我国75份小麦品种SNP和SSR指纹图谱构建与比较分析

发布时间：2022-02-19 03:37

　　联合利用Illumina 90K SNP芯片和毛细管高通量SSR检测技术,构建75份育成品种384个SNP和42个SSR位点的指纹图谱,比较两种标记在遗传多样性、遗传相似系数和鉴别能力等方面的特征。结果显示,SNP标记揭示的遗传多样性指数明显低于SSR标记,但能较好地反映品种间的遗传多样性;SNP标记揭示的遗传相似系数明显高于SSR标记,但两者呈极显著线性相关;384个SNP位点鉴定近等基因系的能力低于42个SSR位点,但去除近等基因系后,仅需8个SNP或4个SSR位点组合即可区分剩余的74份品种,表明最优位点组合具有较高的鉴定效率,在品种鉴定时可先采用少量标记进行初鉴,对于极近似品种可加大标记密度。首次结合SSR和SNP标记构建指纹图谱,证实了两者之间的一致性,提出了分子身份鉴定技术标记数量的选择思路,为小麦品种DNA身份鉴定技术标准制定提供了重要的参考依据。 

【文章来源】：中国农业科技导报. 2020,22(05)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 基因组DNA提取
    1.3 SNP基因分型
    1.4 SSR基因分型
    1.5 统计分析
2 结果分析
    2.1 适于指纹图谱构建的SNP位点组合筛选
        2.1.1 SNP位点的筛选
        2.1.2 SNP位点的分布
        2.1.3 SNP位点的多态性分析
    2.2 SSR和SNP标记指纹图谱分析
    2.3 基于SNP和SSR标记的遗传多样性比较
    2.4 基于SNP和SSR标记的的遗传相似系数比较
        2.4.1 遗传相似系数比较
        2.4.2 遗传相似系数相关性分析
        2.4.3 聚类分析
    2.5 两种标记的鉴别能力比较
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]适于陆地棉品种身份鉴定的SNP核心位点筛选与评价[J]. 朱国忠,张芳,付洁,李乐晨,牛二利,郭旺珍.  作物学报. 2018(11)
[2]利用SNP芯片构建我国冬油菜参试品种DNA指纹图谱[J]. 赵仁欣,李森业,郭瑞星,曾新华,文静,马朝芝,沈金雄,涂金星,傅廷栋,易斌.  作物学报. 2018(07)
[3]应用SNP精准鉴定大豆种质及构建可扫描身份证[J]. 魏中艳,李慧慧,李骏,Yasir A.Gamar,马岩松,邱丽娟.  作物学报. 2018(03)
[4]我国玉米品种标准DNA指纹库构建研究及应用进展[J]. 赵久然,王凤格,易红梅,田红丽,杨扬.  作物杂志. 2015(02)
[5]河南省近年审定小麦品种基于系谱和SNP标记的遗传多样性分析[J]. 曹廷杰,谢菁忠,吴秋红,陈永兴,王振忠,赵虹,王西成,詹克慧,徐如强,王际睿,罗明成,刘志勇.  作物学报. 2015(02)



本文编号：3632138