黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱溯源体系构建与应用
发布时间:2022-12-18 12:34
黑龙江省是我国粳稻主产区,为提升本省水稻种质资源的保护和质量追溯与管理水平,提出基于SSR分子标记和毛细管电泳技术构建黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱和溯源体系的方法,为本省粳稻品种的育种工作、品种纯度鉴定和打击假冒伪劣产品提供技术保障。通过文献调研法,并以中国农业部《水稻品种鉴定DNA指纹方法》(NY/T 1433-2007)(以下简称“国标方法”)和公共数据库www.gramene.org为标准,选择12对推荐的SSR引物,对黑龙江省(查哈阳、建三江、五常、方正和响水地区)50个主栽粳稻品种进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱的构建。利用在线条形码生成器和二维码生成软件构建品种专有的条形码图和二维码图,并构建数据库,形成水稻品种的溯源体系。主要研究成果如下:1.水稻SSR引物序列的设计:采用文献调研方法,总结了中国2007-2016年来17个省市和地区的利用SSR技术标记的3 388个水稻种质资源生物信息特点,分析我国优良SSR引物特征及研究现状。结果表明,在调研文献的354对引物中,有24对引物出现的频率高于8次,经与国标方法推荐的24对引物对比,只有RM273出现的频率较低,仅为6...
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 水稻概述
1.1.1 黑龙江省水稻生产情况
1.1.2 黑龙江省水稻安全现状分析
1.2 指纹图谱分析技术的研究现状
1.2.1 DNA指纹图谱
1.2.2 同位素指纹图谱
1.2.3 光谱指纹图谱
1.2.4 代谢指纹图谱
1.2.5 气味指纹图谱
1.3 DNA指纹图谱分析技术
1.3.1 简单重复序列标记
1.3.2 限制性内切酶片段长度多态性标记
1.3.3 扩增条带多态性标记
1.3.4 单核苷酸多态性标记
1.4 SSR标记在水稻DNA指纹图谱建立的应用
1.5 研究目的与意义
1.6 研究内容及技术路线
1.6.1 研究内容
1.6.2 技术路线
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 原料
2.1.2 试剂
2.1.3 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 水稻SSR引物序列的设计
2.2.2 水稻的遗传多样性分析
2.2.3 DNA指纹图谱的构建
2.2.4 水稻指纹数据身份证的构建
2.2.5 水稻溯源体系的建立
3 结果与分析
3.1 水稻SSR引物的选取
3.1.1 SSR分子标记在水稻种质鉴定中的应用
3.1.2 我国水稻遗传多样性分析
3.2 黑龙江省主栽粳稻遗传多样性分析
3.2.1 SSR标记多态性
3.2.2 水稻产区间的遗传相似系数与遗传距离
3.2.3 水稻品种间的聚类分析
3.3 黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱的构建
3.4 黑龙江省主栽粳稻品种身份证的构建
3.5 水稻溯源体系的构建与应用
3.5.1 体系设计的关键技术
3.5.2 溯源体系功能应用的设计
4 讨论
5 结论
5.1 水稻SSR引物序列的选取
5.2 黑龙江省主栽粳稻遗传多样性分析
5.2.1 SSR标记多态性分析
5.2.2 水稻产区间的遗传相似系数与遗传距离
5.2.3 水稻品种间的聚类分析
5.3 黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱的构建
5.4 水稻溯源体系的构建与应用
参考文献
附表
