水稻抗坏血酸氧化酶基因家族生物信息学分析

发布时间：2022-10-18 17:35

　　抗坏血酸氧化酶（ascorbic acid oxidase, AAO）是多铜氧化酶家族中的一员,在植物生长发育过程中起重要作用。为深入研究水稻AAO基因家族的功能特征及表达模式,采用生物信息学从Phytozome的水稻数据库鉴定出14个AAO成员,并对其染色体定位、蛋白理化性质及二级结构、基因结构、保守基序、系统发生树和表达模式等方面进行预测分析。结果显示,14个OsAAO不均匀地分布在8条染色体上,多为碱性蛋白;蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分;基因结构和保守基序分析表明,OsAAO内含子数目变化差异较大,但氨基酸序列具有较强的保守性;系统发生树可分为3个亚家族,OsAAOs与玉米、高粱簇在一起,亲缘关系较近;另外表达模式分析发现,OsAAO在不同的组织部位表达水平具有差异,这表明其行使功能不同。这些结果为今后研究该基因家族的生物学功能和培育耐旱品种提供理论依据。 

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 OsAAO基因家族鉴定及染色体定位分析
    1.2 OsAAO蛋白结构分析
        1.2.1 蛋白理化性质分析
        1.2.2 蛋白质二级结构分析
    1.3 OsAAO基因结构与保守基序分析
    1.4 OsAAO系统发生树分析
    1.5 OsAAO基因表达模式分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 OsAAO基因家族的搜索与鉴定
    3.2 OsAAO蛋白结构分析
    3.3 OsAAO基因结构与保守基序分析
    3.4 OsAAO基因家族系统进化分析
    3.5 OsAAO基因表达谱分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]辣椒维生素C生物合成及代谢研究进展[J]. 孟纯阳,魏小春,姚秋菊,原玉香,张晓伟.  基因组学与应用生物学. 2018(06)
[2]干旱胁迫及复水对大豆抗坏血酸-谷胱甘肽循环的影响[J]. 董守坤,马玉玲,李爽,董娜,刘丽君.  东北农业大学学报. 2018(01)
[3]植物非生物胁迫信号转导及应答[J]. 朱健康,倪建平.  中国稻米. 2016(06)
[4]枸杞抗坏血酸氧化酶基因的克隆与表达分析[J]. 乔枫,耿贵工,谢惠春,曾阳,周连玉,陈志.  四川大学学报(自然科学版). 2016(01)
[5]硅对干旱胁迫下番茄根系细胞超微结构及线粒体活性氧代谢的影响[J]. 曹逼力,刘灿玉,徐坤.  园艺学报. 2014(12)
[6]水稻AT-hook基因家族生物信息学分析[J]. 张贵慰,曾珏,郭维,罗琼.  植物学报. 2014(01)
[7]干旱胁迫对水稻叶表面蜡质积累的影响[J]. 陈红妙,谢振文,刘平,冯冰飞,陈哲,王美萍,周玲艳.  基因组学与应用生物学. 2013(06)
[8]桃果实PpAO基因的电子克隆及生物信息学分析[J]. 王可,邵兴锋,龚一富,张兴龙.  食品工业科技. 2013(17)
[9]牛ANGPTL2基因结构与功能的生物信息学分析[J]. 李芬,周佩,杨婷,陈宁博,马云.  华北农学报. 2012(01)
[10]华北地区干旱对中国主要农产品市场价格变动的影响预测[J]. 邓祥征,林英志,葛全胜,赵永宏.  资源科学. 2011(04)

博士论文
[1]干旱下氮素营养对不同穗型小麦苗期耐旱性的影响机制[D]. 王秀波.中国科学院大学(中国科学院教育部水土保持与生态环境研究中心) 2018



本文编号：3692756