玉米野生近缘种大刍草幼苗叶片的转录组SSR分析

发布时间：2022-08-12 18:34

　　通过对大刍草转录组测序来发掘SSR标记位点,结果发现14 099个SSR位点,出现频率为13.31%。三核苷酸和单核苷酸是主要重复类型,分别占SSR总数的42.12%和25.65%;六核苷酸重复所占比例最小,占0.43%。转录组结果表明,大刍草SSR中共发现38种重复基元,单核苷酸重复基元A/T出现频率最高,占总SSR的21.06%;其次为AG/CT和GCC/GGC,分别占6.759%和5.53%。5次重复的SSR数量最多,有3 927个,占总SSR的27.85%。研究结果为大刍草的SSR分子标记研究、遗传多样性分析、种群遗传结构等提供基础。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料与总RNA提取
    1.2 转录组测序及组装拼接
    1.3 转录组SSR筛选
2 结果与分析
    2.1 大刍草总RNA质量的检测
    2.2 大刍草转录组测序组装结果及统计
    2.3 Unigene注释
    2.4 大刍草转录组中SSR位点数量和分布
    2.5 大刍草转录组中SSR位点重复次数
    2.6 大刍草转录组中SSR基元类型和数量
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]镉胁迫下鬼针草的转录组分析及SSR分子标记开发[D]. 张璐.沈阳师范大学 2019
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本文编号：3676391