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于AFLP的茶花种质资源遗传多样性研究[J]. 杨旭,吴德智,袁伟,胡孝枝. 江苏农业科学. 2018(03)
[2]基于近红外光谱技术的黑龙江地理标志大米产地溯源研究[J]. 钱丽丽,宋雪健,张东杰,张爱武,曹冬梅,迟晓星,宋春蕾. 中国粮油学报. 2017(10)
[3]我国水稻两用核不育系SSR遗传多样性分析[J]. 张云,龙云星,奎丽梅,徐高峰,涂建,辜琼瑶,李华慧,黄平,卢义宣. 分子植物育种. 2017(07)
[4]基于SSR标记的中籼型两系杂交水稻亲本遗传差异分析[J]. 徐世龙,严天泽,钟日超,秦鹏,王凯,杨远柱. 杂交水稻. 2017(03)
[5]分子标记在油菜遗传多样性和杂种优势预测中的应用[J]. 拉目吉. 种子世界. 2017(02)
[6]湖北省水稻区试两系不育系指纹图谱构建及遗传相似性分析[J]. 蔡海亚,谢红卫,周雷,焦春海,游艾青,徐得泽. 分子植物育种. 2016(09)
[7]我国水稻分子育种研究进展[J]. 朱义旺,林雅容,陈亮. 厦门大学学报(自然科学版). 2016(05)
[8]利用SSR标记构建水稻核心亲本指纹图谱[J]. 曾晓珊,彭丹,石媛媛,谢伟,刘爱民. 作物研究. 2016(05)
[9]黑龙江省水稻发展现状及其可持续发展性[J]. 徐德海. 中国种业. 2016(09)
[10]黑龙江省审定水稻品种分子ID的构建[J]. 张文涛,王敬国,刘化龙,孙健,郭丽颖,赵宏伟,邹德堂. 分子植物育种. 2016(08)
博士论文
[1]银杏种质资源遗传多样性的AFLP研究[D]. 王利.山东农业大学 2006
[2]基于AFLP和SSR分子标记的中国杨梅遗传多样性分析[D]. 张水明.浙江大学 2009
硕士论文
[1]水稻生产全程监测与可追溯物联网平台[D]. 张恒维.吉林农业大学 2017
[2]利用cDNA-AFLP技术分离玉米盐胁迫响应相关基因[D]. 王婧泽.黑龙江八一农垦大学 2016
[3]北方粳稻DNA指纹图谱的构建[D]. 李溪盛.哈尔滨工业大学 2014
[4]用碳氮稳定同位素对大米产地溯源的研究[D]. 钟敏.大连海事大学 2013
[5]黑龙江省水稻生产区域优势研究[D]. 寇佳琪.东北农业大学 2013
[6]浙江省水稻品种DNA指纹数据库的初步构建及其应用研究[D]. 程本义.中国农业科学院 2009
[7]近红外光谱技术在茶叶鉴别中的应用研究[D]. 廖步岩.安徽农业大学 2009
[8]几种中药荧光性质的研究及中药三维荧光指纹图谱数据库的构建[D]. 史训立.河北师范大学 2006
[9]中国啤酒大麦品种RAPD、SSR标记的遗传多样性分析[D]. 张大乐.河南大学 2005
本文编号:3722064
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 水稻概述
1.1.1 黑龙江省水稻生产情况
1.1.2 黑龙江省水稻安全现状分析
1.2 指纹图谱分析技术的研究现状
1.2.1 DNA指纹图谱
1.2.2 同位素指纹图谱
1.2.3 光谱指纹图谱
1.2.4 代谢指纹图谱
1.2.5 气味指纹图谱
1.3 DNA指纹图谱分析技术
1.3.1 简单重复序列标记
1.3.2 限制性内切酶片段长度多态性标记
1.3.3 扩增条带多态性标记
1.3.4 单核苷酸多态性标记
1.4 SSR标记在水稻DNA指纹图谱建立的应用
1.5 研究目的与意义
1.6 研究内容及技术路线
1.6.1 研究内容
1.6.2 技术路线
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 原料
2.1.2 试剂
2.1.3 主要仪器设备
2.2 试验方法
2.2.1 水稻SSR引物序列的设计
2.2.2 水稻的遗传多样性分析
2.2.3 DNA指纹图谱的构建
2.2.4 水稻指纹数据身份证的构建
2.2.5 水稻溯源体系的建立
3 结果与分析
3.1 水稻SSR引物的选取
3.1.1 SSR分子标记在水稻种质鉴定中的应用
