玉米株高主效QTL qPH2.4的定位分析

发布时间：2022-01-12 04:47

　　课题组前期以玉米自交系郑58为轮回亲本,以昌7-2为供体亲本,通过分子标记辅助选择获得染色体单片段代换系Z12和W16。Z12和W16在bin2.07区域均含有1个来源于昌7-2的染色体片段,株高均显著高于轮回亲本郑58。利用郑58和Z12为材料构建F2分离群体,基于重测序和混合分离分析（BSA）策略,将株高主效QTL qPH2.4定位于第2染色体13.95 Mb（201 457 953～215 022 157 bp）的区域内。利用在目标区间内筛选出的20对多态性分子标记对包含743个单株的郑58×Z12 F2分离群体和包含1 720个单株的郑58×W16 F2分离群体进行基因型分析,结合田间株高数据进行QTL定位,将株高主效QTL qPH2.4定位在InDel分子标记ph-18和ph-19之间,区间的遗传距离为0.57 cM,物理距离为626 kb。参考B73基因组（RefGen_v4）注释信息,该区间内存在17个注释基因,其中,包含可以调控油菜素内酯信号的基因Zm00001d006677。 

【文章来源】：玉米科学. 2020,28(02)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

图1 株高性状相关区域的鉴定

2017年于北京昌平调查表型数据，在包含743个单株的F2分离群体中，株高变异范围在120～202 cm，平均为160.5 cm，双向均存在具有超亲现象的个体。由图2所示，依据分子标记ph-16的3种带型(郑58带型、Z12带型、杂合带型)，将743个单株分为3组，分别统计每组内的株高的次数分布。Z12带型的单株偏态分布于右侧，郑58带型的单株偏态分布于左侧。2.2.3 郑58×Z12的F2分离群体QTL定位

根据QTL IciMapping软件格式要求整理表型数据，然后导入该软件中进行遗传连锁图谱构建。13个标记在遗传图谱中的相对位置与B73参考基因组的物理位置基本一致。该图谱全长16.963 cM，平均遗传距离为1.41 cM。利用软件中的ICIM-ADD方法进行QTL作图分析，LOD临界值为3.0时，将株高QTL定位于InDel分子标记ph-15和ph-19之间，期间的遗传距离为2.67 cM，物理距离为2475.321 kbp(211 618 757～214 094 078)，最大LOD值为35.13，可解释株高20.37%的表型变异。该QTL加性效应为8.38，显性效应为0.93，其遗传效应表现为加性效应，命名为qPH2.4(图3)。2.2.4 郑58、W16及其F2分离群体的表型分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米株高主效QTL qPH3.2精细定位及遗传效应分析[J]. 刘忠祥,杨梅,殷鹏程,周玉乾,何海军,邱法展.  作物学报. 2018(09)
[2]基于单片段代换系的玉米百粒重QTL分析[J]. 陈春侠,陆明洋,尚爱兰,王玉民,席章营.  作物学报. 2013(09)
[3]玉米矮秆主效QTL qph1-4的精细定位[J]. 陆明洋,陈春侠,高岭巍,席章营.  河南农业大学学报. 2012(03)
[4]基于BSA分析法的分子标记基因定位技术在农作物中的应用[J]. 白凤虎,李德芳,陈安国,唐慧娟.  中国麻业科学. 2006(06)



本文编号：3584125