苎麻花发育相关AP2/ERF类基因的初步研究
发布时间:2022-09-30 12:48
苎麻是多年生的植物,目前苎麻的育种目标,主要集中在产量,纤维品质,加工品质,抗逆性,饲用品质等方面,而开花会很大程度上,影响8月份以后生长苎麻的产量与品质。根据现有的生长周期,苎麻的开花,不利于三麻时期的营养生长,三麻期大量的开花结实,会导致苎麻的纤维品质和产量明显下降。本研究的目的是想通过对不同品种苎麻在不同时期不同部位的转录因子的表达,找到含AP2/ERF结构域与开花相关的转录因子,克隆出开花调控相关的基因,为后续苎麻开花调控研究奠定基础。本文的主要研究结果如下:(1)本文通过实验室前期的转录组数据,找到可信度比较高的七个转录因子,同时利用ExPASy,NCBI,Smart等生物信息学的网站进行核苷酸序列分析,氨基酸翻译以及氨基酸序列保守结构域搜索,对转录因子6896,18197,17478,15426N,15247n,9156,16687共七个进行分析,经过分析发现18197,17478,15247,6896,9156都含有AP2结构域,同时选取的七个转录因子,亲缘关系较远,具有一定的代表性,为后续研究提供理论方向。(2)本研究以3个苎麻品种为材料,采用actin作为内参基因,利...
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
第1章 文献综述
1.1 苎麻概述
1.2 AP2/ERF转录因子
1.3 实时荧光定量PCR
1.4 研究的目的与意义
第2章 苎麻转录组来源的AP2/ERF基因生物信息学分析
2.1 实验材料和方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验方法
2.2 实验结果
2.2.1 ORF的分析
2.2.2 AP2/ERF结构域分析
2.2.3 转录因子聚类分析
2.3 讨论
第3章 苎麻荧光定量实时PCR体系建立
3.1 实验材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 仪器
3.1.3 实验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 RNA提取率
3.2.2 RNA的纯度和完整性
3.2.3 实时定量PCR扩增曲线和熔解曲线分析
3.2.4 实时定量PCR相对表达量分析
3.3 结论与讨论
3.3.1 结论
3.3.2 讨论
第4章 苎麻AP2/ERF基因的时空表达分析
4.1 实验材料与方法
4.1.1 实验材料与试剂
4.1.2 实验取材
4.1.3 实验方法
4.2 荧光定量PCR结果
4.2.1 不同苎麻品种中骨,茎尖,皮,叶部位的表达
4.3 讨论
第5章 苎麻花发育相关AP2/ERF基因的克隆与生物信息学分析
5.1 实验材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 实验仪器
5.1.3 实验方法
5.2 实验结果
5.2.1 基因克隆
5.2.2 苎麻9156基因序列
5.2.3 苎麻9156蛋白二级结构分析
5.2.4 苎麻9156聚类分析
5.2.5 苎麻9156蛋白的三维结构分析
5.3 讨论
第6章 结论与创新点
6.1 结论
6.2 创新
参考文献
缩写表
致谢
作者简介
本文编号:3683583
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
abstract
第1章 文献综述
1.1 苎麻概述
1.2 AP2/ERF转录因子
1.3 实时荧光定量PCR
1.4 研究的目的与意义
第2章 苎麻转录组来源的AP2/ERF基因生物信息学分析
2.1 实验材料和方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验方法
2.2 实验结果
2.2.1 ORF的分析
2.2.2 AP2/ERF结构域分析
2.2.3 转录因子聚类分析
2.3 讨论
第3章 苎麻荧光定量实时PCR体系建立
3.1 实验材料与方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 仪器
3.1.3 实验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 RNA提取率
3.2.2 RNA的纯度和完整性
3.2.3 实时定量PCR扩增曲线和熔解曲线分析
3.2.4 实时定量PCR相对表达量分析
3.3 结论与讨论
3.3.1 结论
3.3.2 讨论
第4章 苎麻AP2/ERF基因的时空表达分析
4.1 实验材料与方法
4.1.1 实验材料与试剂
4.1.2 实验取材
4.1.3 实验方法
4.2 荧光定量PCR结果
4.2.1 不同苎麻品种中骨,茎尖,皮,叶部位的表达
4.3 讨论
第5章 苎麻花发育相关AP2/ERF基因的克隆与生物信息学分析
5.1 实验材料与方法
5.1.1 实验材料
5.1.2 实验仪器
5.1.3 实验方法
5.2 实验结果
5.2.1 基因克隆
5.2.2 苎麻9156基因序列
5.2.3 苎麻9156蛋白二级结构分析
5.2.4 苎麻9156聚类分析
5.2.5 苎麻9156蛋白的三维结构分析
5.3 讨论
第6章 结论与创新点
6.1 结论
6.2 创新
参考文献
缩写表
致谢
作者简介
本文编号:3683583
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