一个小麦中水稻根系直系同源基因的分子鉴定及表达分析

发布时间：2023-03-05 14:44

　　【目的】分析水稻中OsRAA1在小麦中的同源基因TaRAA1的结构、进化、启动子调控区域、组织特异性表达以及非生物胁迫表达等,初步探索其在小麦中的生物学功能,为进一步遗传转化研究其功能提供指导。【方法】利用在线数据库获得TaRAA1的基因编码序列和蛋白结构,进一步分析其进化和表达模式,最后在"中国春"中进行RT-qPCR验证该基因的组织特异性表达以及非生物胁迫表达。【结果】TaRAA1被定位到小麦第三同源染色体(3A、3B和3D),在所有分析物种中均无内含子,其基因结构具有高度保守性。在所研究的物种中除在水稻中检测到一个低复杂区域外,其他物种中均未检测到任何功能域。组织特异性表达分析表明,TaRAA1基因主要在小麦的根部大量表达。公共数据库和RT-qPCR分析结果都表明小麦TaRAA1在高温、高盐、干旱处理下,表达量受到正向调控;而在低温和PEG处理下,表达受到负向调控。【结论】TaRAA1基因可能在小麦受到非生物逆境胁迫时发挥着重要作用。

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料与处理
    1.2 基因与氨基酸序列获取
    1.3 Ta RAA1基因的染色体定位分析
    1.4 同源基因序列比对和系统发育分析
    1.5 核苷酸结构和蛋白质结构分析
    1.6 启动子中的顺式作用元件分析和转录因子结合位点预测
    1.7 表达模式分析
    1.8 RNA的提取及c DNA第一链的合成
    1.9 引物设计与RT-q PCR分析
2 结果与分析
    2.1 Ta RAA1基因的染色体定位
    2.2 RAA1基因结构
    2.3 蛋白质结构与系统发育分析
    2.4 启动子分析
    2.5 中国春小麦的Ta RAA1基因对胁迫的响应
3 讨论与结论



本文编号：3756388