基于叶绿体基因组序列的小麦族系统发育分析
发布时间:2022-12-22 04:11
普通小麦(Triticum aestivum L.)是全球主要粮食作物之一,小麦种质资源的更新是培育小麦品种的重要保障。研究小麦族的系统发育关系,对丰富小麦种质资源、揭示亲缘关系、利用优异基因方面都具有重要的意义。叶绿体作为植物细胞器的重要组成部分和光合作用的场所,在生物进化的过程中发挥了重要作用。研究小麦族叶绿体基因组结构和序列的信息在揭示物种起源、进化演变以及物种之间的亲缘关系等方面具有重要价值。本研究完成了8个叶绿体DNA提取、测序、拼接组装,并对8个叶绿体基因组进行了基因注释、物理图谱构建、SSR标记和重复序列检测。另外,利用8个拼接组装的叶绿体基因组序列和26个已完成测序的叶绿体基因组序列,进行了差异热点区检测、比较基因组分析、系统发育树构建和分化时间计算。具体结果如下:(1)通过对栽培二粒小麦(Triticum dicoccum)等8个小麦族物种叶绿体基因组进行解析发现,拼接组装后的叶绿体基因组大小在113449 bp和136041 bp之间,最小为尾状山羊草(Aegilops caudata),最大为阿拉拉特小麦(Triticum araraticum);注释基因数目最少...
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
小麦属进化示意图
CGAP框架图
小麦(Triticumaestivum)叶绿体基因组结构图
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
[2]小麦叶绿体DNA提取方法研究[J]. 侯典云,马占强,徐虹,郭蔼光. 河南农业科学. 2011(10)
[3]小麦的起源、进化与中国小麦遗传资源[J]. 曹亚萍. 小麦研究. 2008(03)
[4]小麦的起源、进化与中国小麦遗传资源[J]. 曹亚萍. 小麦研究. 2008 (03)
[5]穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣psbA-trnH片段序列分析[J]. 孙华钦,罗科,邹文俊,邓思杨. 应用与环境生物学报. 2006(06)
[6]叶绿体基因infA-rpl36区域在小麦族物种中的序列变异分析[J]. 刘畅,杨足君,李光蓉,冯娟,邓科君,黄健,任正隆. 遗传. 2006(10)
[7]甜菜ATP合酶β亚基基因atpB的克隆、序列分析及进化[J]. 崔杰,徐德昌,李滨胜,杨谦,孙璟晗. 植物研究. 2006(05)
[8]用叶绿体rbcL和rps4-trnS区序列确定亚洲特有单型属——篦齿蕨属的系统位置[J]. 陆树刚,李春香. 植物分类学报. 2006(05)
[9]四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用[J]. 杨俊波,李洪涛,杨世雄,李德铢,杨莹燕. 云南植物研究. 2006(02)
[10]基于ITS序列和trnL-F序列探讨小叶锦鸡儿、中间锦鸡儿和柠条锦鸡儿的种间关系[J]. 侯鑫,刘俊娥,赵一之,赵利清. 植物分类学报. 2006(02)
硕士论文
[1]基于第二代高通量测序的荷花玉兰叶绿体全基因组研究[D]. 高欢欢.湖北中医药大学 2013
[2]蜡梅科叶绿体基因组进化及被子植物高变叶绿体基因标记开发与应用[D]. 董文攀.东北林业大学 2012
[3]基于atpB-rbcL基因序列及茎的解剖结构特征对蓼科部分属间关系的研究[D]. 刘明珍.安徽大学 2007
本文编号:3723425
【文章页数】:68 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
小麦属进化示意图
CGAP框架图
小麦(Triticumaestivum)叶绿体基因组结构图
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究[J]. 李西文,胡志刚,林小涵,李卿,高欢欢,罗国安,陈士林. 药学学报. 2012(01)
[2]小麦叶绿体DNA提取方法研究[J]. 侯典云,马占强,徐虹,郭蔼光. 河南农业科学. 2011(10)
[3]小麦的起源、进化与中国小麦遗传资源[J]. 曹亚萍. 小麦研究. 2008(03)
[4]小麦的起源、进化与中国小麦遗传资源[J]. 曹亚萍. 小麦研究. 2008 (03)
[5]穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣psbA-trnH片段序列分析[J]. 孙华钦,罗科,邹文俊,邓思杨. 应用与环境生物学报. 2006(06)
[6]叶绿体基因infA-rpl36区域在小麦族物种中的序列变异分析[J]. 刘畅,杨足君,李光蓉,冯娟,邓科君,黄健,任正隆. 遗传. 2006(10)
[7]甜菜ATP合酶β亚基基因atpB的克隆、序列分析及进化[J]. 崔杰,徐德昌,李滨胜,杨谦,孙璟晗. 植物研究. 2006(05)
[8]用叶绿体rbcL和rps4-trnS区序列确定亚洲特有单型属——篦齿蕨属的系统位置[J]. 陆树刚,李春香. 植物分类学报. 2006(05)
[9]四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用[J]. 杨俊波,李洪涛,杨世雄,李德铢,杨莹燕. 云南植物研究. 2006(02)
[10]基于ITS序列和trnL-F序列探讨小叶锦鸡儿、中间锦鸡儿和柠条锦鸡儿的种间关系[J]. 侯鑫,刘俊娥,赵一之,赵利清. 植物分类学报. 2006(02)
硕士论文
[1]基于第二代高通量测序的荷花玉兰叶绿体全基因组研究[D]. 高欢欢.湖北中医药大学 2013
[2]蜡梅科叶绿体基因组进化及被子植物高变叶绿体基因标记开发与应用[D]. 董文攀.东北林业大学 2012
[3]基于atpB-rbcL基因序列及茎的解剖结构特征对蓼科部分属间关系的研究[D]. 刘明珍.安徽大学 2007
本文编号:3723425
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3723425.html
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