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广东雷州杂草稻sh4和qSH1基因的功能SNP位点序列分析

发布时间:2022-09-27 13:05
  sh4和qSH1基因是水稻的主效落粒基因,本研究旨在测定雷州杂草稻的sh4和qSH1的基因型,为雷州杂草稻的落粒机制研究提供分子基础。本研究从雷州10个杂草稻群体采集了100个单株及10份栽培稻种子,观测其颖壳颜色、果皮颜色和芒及落粒率,并对sh4和qSH1的功能SNP位点进行PCR扩增及序列分析。结果表明,57份杂草稻的sh4功能SNP位点为野生落粒型(G),15份为杂合型G/T,28份为突变难落粒型(T)。其中,G型和G/T型的72份杂草稻的落粒率都极高(95%~100%),而28份T型杂草稻中,19份为中度落粒(30%~75%),5份杂草稻的落粒率很高(>95%),4份杂草稻的落粒率小于30%。100份杂草稻和10份栽培稻的qSH1功能SNP位点均为G。结合落粒表型及基因型,推测sh4是调控雷州杂草稻落粒性的一个主要基因。 

【文章页数】:6 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 材料采集
        1.1.2 试剂
    1.2 方法
        1.2.1 杂草稻种子性状观测
        1.2.2 DNA提取
        1.2.3 PCR扩增及序列分析
2 结果与分析
    2.1 种子主要性状观测
    2.2 sh4功能SNP位点的序列分析
    2.3 qSH1上游调控区功能SNP位点的序列分析
3 讨论
    3.1 雷州杂草稻落粒性与qSH1基因型的关系
    3.2 雷州杂草稻落粒性与sh4基因型的关系
    3.3 雷州杂草稻的起源分析
4 结论


【参考文献】:
期刊论文
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[2]杂草稻的发生、危害与我国水稻生产面临的挑战[J]. 王哲,戎俊,卢宝荣.  杂草科学. 2015(01)
[3]江苏省和东北地区杂草稻落粒性基因的序列分析[J]. 王军,徐详,杨杰,王芳权,范方军,朱金燕,李文奇,仲维功.  分子植物育种. 2014(06)
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[5]吉林省杂草稻遗传多样性及起源的研究[J]. 马殿荣,马巍,唐亮,孔德秀,刘晓亮,丁国华,赵明辉,陈温福.  沈阳农业大学学报. 2012(03)
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[7]广东湛江杂草稻qSH1基因片段序列分析[J]. 王黎明,陈勇,王林.  中国农学通报. 2010(19)



本文编号:3681112

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