野生大豆开花期位点的全基因组关联分析

发布时间：2022-12-06 01:13

　　大豆（Glycine max L.Merr.）是世界上最重要的油料兼经济作物之一,是人类植物油和植物蛋白的主要来源。随着对大豆需求量的不断增加,我国现已成为全球最大的大豆进口国,严重威胁到我国的粮食安全。因此,提高产量是大豆育种的主要目标。大豆是典型的短日照作物,对光周期十分敏感,光周期调控开花不仅影响大豆的种植适应性,同时也决定大豆的产量,所以挖掘大豆开花期关键基因,对提高大豆产量有重要的意义。栽培大豆是由其近缘祖先野生大豆（Glycine soja）驯化而来,在驯化过程中,由于长期受到人为的选择,栽培大豆产生了遗传瓶颈,严重的制约了我国乃至世界大豆育种研究和大豆产业的发展,致使在栽培大豆品种范围内的育种工作难以取得更大的进展。野生大豆中具有丰富的遗传资源,挖掘野生大豆中的开花性状新基因,对于提高大豆适应性及为提高大豆育种效率提供重要的理论依据。随着测序技术和统计模型的快速发展,全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）逐渐成为解析植物复杂性状遗传基础的重要工具。本试验以来自中国、俄罗斯、韩国和日本的353份野生大豆品种为材料,将其种植在... 

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 选题背景及意义
    1.2 大豆光周期调控开花的研究进展
        1.2.1 光周期现象
        1.2.2 大豆开花关键基因的研究进展
    1.3 野生大豆及其在栽培大豆遗传改良中的作用
    1.4 全基因组关联分析
        1.4.1 全基因组关联分析的理论基础与基本方法
        1.4.2 全基因组关联分析在大豆中的应用
        1.4.3 全基因组关联分析展望
    1.5 技术路线
第2章 材料与方法
    2.1 试验材料与数据获取
        2.1.1 试验材料
        2.1.2 田间试验设计
        2.1.3 开花期表型鉴定
        2.1.4 单核苷酸多态性(SNP)基因分型
    2.2 数据分析
        2.2.1 表型数据分析
        2.2.2 群体结构评估
        2.2.3 亲缘关系分析
        2.2.4 连锁不平衡衰减分析
        2.2.5 全基因组关联分析
        2.2.6 候选基因预测
第3章 结果与分析
    3.1 表型数据分析
    3.2 核酸质量检测分析
    3.3 测序数据统计
    3.4 群体结构分析
    3.5 亲缘关系分析
    3.6 连锁不平衡分析
    3.7 全基因组关联分析
    3.8 候选基因预测
第4章 讨论
    4.1 群体选择与花期表型
    4.2 关联分析结果
    4.3 候选基因预测
第5章 结论
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]大豆适应性的分子遗传基础[J]. 林晓雅,刘宝辉,孔凡江.  自然杂志. 2019(03)
[2]关联分析及其在植物遗传学研究中的应用[J]. 谭贤杰,吴子恺,程伟东,王天宇,黎裕.  植物学报. 2011(01)
[3]关联分析在作物种质资源分子评价中的应用[J]. 王荣焕,王天宇,黎裕.  植物遗传资源学报. 2007(03)
[4]中国野生大豆研究二十年[J]. 庄炳昌.  吉林农业科学. 1999(05)



本文编号：3710744