施氮影响羊草秋季地下分蘖芽发生的转录组学研究

发布时间：2022-01-17 14:31

　　羊草（Leymus chinensis）,赖草属多年生根茎型禾草,广泛分布于欧亚草原东部,具有较高的经济价值和生态价值。然而,自然条件下,其有性生殖能力弱、种子产量低,限制了羊草人工草地的建植。羊草种子产量低主要与单位面积生殖枝数量少有关,而生殖枝数量又与秋季果后营养期地下分蘖芽的形成密切相关。因此,探究羊草果后营养期地下分蘖芽库形成的内在机制,就成为解决种子产量低的关键。本研究利用转录组学方法,对比研究了果后营养期前、后,施氮与不施氮条件下羊草分蘖基部基因的表达及调控通路变化,研究结果发现:（1）果后营养期施氮能明显增加羊草地下芽的发生量。施氮条件下,在阈值为q<0.05,且|log_2ratio|（|log_2比例|）≥1,RPKM（每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数）>0.3条件下,与芽发生有直接或间接关联的基因上调18399个,下调10732个;而当阈值为q<0.001且|log_2ratio|≥1,RPKM≥1时... 

【文章来源】：东北师范大学吉林省 211工程院校 教育部直属院校

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转录本序列长度分布

比对结果统计

东北师范大学硕士学位论文15图2.3ORF长度分布Figure2.3ORFlengthdistribution注：Minlength开放阅读框的最小长度；Maxlength开放阅读框的最大长度；N50开放阅读框的N50长度；N90开放阅读框的N90长度；Mean-length开放阅读框的平均长度对比各个数据库，共注释了316261个unigene，注释比例为100%。其中注释到NR数据库的unigene比例为56.73%；注释到NT数据库的unigene比例为44.54%；注释到GO数据库的unigene比例为33.36%；注释到KO数据库的unigene比例为15.05%（图2.4）。

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
[1]氮素营养对水稻分蘖基因表达特性及根系和抗倒性的影响[D]. 郑冠龙.东北农业大学 2015
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[3]杜仲花粉初生代谢物与次生代谢物的研究[D]. 马仁萍.西北农林科技大学 2008
[4]松嫩平原羊草茎顶分生组织分化研究[D]. 张兆军.东北师范大学 2006



本文编号：3594899