茶树内生草螺菌WT00C的基因组学研究

发布时间：2022-01-01 18:01

　　草螺菌WT00C（Herbaspirillum sp.WT00C）是我们实验室从茶树中分离出的一种内生细菌。前期实验表明,它能产氨、合成生长素吲哚乙酸和嗜铁素,能够有效地经过伤口感染进入并定殖茶树体内。喷洒和浇灌都不能够感染植物且不能在水稻、小麦、油菜和白菜等农作物中定殖。大田实验发现,浸泡扦插条或喷洒修剪的大田茶树,草螺菌WT00C能促进茶树扦插枝生根和发芽,促进大田茶树新生侧芽生长,嫩芽生物量增加达8 kg/亩。虽然草螺菌WT00C与两种固氮内生草螺菌（织片草螺菌Herbaspirillum seropedicae和红苍白草螺菌Herbaspirillum rubrisubalbican）一样具有植物促生作用,但草螺菌WT00C不能固氮且宿主也不同。为了弄清楚草螺菌WT00C的促生作用以及它的宿主特异性,本研究试图利用分子生物学和生物信息学方法,解析草螺菌WT00C基因组DNA序列并加以注释。草螺菌WT00C基因组的大小为6,079,821 bp,包含5537个基因,基因平均长度为955 bp。分析基因组注释结果及代谢情况发现,,草螺菌WT00C有四个末端氧化酶,有负责糖类转运的A... 

【文章来源】：湖北大学湖北省

【文章页数】：92 页

【学位级别】：硕士

【图文】：

五种草螺菌的形态特征：A:H.massiliense[18]

图 1.2 草螺菌属 16s rRNA 聚类分析[23]1.1.3 草螺菌多样性己有的资料表明，不同环境中都存在草螺菌属的细菌，如稻田[24, 25]、火山沉积物[26]、山岩[27]、水[10]、果蝇卵巢[28]、盐水湖[29]、甘蔗[30]、污染土壤中的荧蒽[3]、茶树[31]、蕉树[32]、野生稻[30]等。较广的分布说明草螺菌属的细菌具有较大的代谢多样性[33]。此外，临床病例中也报道过草螺菌。在蜂窝组织炎和菌血症的病人[34]、囊性纤维化患者[35-37]、主动脉夹层动脉瘤[38]、在淋巴细胞白血病患者[39, 40]、癌症患者[41]中发现螺菌细菌。不过，这些病源草螺菌都未进行详细的分类鉴定。据研究报道，不同种属草螺菌能够显示 HeLa 细胞的毒性作用，密度低、表面离散的草螺菌表现出较低的毒[42]。尽管来源于不同的生理环境，草螺菌属的细菌拥有相似的生理生化特性，并且该属 DNA 相似度很高，16S rDNA 相似性为 98. 5-99. 4%，DNA 的 GC 含量为 61- 65%。

细胞大小（μm）0.6-0.7以 N2为唯一氮源+鞭毛 1-3 个 N03-条件下厌氧生长-生长温度（℃） 22-38葡萄糖+GC 含量%67±0.5蔗糖-生长 pH5.3-8.0α-酮戊二酸+2% NaCl -柠檬酸+“+”表示实验阳性；“-”表示实验阴性[1]1.1.3.2 Herbaspirillum rubrisubalbicanH. rubrisubalbican（红苍白草螺菌）是从病变的甘蔗叶片中分离并鉴定的内生草螺菌。它能够导致甘蔗产生条斑病，是一种较弱的植物致病菌[3, 33, 43, 44]。最开始被认为属于假单胞菌属[44]，后根据其生理生化特性以及 DDH 值，修正了其属名，正式更名为Herbaspirillum rubrisubalbican[4]。H. rubrisubalbican 致病情况见图 1.3.

【参考文献】：
期刊论文
[1]两株茶树内生草螺菌的微生物学特性[J]. 王婷,杨升,陈亚雪,胡玲玲,屠琴,张丽,刘雪芹,王行国.  微生物学报. 2014(04)



本文编号：3562554