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基于SSR分子标记技术的谷子种质资源遗传多样性分析

发布时间:2022-10-09 16:23
  谷子作为我国主要的粮食和饲草作物之一,在我国农业生产中占有极其重要的地位。伴随着谷子种质资源的不断更新,新品种创育的父母本选择范围也不断缩小,给育种工作带来极大的困扰。种质资源的遗传多样性评价以及各种质之间的遗传距离的研究可为谷子新品种的选育提供重要依据。山西省是谷子的起源地之一,拥有丰富的地方品种资源,这些资源中包含着相当多的可用于种质的改良与创新的优异基因。本实验利用SSR分子标记技术,对山西省90份谷子品种进行了遗传多样性及群体遗传结构分析。实验结果如下:⑴利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,从收集来的73对SSR引物中筛选出38对条带清晰、多态性丰富、覆盖谷子全基因组的SSR引物,为进行谷子遗传多样性分析奠定了基础。⑵采用筛选出来的38对SSR引物对山西省90份谷子主要种质资源及优势品种进行遗传多样性分析,共检测到256个等位变异,平均每个位点6.7个等位变异,平均主等位变异频率为0.3854,基因多样性平均为0.7264,多态性信息含量(PIC)平均值为0.6884,表明所检测的90份谷子品种具有较高的遗传多样性。⑶利用Power Marker V3.25对38对SSR引物的扩增结果进行... 

【文章页数】:66 页

【学位级别】:硕士

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中文摘要
ABSTRACT
1 综述
    1.1 中国谷子资源概况
        1.1.1 谷子地方品种概况
        1.1.2 谷子育成品种概况
    1.2 山西省谷子种质资源概况
    1.3 谷子遗传多样性研究进展
        1.3.1 遗传多样性研究的意义与方法
        1.3.2 以表型为基础的研究
        1.3.3 以DNA分子标记为基础的研究
        1.3.4 其他重要农作物的遗传多样性分析研究
    1.4 本研究的目的与意义
2 基于SSR标记的谷子种质资源遗传多样性分析
    2.1 材料、试剂与仪器设备
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 SSR引物来源
        2.1.3 试剂及药品
        2.1.4 主要仪器设备
    2.2 实验步骤
        2.2.1 试剂配制
        2.2.2 基因组DNA提取
        2.2.3 引物筛选
        2.2.4 产物扩增
        2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳
        2.2.6 电泳结果校正
    2.3 数据整理
        2.3.1 数据处理
        2.3.2 数据分析
    2.4 结果与分析
        2.4.1 基因组DNA提取结果
        2.4.2 引物筛选结果
        2.4.3 遗传多样性分析
        2.4.4 聚类分析
        2.4.5 群体结构分析
3 基于形态学标记的谷子种质资源遗传多样性分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 材料来源
        3.1.2 田间种植与农艺性状调查
    3.2 数据整理
        3.2.1 质量性状赋值
        3.2.2 数量性状类型划分
        3.2.3 遗传多样性指数计算
        3.2.4 形态学性状间的相关性分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 遗传多样性分析
        3.3.2 各农艺性状相关性分析
4 讨论
    4.1 谷子多样性评价
    4.2 谷子群体结构及聚类分析
    4.3 谷子新品种培育
5 结论
    5.1 谷子多样性分析方法
    5.2 山西省90份谷子的遗传多样性评价
    5.3 山西省90份谷子的聚类情况及群体结构
参考文献
致谢
个人简历


【参考文献】:
期刊论文
[1]中国71个谷子种质资源的灰色关联度分析及综合评价[J]. 贾小平,袁玺垒,陆平,范丙友,黄华,戴凌峰.  种子. 2017(09)
[2]谷子核心种质表型遗传多样性分析及综合评价[J]. 王海岗,贾冠清,智慧,温琪汾,董俊丽,陈凌,王君杰,曹晓宁,刘思辰,王纶,乔治军,刁现民.  作物学报. 2016(01)
[3]110份普通玉米自交系的SSR聚类分析[J]. 谷静丛,王冲,王国琴,王鹏文.  华北农学报. 2014(06)
[4]紫花苜蓿多元杂交后代形态学特征及变异分析[J]. 王虹,师尚礼,刘正璟.  草原与草坪. 2014(05)
[5]谷子主要农艺性状的分析[J]. 刘斌,李书田,王显瑞,柴晓娇.  种子. 2014(05)
[6]山西省黍子产业现状及发展对策[J]. 杨如达,杨富,李海,林凤仙.  农业科技通讯. 2014(05)
[7]20个广西晾晒烟品种农艺性状聚类分析[J]. 李开和,覃剑峰,梁声侃,欧景莉,卢燕回,韦江平.  农业研究与应用. 2014(01)
[8]谷子育种方向探讨[J]. 王凯玺,张海金,张文飞,黄瑞,林玉友,陈国秋.  园艺与种苗. 2013(12)
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博士论文
[1]基于SSR、SNP和形态学标记的甘薯种质资源遗传多样性研究[D]. 杨新笋.中国农业大学 2016
[2]不同类型玉米种质分子特征分析及耐旱相关性状的连锁—连锁不平衡联合作图[D]. 卢艳丽.四川农业大学 2010

硕士论文
[1]大豆农艺性状、遗传多样性及其育种性状的关联分析[D]. 杨凯敏.山西农业大学 2015
[2]不同时期收集的农家保护云南水稻地方品种的遗传多样性比较[D]. 李金梅.中国农业科学院 2014
[3]分蘖洋葱种质资源遗传多样性的研究[D]. 金雪.东北农业大学 2013
[4]黄淮麦区小麦品种(系)产量性状的遗传多样性分析[D]. 毕惠彬.山东农业大学 2013
[5]96个玉米自交系的群体结构及其遗传多样性研究[D]. 吉琼.新疆农业大学 2012
[6]桃果实肉质、粘离核及硬度的关联分析[D]. 麻国升.中国农业科学院 2012
[7]基于加速失效时间模型的生存性状位点和基因组印记的区间定位方法[D]. 林增.黑龙江八一农垦大学 2012
[8]利用微卫星标记分析中国谷子地方品种的群体结构与遗传多样性[D]. 王春芳.河北师范大学 2011
[9]海南槟榔种质遗传多样性与槟榔黄化病发生关系研究[D]. 刘慧娟.海南大学 2010
[10]利用EST-SSR标记研究橡胶树栽培种质的遗传多样性与遗传分化[D]. 龙青姨.海南大学 2010



本文编号:3688964

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