基于RNA-Seq的小麦高密度遗传图谱构建和产量性状QTL分析

发布时间：2022-01-17 17:24

　　小麦是世界上重要的粮食作物,是产量仅次于玉米、水稻的第三大粮食作物。小麦大部分产量性状为数量性状,绘制高密度遗传图谱是研究数量性状的重要手段;发掘重要性状的QTL,对分子标记辅助选择和基因克隆具有重要意义。本研究以RIL群体“山农0431×鲁麦21”176个家系为材料,进行RNA-Seq分析、构建遗传连锁图谱并进行产量相关性状QTL分析。主要结果如下:（1）山农0431测序得到66.09 Gb的Raw reads,经处理得到65.15 Gb的Clean reads,有参比对结果为85.74%,有参组装得到234641条转录本,平均转录本长度为1599.5 bp,N50长度为2229 bp,GC含量为50.82%,无参组装得到3910条序列;鲁麦21共获得65.24 Gb的Raw reads,经处理得到64.26Gb的Clean reads,有参比对结果为86.20%,有参组装得到228827条转录本,平均转录本长度为1590.89 bp,N50长度为2225 bp,GC含量为50.91%,无参组装得到3965条序列。（2）共筛选得到188524个标记,其中172070个SNP位点,16... 

【文章来源】：山东农业大学山东省

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

“山农0431×鲁麦21”RIL群体的遗传连锁图谱简图

20图 2 基于“山农 0431×鲁麦 21”的 RIL 群体构建的遗传连锁图谱。红色方框代表 QTL 簇，黑色横线代表标记位点Fig.2 Genetic linkage map developed using a RIL population derived from a cross between Shannong 0431 and Lumai 21.

【参考文献】：
期刊论文
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[3]分子设计育种研究进展[J]. 薛勇彪,王道文,段子渊.  中国科学院院刊. 2007(06)
[4]我国小麦品种改良趋势与粮食安全[J]. 肖世和.  科技导报. 2006(04)



本文编号：3595135