        4.1.2 实验涉及试剂与相关仪器设备
        4.1.3 材料种植及处理
    4.2 实验方法
        4.2.1 农艺性状调查
        4.2.2 Indel标记引物设计
        4.2.3 RNA的提取
        4.2.4 水稻叶片RNA反转录成cDNA
        4.2.5 实时定量PCR(RT-PCR)检测候选基因的表达量
    4.3 结果与分析
        4.3.1 2016年杭州、海南两地RIL群体株型性状分布
        4.3.2 2016年杭州、海南两地RIL群体株型性状相关性分析
        4.3.3 株型相关性状的QTL检测
        4.3.4 叶长主效QTLqLL9的精细定位
        4.3.5 候选基因的预测
    4.4 结论与讨论
第五章 全文结论
    5.1 水稻分子遗传连锁图谱构建
    5.2 水稻粒型性状QTL定位
    5.3 水稻株型和叶片形态QTL定位
    5.4 叶长主效QTLqLL9的精细定位
参考文献
附录
致谢
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于重组自交系群体的水稻粒形QTL定位[J]. 方先文,张云辉,肖西林,张所兵,林静,汪迎节.  江苏农业学报. 2017(02)
[2]水稻遗传图谱构建及粒形相关性状的QTL定位[J]. 李孝琼,韦宇,高国庆,邓国富,郭嗣斌.  南方农业学报. 2014(07)
[3]利用染色体单片段代换系定位水稻株高QTL[J]. 朱金燕,嵇朝球,周勇,王军,王中德,杨杰,范方军,梁国华,仲维功.  植物学报. 2011(06)
[4]培矮64S/93-11重组自交系分子图谱构建及千粒重QTL检测[J]. 徐小飒,刘喜,赵志刚,周裕军,吴盛阳,周蓉,张俊杰,江玲,万建民.  南京农业大学学报. 2011(01)
[5]水稻QTL定位研究进展[J]. 田翠,张涛,蒋开锋,杨莉,郑家奎.  基因组学与应用生物学. 2009(03)
[6]水稻株高的遗传与育种研究进展[J]. 马玉银,王如平,李磊,左示敏,殷跃军,陈宗祥.  河南农业科学. 2008(11)
[7]超级杂交稻协优9308重组自交系的分子遗传图谱构建[J]. 沈希宏,陈深广,曹立勇,占小登,陈代波,吴伟明,程式华.  分子植物育种. 2008(05)
[8]DNA分子标记的研究进展及几种新型分子标记技术[J]. 关强,张月学,徐香玲,孙德全,李绥艳,林红,潘丽艳,马延华.  黑龙江农业科学. 2008(01)
[9]水稻显性小粒基因Mi3（t）的遗传定位[J]. 刘明伟,刘勇,王世全,邓其明,李平.  中国水稻科学. 2005(06)
[10]用（培矮64s/Nipponbare）F2群体对水稻产量构成性状的QTL定位分析[J]. 叶少平,张启军,李杰勤,赵兵,李平.  作物学报. 2005(12)

博士论文
[1]高密度小麦遗传连锁图谱构建及产量相关性状QTL定位[D]. 崔法.山东农业大学 2011
[2]分子标记遗传图谱构建和稻米品质性状的遗传分析[D]. 王令强.华中农业大学 2007



本文编号：3558917