3.1.2 我国水稻遗传多样性分析
3.2 黑龙江省主栽粳稻遗传多样性分析
3.2.1 SSR标记多态性
3.2.2 水稻产区间的遗传相似系数与遗传距离
3.2.3 水稻品种间的聚类分析
3.3 黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱的构建
3.4 黑龙江省主栽粳稻品种身份证的构建
3.5 水稻溯源体系的构建与应用
3.5.1 体系设计的关键技术
3.5.2 溯源体系功能应用的设计
4 讨论
5 结论
5.1 水稻SSR引物序列的选取
5.2 黑龙江省主栽粳稻遗传多样性分析
5.2.1 SSR标记多态性分析
5.2.2 水稻产区间的遗传相似系数与遗传距离
5.2.3 水稻品种间的聚类分析
5.3 黑龙江省主栽粳稻DNA指纹图谱的构建
5.4 水稻溯源体系的构建与应用
参考文献
附表
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于AFLP的茶花种质资源遗传多样性研究[J]. 杨旭,吴德智,袁伟,胡孝枝. 江苏农业科学. 2018(03)
[2]基于近红外光谱技术的黑龙江地理标志大米产地溯源研究[J]. 钱丽丽,宋雪健,张东杰,张爱武,曹冬梅,迟晓星,宋春蕾. 中国粮油学报. 2017(10)
[3]我国水稻两用核不育系SSR遗传多样性分析[J]. 张云,龙云星,奎丽梅,徐高峰,涂建,辜琼瑶,李华慧,黄平,卢义宣. 分子植物育种. 2017(07)
[4]基于SSR标记的中籼型两系杂交水稻亲本遗传差异分析[J]. 徐世龙,严天泽,钟日超,秦鹏,王凯,杨远柱. 杂交水稻. 2017(03)
[5]分子标记在油菜遗传多样性和杂种优势预测中的应用[J]. 拉目吉. 种子世界. 2017(02)
[6]湖北省水稻区试两系不育系指纹图谱构建及遗传相似性分析[J]. 蔡海亚,谢红卫,周雷,焦春海,游艾青,徐得泽. 分子植物育种. 2016(09)
[7]我国水稻分子育种研究进展[J]. 朱义旺,林雅容,陈亮. 厦门大学学报(自然科学版). 2016(05)
[8]利用SSR标记构建水稻核心亲本指纹图谱[J]. 曾晓珊,彭丹,石媛媛,谢伟,刘爱民. 作物研究. 2016(05)
[9]黑龙江省水稻发展现状及其可持续发展性[J]. 徐德海. 中国种业. 2016(09)
[10]黑龙江省审定水稻品种分子ID的构建[J]. 张文涛,王敬国,刘化龙,孙健,郭丽颖,赵宏伟,邹德堂. 分子植物育种. 2016(08)
博士论文
[1]银杏种质资源遗传多样性的AFLP研究[D]. 王利.山东农业大学 2006
[2]基于AFLP和SSR分子标记的中国杨梅遗传多样性分析[D]. 张水明.浙江大学 2009
硕士论文
[1]水稻生产全程监测与可追溯物联网平台[D]. 张恒维.吉林农业大学 2017
[2]利用cDNA-AFLP技术分离玉米盐胁迫响应相关基因[D]. 王婧泽.黑龙江八一农垦大学 2016
[3]北方粳稻DNA指纹图谱的构建[D]. 李溪盛.哈尔滨工业大学 2014
[4]用碳氮稳定同位素对大米产地溯源的研究[D]. 钟敏.大连海事大学 2013
[5]黑龙江省水稻生产区域优势研究[D]. 寇佳琪.东北农业大学 2013
[6]浙江省水稻品种DNA指纹数据库的初步构建及其应用研究[D]. 程本义.中国农业科学院 2009
[7]近红外光谱技术在茶叶鉴别中的应用研究[D]. 廖步岩.安徽农业大学 2009
[8]几种中药荧光性质的研究及中药三维荧光指纹图谱数据库的构建[D]. 史训立.河北师范大学 2006
[9]中国啤酒大麦品种RAPD、SSR标记的遗传多样性分析[D]. 张大乐.河南大学 2005
本文编号:3722064
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3722064.html
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